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引用CPTAC化验门户时，请包括以下声明
我们感谢美国国家癌症研究所临床蛋白质组肿瘤分析联盟（CPTAC）分析门户网站（assesss.Cancer.gov）用于开发测定并建立本出版物中描述的测定的标准。

非典

上次化验 下一步化验
可用分析

概述数据来源：UniProt

官方基因符号 其他别名
非典 SERS公司
序列长度（AA） 分子量（Da）
514 58777
蛋白质名称
丝氨酸-tRNA连接酶，细胞质
来源
UniProt公司
磷化SitePlus®
基因卡 		人类蛋白质阿特拉斯

蛋白质序列悬停以查看完整序列

10 20 30 40 50
MVLDLDLFRV公司 DKGGDPALIR公司 ETQEKRFKDP公司 GLVDQLVKAD公司 SEWRRCRFRA公司
60 70 80 90 100
DNLNKLKNLC公司 SKTIGEKMKK公司 KEPVGDESV公司 PENVLSFDDL公司 塔达朗克
110 120 130 140 150
斯奇克夫利 死亡科 RIKLEAERFE公司 荷兰 PSVPISNDED公司
160 170 180 190 200
VDNKVERIWG公司 DCTVRKYSH公司 VDLVVMVDGF EGEKGAVVAG公司 SRGYFLKGVL公司
210 220 230 240 250
VFLEQALIQY公司 ALRTLGSRGY公司 IPIYTPFMR项目 KEVMQEVAQL公司 SQF德雷KV
260 270 280 290 300
IGKGSEKSDD公司 NSYDEKYLIA公司 TSEQPIAALH公司 R（右）D类E类W公司L（左）R（右）P（P）E类D类L（左） P（P）我K（K）YAGLSTC公司
310 320 330 340 350
FRQEVGSHGR公司 DTRGIFRVHQ公司 FEKIEQFVYS公司 SPHDNKSWEM公司 FEEMITTAEE公司
360 370 380 390 400
财年QSLGIPYH IVNIVSGSLN公司 哈斯克尔 AWFPGSGAFR公司 E类L（左）V（V）S公司CS公司N个CT型D类
410 420 430 440 450
Y（Y）问A类R（右）RLRIRY公司 总金额 EFVHMLNATM公司 卡特里卡伊 LENYQTEKGI公司
460 470 480 490 500
TVPEKLKEFM公司 PPGLQELIPF公司 VKPAPIEQEP公司 SKKQKKQHEG公司 SKKKAARDV公司
510 514
特伦尔QNME VTDA公司

数据来源：UniProt

蛋白质图谱 折叠蛋白图

靶向肽分析物相对于SNP、异构体和PTM的位置

Uniprot公司数据库登录 磷网站+®

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查看下面的详细化验信息
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磷酸化 乙酰化 泛素化 其他

加载

装载机

CPTAC-438的含量测定细节 折叠分析详细信息

数据来源：全景

官方基因符号
非典
肽顺序
DEWLRPEDLPIK公司
修改类型
未修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
不适用
肽开始
282
肽末端
293
CPTAC标识
CPTAC-438型
肽分子质量
1,509.7827
物种
人类 智者 （人类）
分析类型
直接MRM
矩阵
细胞系裂解液池
提交实验室
布罗德研究所和FHCRC
提交实验室PI
史提夫卡爾

出版物

查看详细信息 （在新窗口中打开）

证明大规模开发标准化分析以量化人类蛋白质的可行性。Kennedy JJ、Abbatiello SE、Kim K、Yan P、Whiteaker JR、Lin C、Kim JS、Zhang Y、Wang X、Ivey RG、Zhao L、Min H、Lee Y、Yu MH、Yang EG、Lee C、Wang P、Rodriguez H、Kim Y、Carr SA、Paulovich AG。Nat方法2014年2月；11(2):149-55. doi:10.1038/nmeth.2763。Epub 2013年12月8日。PMID:24317253

Broad Institute获得的响应曲线。弗雷德·哈钦森癌症研究中心获得的重复性数据。

Broad Institute获得的响应曲线。弗雷德·哈钦森癌症研究中心获得的重复性数据。

分析参数 折叠分析参数

数据来源：全景

仪器
5500个QTRAP（ABSCIEX）
内部标准
肽
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
13摄氏度，15牛顿度
信用证
nanoLC-Ultra 2D，cHiPLC-nanoflex（Eksigent）
色谱柱填料
ChromXP C18-CL，3微米，120A
立柱尺寸
150 x 0.075毫米
流速
500 nL/分钟

色谱图

数据来源：全景

放大视图形象
放大视图形象
放大视图形象

响应曲线

数据来源：全景

放大视图形象
放大视图形象
看法放大图像

检索数据

装载机

可重复性

数据来源：全景

放大视图形象
  平均内部CV
（CV日内）		 平均层间CV
（日间CV）		 总CV
方程式		 n个=
碎片/过渡 低 医学 高 低 医学 高 低 医学 高 低 医学 高
7岁（1+） 16.9 36.9 21.2 35.6 46.2 33.3 39.4 59.1 39.5 15 25 15
y10（2+） 7.2 6.2 9.4 25.6 14 11 26.6 15.3 14.5 15 25 15
7岁（2+） 31.9 26.8 30.4 43.6 30.5 46.9 54 40.6 55.9 15 25 15
总和 7.9 6.1 9.3 25.3 14.7 9.6 26.5 15.9 13.4 15 25 15

其他资源和评论

资源
下载SOP
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评论

CPTAC-439的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源：全景

官方基因符号
非典
肽修饰顺序
ELVSC[+57.0]SNC[+570]TDYQAR（ELVSC+57.0]SNC+57.0）
修改类型
氨基甲基半胱氨酸
蛋白质-修饰位点
395, 398
肽-修饰位点
5, 8
肽开始
391
肽末端
404
CPTAC标识
CPTAC-439型
肽分子质量
1,701.7087
物种
人类 智者 （人类）
分析类型
直接MRM
矩阵
细胞系裂解液池
提交实验室
布罗德研究所和FHCRC
提交实验室PI
史提夫卡爾

出版物

查看详细信息 （在新窗口中打开）

证明大规模开发标准化分析以量化人类蛋白质的可行性。Kennedy JJ、Abbatiello SE、Kim K、Yan P、Whiteaker JR、Lin C、Kim JS、Zhang Y、Wang X、Ivey RG、Zhao L、Min H、Lee Y、Yu MH、Yang EG、Lee C、Wang P、Rodriguez H、Kim Y、Carr SA、Paulovich AG。Nat方法2014年2月；11(2):149-55. doi:10.1038/nmeth.2763。Epub 2013年12月8日。PMID:24317253

Broad Institute获得的响应曲线。弗雷德·哈钦森癌症研究中心获得的重复性数据。

Broad Institute获得的响应曲线。弗雷德·哈钦森癌症研究中心获得的重复性数据。

分析参数 折叠分析参数

数据来源：全景

仪器
5500个QTRAP（ABSCIEX）
内部标准
肽
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
13摄氏度，15牛顿度
信用证
nanoLC超2D，cHiPLC纳米柔性（Eksigent）
色谱柱填料
ChromXP C18-CL，3微米，120A
立柱尺寸
150 x 0.075毫米
流速
500 nL/分钟

色谱图

数据来源：全景

放大视图形象
放大视图形象
放大视图形象

响应曲线

数据来源：全景

放大视图形象
放大视图形象
看法放大图像

检索数据

装载机

可重复性

数据来源：全景

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  平均内部CV
（CV日内）		 平均层间CV
（日间CV）		 总CV
方程式		 n个=
碎片/过渡 低 医学 高 低 医学 高 低 医学 高 低 医学 高
9岁（1+） 6.1 10.8 15 11.4 9.8 7.5 12.9 14.6 16.8 15 25 15
8岁（1+） 9 13.3 15.6 12.6 14.4 18 15.5 19.6 23.8 15 25 15
7岁（1+） 12.4 11.6 8.9 12.9 11.8 15.5 17.9 16.5 17.9 15 25 15
总和 5.7 9.5 9.5 9.4 9.6 8.6 11 13.5 12.8 15 25 15

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