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引用CPTAC分析门户时,请包括以下声明
我们要感谢美国国家癌症研究所的临床蛋白质组肿瘤分析联盟(CPTAC)检测门户网站(assays.cance.gov)用于开发分析并建立本出版物中所述分析的标准。

概述数据来源:UniProt

官方基因符号 其他别名
MANF公司 ARMET、ARP
序列长度(AA) 分子量(Da)
182 20700
蛋白质名称
中脑星形胶质细胞衍生神经营养因子
来源
UniProt公司
磷化SitePlus®
基因卡
人类蛋白质阿特拉斯

蛋白质序列悬停以查看完整序列

10 20 30 40 50
MRRMWATQGL公司 AVALALSVLP公司 GSRALRPGDC公司 EVCISYLGRF公司 YQDLKDRDVT公司
60 70 80 90 100
FSPATIENEL公司 IKFCREARGK公司 ENR公司L(左)C类Y(Y)Y(Y)G公司一个 T型D类D类一个一个T型K(K)国际投资编号 EVSKPLAHHI公司
110 120 130 140 150
PVEKICEKLK公司 KKDSQICELK公司 YDKQIDLSTV公司 DLKKLRVKEL公司 KK公司L(左)D类D类W公司G公司E类T型
160 170 180 182
C类K(K)GCAEKSDY公司 IRKINELMPK公司 亚普卡萨特 DL公司

数据来源:UniProt


蛋白质图谱 折叠蛋白图

靶向肽分析物相对于SNP、异构体和PTM的位置

Uniprot公司数据库登录 磷网站+®

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磷酸化 乙酰化 泛素化 其他

加载

装载机

CPTAC-404的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
MANF公司
肽修饰顺序
ILDDWGETC[+57.0]K
修改类型
氨基甲基半胱氨酸
蛋白质-修饰位点
151
肽-修饰位点
9
肽开始
143
肽末端
152
CPTAC标识
CPTAC-404型
肽分子质量
1,235.5492
物种
人类 智者 (人类)
分析类型
直接MRM
矩阵
细胞系裂解液池
提交实验室
布罗德研究所和FHCRC
提交实验室PI
史提夫卡爾

出版物

查看详细信息 (在新窗口中打开)

证明大规模开发标准化分析以量化人类蛋白质的可行性。Kennedy JJ、Abbatiello SE、Kim K、Yan P、Whiteaker JR、Lin C、Kim JS、Zhang Y、Wang X、Ivey RG、Zhao L、Min H、Lee Y、Yu MH、Yang EG、Lee C、Wang P、Rodriguez H、Kim Y、Carr SA、Paulovich AG。Nat方法2014年2月;11(2):149-55. doi:10.1038/nmeth.2763。Epub 2013年12月8日。PMID:24317253


Broad Institute获得的响应曲线。弗雷德·哈钦森癌症研究中心获得的重复性数据。


Broad Institute获得的响应曲线。弗雷德·哈钦森癌症研究中心获得的重复性数据。


分析参数 塌陷分析参数

数据来源:全景

仪器
5500个QTRAP(ABSCIEX)
内部标准
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
13摄氏度,15牛顿度
信用证
nanoLC-Ultra 2D,cHiPLC-nanoflex(Eksigent)
色谱柱填料
ChromXP C18-CL,3微米,120A
立柱尺寸
150 x 0.075毫米
流量
500 nL/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
8岁(1+) 6.9 35.8 5.1 9.1 59.5 8.2 11.4 69.4 9.7 25 15 15
7岁(1+) 11.4 32 7.7 15.3 32.2 20.3 19.1 45.4 21.7 25 15 15
y6(1+) 8.2 29.7 7.6 11.1 42.2 8.7 13.8 51.6 11.6 25 15 15
总和 7.2 32.5 4.4 8.6 48.8 8.9 11.2 58.6 9.9 25 15 15


其他资源和评论

评论

CPTAC-403的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
MANF公司
肽修饰顺序
信用证[+57.0]年月日
修改类型
氨基甲基半胱氨酸
蛋白质-修饰位点
75
肽-修饰位点
2
肽开始
74
肽末端
87
CPTAC标识
CPTAC-403型
肽分子质量
1,560.7130
物种
人类 智者 (人类)
分析类型
直接MRM
矩阵
细胞系裂解液池
提交实验室
布罗德研究所和FHCRC
提交实验室PI
史提夫卡爾

出版物

查看详细信息 (在新窗口中打开)

证明大规模开发标准化分析以量化人类蛋白质的可行性。Kennedy JJ、Abbatiello SE、Kim K、Yan P、Whiteaker JR、Lin C、Kim JS、Zhang Y、Wang X、Ivey RG、Zhao L、Min H、Lee Y、Yu MH、Yang EG、Lee C、Wang P、Rodriguez H、Kim Y、Carr SA、Paulovich AG。Nat方法2014年2月;11(2):149-55. doi:10.1038/nmeth.2763。Epub 2013年12月8日。PMID:24317253


Broad Institute获得的响应曲线。弗雷德·哈钦森癌症研究中心获得的重复性数据。


Broad Institute获得的响应曲线。弗雷德·哈钦森癌症研究中心获得的重复性数据。


分析参数 塌陷分析参数

数据来源:全景

仪器
5500个QTRAP(ABSCIEX)
内部标准
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
13摄氏度,15牛顿度
信用证
nanoLC-Ultra 2D,cHiPLC-nanoflex(Eksigent)
色谱柱填料
ChromXP C18-CL,3微米,120A
立柱尺寸
150 x 0.075毫米
流量
500 nL/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
y11(1+) 9.5 14.6 6.6 18.3 17.2 15.9 20.6 22.6 17.2 15 25 15
y10(1+) 12.7 11.1 9.7 16.1 13.4 12 20.5 17.4 15.4 15 25 15
9岁(1+) 8.8 8.8 6.5 10.6 10.6 6.9 13.8 13.8 9.5 15 25 15
总和 6.9 9.4 5.9 7.8 11 7.7 10.4 14.5 9.7 15 25 15


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