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引用CPTAC分析门户时,请包括以下声明
我们感谢美国国家癌症研究所临床蛋白质组肿瘤分析联盟(CPTAC)分析门户网站(assesss.Cancer.gov)用于开发分析并建立本出版物中所述分析的标准。

概述数据来源:UniProt

官方基因符号 其他别名
5亿基弗 KNS、KNS1
序列长度(AA) 分子量(Da)
963 109685
蛋白质名称
Kinesin-1重链
来源
UniProt公司
磷化SitePlus®
基因卡
人类蛋白质阿特拉斯

蛋白质序列悬停以查看完整序列

10 20 30 40 50
马德莱尼克 VMCRFRPLNE公司 SEVNRGDKYI公司 AKFQGEDTVV公司 IASKPYAFDR公司
60 70 80 90 100
VFQSSTSQEQ公司 VYNDCAKKIV公司 KDVLEGYNGT公司 IFAYGQTSSG公司 KTHTMEGKLH公司
110 120 130 140 150
DPEGMGIIPR公司 IVQDIFNYY公司 SMDENLEFHI公司 KVSYFEIYLD公司 KIRDLLDVSK公司
160 170 180 190 200
TNLSVHEDKN公司 RVPYVKGCTE公司 RFVCSPDEVM公司 DTIDEGKSNR公司 暖通空调
210 220 230 240 250
ssrshsifi公司 NVKQENTQTE公司 QKLSGKLYLV公司 DLAGSEKVSK公司 TGAEGAVLDE公司
260 270 280 290 300
阿肯色州 LGNVISALAE公司 GSTYVPYRDS公司 KMTRILQDSL公司 GGNCRTTIVI公司
310 320 330 340 350
CCSPSSYNES公司 ETKSTLLFGQ公司 RAKTIKNTVC公司 VNVELTAEQW公司 KKKYEKEKEK公司
360 370 380 390 400
NKILRNTIQW公司 伦纳尔(LENELNRWRN) GETVPIDEQF公司 DKEKANLEAF公司 TVDKDITLTN公司
410 420 430 440 450
DKPATAIGVI公司 GNFTDAERRK公司 CEEEIAKLYK公司 QLDDKDEEIN公司 QQSQLVEKLK公司
460 470 480 490 500
TQMLDQEELL公司 ASTRRDQDNM公司 QAELNRLQAE公司 NDASKEEVKE公司 VLQALEELAV公司
510 520 530 540 550
NYDQKSQEVE公司 DKTKEYELLS公司 DELNQK公司A类T型L(左) A类D类A类E类L(左)K(K)L(左) KEMTNHQKKR公司
560 570 580 590 600
AAEMMASLLK公司 DLAEIGIAVG公司 NNDVKQPEGT公司 格米迪夫特瓦 RLYISKMKSE公司
610 620 630 640 650
VKTMVKRCKQ公司 LESTQTESK公司 科米内凯拉 ACQLRISQHE公司 AKIKSLTEYL公司
660 670 680 690 700
QNVEQKKRQL公司 EESVDALSEE公司 LVQLRAQEKV型 HEMEKEHLNK公司 VQTANEVKQA公司
710 720 730 740 750
VEQQIQSHRE公司 THQKQISSLR公司 DEVEAKAKLI公司 TDLQDQNQKM公司 MLEQERLRVE公司
760 770 780 790 800
HEKLKATDQE公司 KSRKLHEL电视 MQDRREQARQ(MQDRREQUARQ) DLKGLEETVA公司 KELQTLHNLR公司
810 820 830 840 850
K(K)L(左)F类D类L(左)A类T型R(右) VKKSAEIDSD公司 DTGGSAAQKQ公司 基斯芬尼 QLTKVHKQLV公司
860 870 880 890 900
RDNADLRCEL公司 PKLEKRLRAT公司 AERVKALESA公司 LKEAKENASR公司 DRKRYQQEVD公司
910 920 930 940 950
RIKEAVRSKN公司 马尔格萨基 AKPIRPGQHP公司 原子吸收光谱法 RGGGAFVQNS公司
960 963
QPVAVRGGG公司 KQV公司

数据来源:UniProt


蛋白质图谱 折叠蛋白图

靶向肽分析物相对于SNP、异构体和PTM的位置

Uniprot公司数据库登录 磷网站+®

单击节点上的点
查看下面的详细分析信息
所有其他点链接到 UniProt公司



磷酸化 乙酰化 泛素化 其他

加载

装载机

CPTAC-398的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
KIF5B系列
顺序
LFVQDLATR公司
修改类型
未修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
不适用
肽开始
802
肽末端
810
CPTAC标识
CPTAC-398型
肽分子质量
1,061.5869
物种
人类 智人 (人类)
分析类型
直接MRM
矩阵
细胞系裂解液池
提交实验室
布罗德研究所和FHCRC
提交实验室PI
史提夫卡爾

出版物

查看详细信息 (在新窗口中打开)

证明大规模开发标准化检测方法以量化人类蛋白质的可行性。Kennedy JJ、Abbatiello SE、Kim K、Yan P、Whiteaker JR、Lin C、Kim JS、Zhang Y、Wang X、Ivey RG、Zhao L、Min H、Lee Y、Yu MH、Yang EG、Lee C、Wang P、Rodriguez H、Kim Y、Carr SA、Paulovich AG。Nat方法2014年2月;11(2):149-55. doi:10.1038/nmeth.2763。Epub 2013年12月8日。PMID:24317253


Broad Institute获得的响应曲线。弗雷德·哈钦森癌症研究中心获得的重复性数据。


Broad Institute获得的响应曲线。弗雷德·哈钦森癌症研究中心获得的重复性数据。


分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
5500个QTRAP(ABSCIEX)
内部标准
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
13摄氏度,15牛顿度
信用证
nanoLC-Ultra 2D,cHiPLC-nanoflex(Eksigent)
色谱柱填料
ChromXP C18-CL,3微米,120A
立柱尺寸
150 x 0.075毫米
流速
500 nL/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
7岁(1+) 15.4 16.1 11.8 33.7 39.1 30.4 37.1 42.3 32.6 15 25 15
y6(1+) 14.7 6.2 8.8 19.7 14.8 9.2 24.6 16 12.7 15 25 15
y5(1+) 16.5 7.9 14.9 21 14.5 15.8 26.7 16.5 21.7 15 25 15
总和 12.2 5.9 8.9 18.6 21.3 13.1 22.2 22.1 15.8 15 25 15


其他资源和评论

评论

CPTAC-397的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
KIF5B系列
顺序
SATLASIDAELQK公司
修改类型
未修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
不适用
肽开始
527
肽末端
539
CPTAC标识
CPTAC-397型
肽分子质量
1,345.7089
物种
人类 智者 (人类)
分析类型
直接MRM
矩阵
细胞系裂解液池
提交实验室
布罗德研究所和FHCRC
提交实验室PI
史提夫卡爾

出版物

查看详细信息 (在新窗口中打开)

证明大规模开发标准化检测方法以量化人类蛋白质的可行性。Kennedy JJ、Abbatiello SE、Kim K、Yan P、Whiteaker JR、Lin C、Kim JS、Zhang Y、Wang X、Ivey RG、Zhao L、Min H、Lee Y、Yu MH、Yang EG、Lee C、Wang P、Rodriguez H、Kim Y、Carr SA、Paulovich AG。Nat方法2014年2月;11(2):149-55. doi:10.1038/nmeth.2763。Epub 2013年12月8日。PMID:24317253


Broad Institute获得的响应曲线。弗雷德·哈钦森癌症研究中心获得的重复性数据。


Broad Institute获得的响应曲线。弗雷德·哈钦森癌症研究中心获得的重复性数据。


分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
5500个QTRAP(ABSCIEX)
内部标准
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
13摄氏度,15牛顿度
信用证
nanoLC-Ultra 2D,cHiPLC-nanoflex(Eksigent)
色谱柱填料
ChromXP C18-CL,3微米,120A
立柱尺寸
150 x 0.075毫米
流速
500 nL/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
9岁(1+) 8.1 5.7 4.8 10 7.6 10.1 12.9 9.5 11.2 15 25 15
8岁(1+) 9.2 7.2 6.4 12.2 8.7 8.8 15.3 11.3 10.9 15 25 15
y6(1+) 12.5 9.2 10.6 19.7 10 11.1 23.3 13.6 15.3 15 25 15
总和 3.1 6 4.8 8.7 7.3 7.8 9.2 9.4 9.2 15 25 15


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