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引用CPTAC分析门户时,请包括以下声明
我们感谢美国国家癌症研究所临床蛋白质组肿瘤分析联盟(CPTAC)分析门户网站(assesss.Cancer.gov)用于开发分析并建立本出版物中所述分析的标准。

概述数据来源:UniProt

官方基因符号 其他别名
白细胞介素2 FANCD1正面
序列长度(AA) 分子量(Da)
3418 384202
蛋白质名称
乳腺癌2型易感蛋白
来源
UniProt公司
磷化SitePlus®
基因卡
人类蛋白质阿特拉斯

蛋白质序列悬停以查看完整序列

10 20 30 40 50
MPIGSKERPT公司 FFEIFKTRCN公司 KADLGPISLN公司 世界粮食计划署 PYNSEPAEES公司
60 70 80 90 100
ehknnyepn公司 LFKTPQRKPS公司 YNQLASTPII公司 FKEQGLTLPL公司 YQSPVKELDK公司
110 120 130 140 150
FKLDLGRNVP公司 NSRHKS轻轨电视 KTKMDQADDV公司 SCPLLNSCLS公司 ESPVVLQCTH公司
160 170 180 190 200
VTPQRDKSVV(VTPQRDKSVV) CGSLFHTPKF公司 VKGRQTPKHI公司 SESLGAEVDP公司 DMSWSSLAT公司
210 220 230 240 250
PPTLSSTVLI公司 VRNEEASETV电视 FPHDTTANVK公司 SYFSNHDESL公司 KKNDRFIASV公司
260 270 280 290 300
TDSENTNQRE公司 AASHGFGKTS公司 GNSFKVNSCK公司 DHIGKSMPNV公司 LEDEVYETVV公司
310 320 330 340 350
DTSEEDSFSL公司 CFSKCRTKNL公司 QKVRTSKTRK公司 KIFHEANADE公司 CEKSKNQVKE公司
360 370 380 390 400
KYSFVSEVEP公司 NDTDPLDSNV公司 ANQKPFESGS公司 DKISKEVVPS公司 LACEWSQLTL公司
410 420 430 440 450
SGLNGAQMEK公司 IPLLHISSCD公司 QNISEKDLLD公司 TENKRKKDFL公司 TSENSLPRIS公司
460 470 480 490 500
SLPKSEKPLN公司 EETVNKRDE公司 EQHLESHTDC公司 ILAVKQAISG公司 TSPVASSFGG公司
510 520 530 540 550
IKKSIFRIRE公司 SPKETFNASF公司 SGHMTDPNFK公司 KETEASESGL公司 EIHTVCSQKE公司
560 570 580 590 600
DSLCPNLIDN公司 GSWPATTTQN公司 SVALKNAGLI公司 STLKKKTNKF公司 IYAIHDETSY公司
610 620 630 640 650
KGKKIPKDQK公司 塞林萨夫 EANAFEAPLT公司 风扇罩LH SSVKRSCSQN公司
660 670 680 690 700
DSEEPTLSLT公司 SSFGTILRKC公司 SRNETCSNNT公司 VISQDLDYKE公司 AKCNKEKLQL公司
710 720 730 740 750
FITPEADSLS公司 clqegqccend公司 PKSKKVSDIK公司 EEVLAAACHP公司 VQHSKVEYSD版本
760 770 780 790 800
TDFQSQKSLL公司 伊登纳斯利 LTPTSKDVLS公司 NLVMISRGKE公司 SYKMSDKLKG公司
810 820 830 840 850
NNYESDVELT公司 KNIPMEKNQD公司 VCALNENYKN公司 天鹅绒面料 RVASPSRKVQ公司
860 870 880 890 900
财务报表 QKNQEETTSI公司 SKITVNPDSE公司 ELFSDNENNF公司 VFQVANERNN公司
910 920 930 940 950
LALGNTKELH公司 ETDLTCVNEP公司 IFKNSTMVLY公司 GDTGDKQATQ公司 VSIKKDLVYV公司
960 970 980 990 1000
LAEENKNSVK公司 QHIKMTLGQD公司 LKSDISLNID公司 KIPEKNNDYM公司 NKWAGLLGPI公司
1010 1020 1030 1040 1050
SNHSFGGSFR公司 TASNKEIKLS公司 EHNIKKSKMF公司 FKDIEQYPT公司 SLACVEIVNT公司
1060 1070 1080 1090 1100
LALDNQKKLS公司 KPQSINTVSA公司 HLQSSVSVVSD 质量保证 LFSKQDFNSN公司
1110 1120 1130 1140 1150
HNLTPSQKAE公司 ITELSTILEE项目 SGSQFEFTQF公司 RKPSYILQKS公司 TFEVPENQMT公司
1160 1170 1180 1190 1200
ILKTTSEECR公司 DADLHVIMNA公司 PSIGQVDSSK标准 QFEGTVEIKR公司 KFAGLLKNDC公司
1210 1220 1230 1240 1250
NKSASGYLTD公司 能效(ENEVGFRGFY) SAHGTKLNVS公司 TEALQKAVKL公司 FSDIENISEE公司
1260 1270 1280 1290 1300
TSAEVHPISL公司 SSSKCHDSVV公司 SMFKIENND公司 KTVSEKNNKC公司 QLILQNNIEM公司
1310 1320 1330 1340 1350
TTGTFVEEIT公司 ENYKRNTENE公司 DNKYTAASRN公司 SHNLEFDGSD公司 SSKNDTVCIH公司
1360 1370 1380 1390 1400
KDETDLLFTD公司 QHNICLKLSG公司 QFMKEGNTQI公司 KEDLSDLTFL公司 疏散
1410 1420 1430 1440 1450
GNTSNKEQLT公司 ATKTEQNIKD公司 FETSDTFFQT(场效应晶体管) 阿斯克尼斯瓦克 ESFNKIVNFF公司
1460 1470 1480 1490 1500
DQKPEELHNF公司 SLNSELHSDI公司 RKNKMDILSY公司 EETDIVKHKI公司 LKESVVGTG公司
1510 1520 1530 1540 1550
NQLVTFQGQP公司 埃尔德基普特 LLGFHTASGK公司 KVKIAKESLD公司 KVKNLFDEKE公司
1560 1570 1580 1590 1600
QGTSEITSFS公司 HQWAKTLKYR公司 EACKDLELAC公司 ETIEITAAPK公司 CKEMQNSLNN公司
1610 1620 1630 1640 1650
DKNLVSIETV(丹麦国家电视台) VPPKLLSDNL公司 CRQTENLKTS公司 KSIFLKVKVH公司 ENVEKETAKS公司
1660 1670 1680 1690 1700
PATCYTNQSP公司 伊斯文萨拉 财务报告准则T型S公司 S公司T型S公司L(左)L(左)E类A类K(K) KWLREGIFDG公司
1710 1720 1730 1740 1750
女王陛下 女贞子 NSTIAENDKN公司 HLSEKQDTYL公司 SNSSMSNSYS公司
1760 1770 1780 1790 1800
YHSDEVYNDS公司 GYLSKNKLDS公司 GIEPVLKNVE公司 DQKNTSFSV公司 ISNVKDANAY公司
1810 1820 1830 1840 1850
PQTVNEDICV公司 EELVTSSSPC公司 KNKNAAIKLS系列 ISNSNNFEVG公司 PPAFRIASGK公司
1860 1870 1880 1890 1900
IVCVSHETIK公司 KVKDIFTDSF公司 斯克维肯恩 KSKICQTKIM公司 AGCYEALDS公司
1910 1920 1930 1940 1950
EDILHNSLDN公司 DECSTHHKV公司 FADIQSEEIL公司 QHNQNMSGLE公司 KVSKISPCDV公司
1960 1970 1980 1990 2000
SLETSDICKC公司 SIGKLHKSVS公司 SANTCGIFST公司 ASGKSVQVSD公司 ASLQNARQVF公司
2010 2020 2030 2040 2050
SEIEDSTKQV公司 FSKVLFKSNE公司 HSDQLTREEN公司 泰尔特佩利 SQKGFSYNVV公司
2060 2070 2080 2090 2100
NSSAFSGFST公司 ASGKQV文件 SSLHKVKGVL公司 EEFDLIRTEH公司 SLHYSPTSRQ公司
2110 2120 2130 2140 2150
NVSKILPRVD公司 KRNPEHCVNS公司 EMEKTCSKEF公司 KLSNNLNVEG公司 GSSENNHSIK公司
2160 2170 2180 2190 2200
VSPYLSQFQQ公司 DKQQLVLGTK公司 VSLVENIHVL公司 GKEQASPKNV公司 KMEIGKTETF公司
2210 2220 2230 2240 2250
SDVPVKTNIE公司 VCSTYSKDSE公司 NYFETEAVEI公司 阿卡夫梅德尔 TDSKLPSHAT公司
2260 2270 2280 2290 2300
HSLFT笔 EMVLSNSRIG公司 克勒格普利夫 GEPSIKRNLL公司 尼日利亚石油公司
2310 2320 2330 2340 2350
EKSLKASKST公司 PDGTIKDRRL公司 FMHHVSLEPI公司 TCVPFRTTKE公司 RQEIQNPNFT公司
2360 2370 2380 2390 2400
APGQEFLSKS公司 HLYEHLTLEK公司 SSSNLAVSGH公司 PFYQVSATRN公司 EKMRHLITTG公司
2410 2420 2430 2440 2450
RPTKVFVPPF公司 KTKSHFHRVE公司 QCVRNINLEE公司 NRQKQNIDGH公司 GSDDSKNKIN公司
2460 2470 2480 2490 2500
DNEIHQFNKN公司 NSNQAAAAVTF公司 TKCEEPLDL公司 ITSLQNARDI公司 QDMRIKKKQR公司
2510 2520 2530 2540 2550
QRVFPQPGSL公司 YLAKTSTLPR公司 ISLKAAVGGQ公司 VPSACSHKQL公司 YTYGVSKHCI公司
2560 2570 2580 2590 2600
KINSKNAESF公司 QFHTEDYFGK公司 eslwtgggiq公司 LADGGWLIPS公司 NDGKAGKEEF公司
2610 2620 2630 2640 2650
YRALCDTPGV公司 DPKLISRIWV公司 YNHYRWIIWK公司 LAAMECAFPK公司 EFANRCLSPE公司
2660 2670 2680 2690 2700
RVLLQLKYRY公司 DTEIDRSRRS公司 阿基米德 TAAKTLVLCV公司 SDIISLSANI公司
2710 2720 2730 2740 2750
SETSSNKTSS公司 ADTQKVAIIE公司 LTDGWYAVKA公司 QLDPPLLAVL公司 KNGRLTVGQK公司
2760 2770 2780 2790 2800
IILHGAELVG公司 SPDACTPLEA公司 PESLMLKISA公司 NSTRPARWYT公司 KLGFFPDPRP公司
2810 2820 2830 2840 2850
FPLPLSSLFS公司 DGGNVGCVDV公司 IIQRAYPIQW公司 MEKTSSGLYI公司 FRNEREEEKE公司
2860 2870 2880 2890 2900
AAKYVEAQQK公司 RLEALFTKIQ公司 EEFEEHEENT公司 TKPYLPSRAL公司 TRQQVRALQD公司
2910 2920 2930 2940 2950
GAELYEAVKN公司 AADPAYLEGY公司 FSEEQLRALN公司 NHRQMLNDKK公司 QAQIQLEIRK公司
2960 2970 2980 2990 3000
阿美萨克克 GLSRDVTTVW公司 KLRIVSYSKK公司 EKDSVILSIW公司 RPSSDLYSLL公司
3010 3020 3030 3040 3050
TEGKRYRIYH公司 车床KSKSKS ERANIQLAAT公司 KKTQYQQLPV公司 SDEILFQIYQ公司
3060 3070 3080 3090 3100
PREPLHFSKF公司 LDPDFQPSCS公司 EVDLIGFVVS VVKKTGLAPF公司 VYLSDECYNL公司
3110 3120 3130 3140 3150
莱克弗德林 EDIIKPHMLI公司 AASNLQWRPE公司 SKSGLLTLFA公司 GDFSVFSASP公司
3160 3170 3180 3190 3200
KEGHFQETFN KMKNTVENID公司 ILCNEAENKL公司 MHILHANDPK公司 WSTPTKDCTS公司
3210 3220 3230 3240 3250
GPYTAQIIPG公司 TGNKLLMSSP公司 NCEIYYQSPL公司 SLCMAKRKSV公司 STPVSAQMTS公司
3260 3270 3280 3290 3300
KSCKGEKEID公司 DQKNCKRRA公司 LDFLSRLPLP公司 PPVSPICTFV公司 SPAAQKAFQP公司
3310 3320 3330 3340 3350
PRSCGTKYET公司 PIKKKELNSP公司 QMTPFKFNE公司 爱尔兰 DEELALINTQ公司
3360 3370 3380 3390 3400
ALLSGSTGEK公司 QFISVESTR(质量、质量和安全标准) TAPTSSEDYL公司 RLKRRCTTSL公司 伊拉克
3410 3418
TEECEKNKQD公司 蒂特基语

数据来源:UniProt


蛋白质图谱 折叠蛋白图

靶向肽分析物相对于SNP、异构体和PTM的位置

Uniprot公司数据库登录 磷网站+®

单击节点上的点
查看下面的详细分析信息
所有其他点链接到 UniProt公司



磷酸化 乙酰化 泛素化 其他

加载

装载机

CPTAC-3279的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
白细胞介素2
顺序
TSVSQTSL泄漏
修改类型
未修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
不适用
肽开始
1679
肽末端
1690
CPTAC标识
CPTAC-3279型
肽分子质量
1,262.6718
物种
人类 智者 (人类)
分析类型
富集免疫MRM
富集方法
肽免疫亲和力
矩阵
细胞裂解产物
提交实验室
弗雷德·哈钦森癌症研究中心
提交实验室PI
阿曼达·保罗维奇

出版物

查看详细信息 (在新窗口中打开)

一种基于多重质谱的分析方法,用于对DNA损伤响应的磷酸化进行稳健量化。Whiteaker JR、Zhao L、Saul R、Kaczmarczyk JA、Schoenhrr RM、Moore HD、Jones Weinert C、Ivey RG、Lin C、Hiltke T、Reding KW、Whiteley G、Wang P、Paulovich AG。辐射研究2018年2月23日。doi:10.1667/RR14963.1。[印刷前Epub]


分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
6500个QTRAP(Sciex)
内部标准
合成肽
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
C端子K处的13C和15N
液晶显示器
超纳米液晶2D+(Eksigent)
色谱柱填料
复制Sil-Pur C18-AQ 3um
立柱尺寸
100 x 0.075毫米
流速
300微升/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
8岁(1+) 27.8 23.8 42.8 48.3 27.7 57.4 55.7 36.5 71.6 15 15 15
y6(1+) 46.5 38.2 20.2 75.5 37.9 38.7 88.7 53.8 43.7 15 15 15
7岁(1+) 54.8 33 31.7 57.2 33.4 34.4 79.2 47 46.8 15 15 15
9岁(1+) 27.3 14 21.6 26.9 16.7 19.8 38.3 21.8 29.3 15 15 15
总和 18.6 12.4 11.6 29.1 12.2 13.5 34.5 17.4 17.8 15 15 15


其他资源和评论

评论

CPTAC-3280的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
白细胞介素2
肽修饰顺序
TS[+80.0]VSQTSL泄漏
修改类型
磷(ST)
蛋白质-修饰位点
1680
肽-修饰位点
2
肽开始
1679
肽末端
1690
CPTAC标识
CPTAC-3280型
肽分子质量
1,342.6381
物种
人类 智者 (人类)
分析类型
富集免疫MRM
富集方法
肽免疫亲和力
矩阵
细胞裂解产物
提交实验室
弗雷德·哈钦森癌症研究中心
提交实验室PI
阿曼达·保罗维奇

出版物

查看详细信息 (在新窗口中打开)

一种基于多重质谱的分析方法,用于对DNA损伤响应的磷酸化进行稳健量化。Whiteaker JR、Zhao L、Saul R、Kaczmarczyk JA、Schoenherr RM、Moore HD、Jones-Weinert C、Ivey RG、Lin C、Hiltke T、Reding KW、Whiteley G、Wang P、Paulovich AG。辐射研究2018年2月23日。doi:10.1667/RR14963.1。[印刷前Epub]


分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
6500个QTRAP(Sciex)
内部标准
合成肽
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
C端子K处的13C和15N
液晶显示器
超纳米液晶2D+(Eksigent)
色谱柱填料
复制Sil-Pur C18-AQ 3um
立柱尺寸
100 x 0.075毫米
流速
300微升/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
8岁(1+) 47.8 35.4 29.3 51.5 48.2 38 70.3 59.8 48 15 15 15
7岁(1+) 47.8 24.8 36.3 64.9 45.1 42.1 80.6 51.5 55.6 15 15 15
y6(1+) 59.5 33.4 32.1 65.5 33.6 37.6 88.5 47.4 49.4 15 15 15
y9(1+) 48.3 31.4 24.6 45.5 37.9 32.8 66.4 49.2 41 15 15 15
总和 30 19.3 25.5 30.4 27.7 35.2 42.7 33.8 43.5 15 15 15


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