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引用CPTAC分析门户时,请包括以下声明
我们要感谢美国国家癌症研究所的临床蛋白质组肿瘤分析联盟(CPTAC)检测门户网站(assays.cance.gov)用于开发分析并建立本出版物中所述分析的标准。

概述数据来源:UniProt

官方基因符号 其他别名
CAPG公司 AFCP、MCP
序列长度(AA) 分子量(Da)
348 38499
蛋白质名称
巨噬细胞吞噬蛋白
来源
UniProt公司
磷化SitePlus®
基因卡
人类蛋白质阿特拉斯

蛋白质序列悬停以查看完整序列

10 20 30 40 50
MYTAIPQSGS公司 PFPGSVQDPG公司 LHVWRVEKLK公司 PVPVAQENQG公司 VFFSGDSYLV公司
60 70 80 90 100
LHNGPEEVSH公司 LHLWIGQQSS公司 RDEQGACAVL公司 AVHLNTLLGE公司 RPVQHREVQG公司
110 120 130 140 150
雀巢公司 PRGLK公司Y(Y)E类 V(V)E类S公司A类F类H(H)K(K)TST公司 GAPAAIKKLY的 QVKGKKNIRA公司
160 170 180 190 200
TERALNWDSF公司 NTGDCFILDL公司 GQNIFAWCGG公司 KSNILERNKA公司 拉莱尔群岛
210 220 230 240 250
ERQGKAQVEI公司 VTDGEEPAEM公司 IQVLGPKPAL公司 K(K)E类N个E类E类D类L(左)T型 A类D类K(K)阿纳卡阿
260 270 280 290 300
LYKVSDATGQ公司 MNLTKVADSS公司 PFALELLISD公司 DCFVLDNGLC公司 GKIYIWKGRK公司
310 320 330 340 348
阿内克尔卡尔 QVAEGFISRM公司 QYAPNTQVEI公司 LPQGHESPIF公司 KQFFKDWK公司

数据来源:UniProt


蛋白质图谱 折叠蛋白图

靶向肽分析细胞相对于SNPs、异构体和PTM的位置

Uniprot公司数据库登录 磷网站+®

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磷酸化 乙酰化 泛素化 其他

加载

装载机

CPTAC-328的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
CAPG公司
顺序
EGNPEEDLTADK公司
修改类型
未修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
不适用
肽开始
232
肽末端
243
CPTAC标识
CPTAC-328型
肽分子质量
1,316.5732
物种
人类 智者 (人类)
分析类型
直接MRM
矩阵
细胞系裂解液池
提交实验室
布罗德研究所和FHCRC
提交实验室PI
史提夫卡爾

出版物

查看详细信息 (在新窗口中打开)

证明大规模开发标准化分析以量化人类蛋白质的可行性。Kennedy JJ、Abbatiello SE、Kim K、Yan P、Whiteaker JR、Lin C、Kim JS、Zhang Y、Wang X、Ivey RG、Zhao L、Min H、Lee Y、Yu MH、Yang EG、Lee C、Wang P、Rodriguez H、Kim Y、Carr SA、Paulovich AG。Nat方法2014年2月;11(2):149-55. doi:10.1038/nmeth.2763。Epub 2013年12月8日。电话:24317253


Broad Institute获得的响应曲线。弗雷德·哈钦森癌症研究中心获得的重复性数据。


Broad Institute获得的响应曲线。弗雷德·哈钦森癌症研究中心获得的重复性数据。


化验参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
5500个QTRAP(ABSCIEX)
内部标准
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
13C、15N
信用证
nanoLC-Ultra 2D,cHiPLC-nanoflex(Eksigent)
色谱柱填料
ChromXP C18-CL,3微米,120A
立柱尺寸
150 x 0.075毫米
流速
500 nL/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片离子/过渡 医学 医学 医学 医学
9岁(1+) 11.3 5.4 4.8 15.1 7.5 5 18.9 9.2 6.9 15 25 15
8岁(1+) 23.2 7.3 4.5 29.4 8.9 6.7 37.5 11.5 8.1 15 25 15
7岁(1+) 14.5 7.7 7.1 17.9 8.5 8.9 23 11.5 11.4 15 25 15
总和 9.8 5.3 5.2 15.5 7.5 5.6 18.3 9.2 7.6 15 25 15


其他资源和评论

评论

CPTAC-327的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
CAPG公司
顺序
YQEGGVESAFHK公司
修改类型
未修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
不适用
肽起始
116
肽末端
127
CPTAC标识
CPTAC-327型
肽分子质量
1,350.6204
物种
人类 智者 (人类)
分析类型
直接MRM
矩阵
细胞系裂解物池
提交实验室
布罗德研究所和FHCRC
提交实验室PI
史提夫卡爾

出版物

查看详细信息 (在新窗口中打开)

证明大规模开发标准化分析以量化人类蛋白质的可行性。Kennedy JJ、Abbatiello SE、Kim K、Yan P、Whiteaker JR、Lin C、Kim JS、Zhang Y、Wang X、Ivey RG、Zhao L、Min H、Lee Y、Yu MH、Yang EG、Lee C、Wang P、Rodriguez H、Kim Y、Carr SA、Paulovich AG。Nat方法2014年2月;11(2):149-55. doi:10.1038/nmeth.2763。Epub 2013年12月8日。PMID:24317253


Broad Institute获得的响应曲线。弗雷德·哈钦森癌症研究中心获得的重复性数据。


Broad Institute获得的响应曲线。弗雷德·哈钦森癌症研究中心获得的重复性数据。


分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
5500个QTRAP(ABSCIEX)
内部标准
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
13摄氏度,15牛顿度
信用证
nanoLC-Ultra 2D,cHiPLC-nanoflex(Eksigent)
色谱柱填料
ChromXP C18-CL,3微米,120A
立柱尺寸
150 x 0.075毫米
流速
500 nL/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
y6(1+) 6.8 5.5 5.2 6.6 4.9 10.8 9.5 7.4 12 15 25 15
y5(1+) 5.2 13.4 11 5.7 14.8 21 7.7 20 23.7 15 25 15
9岁(2+) 10.3 6.5 8.7 14.1 5.4 9.3 17.5 8.5 12.7 15 25 15
总和 3.6 8.3 5.5 4 9.3 9 5.4 12.5 10.5 15 25 15


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