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引用CPTAC分析门户时,请包括以下声明
我们感谢美国国家癌症研究所临床蛋白质组肿瘤分析联盟(CPTAC)分析门户网站(assesss.Cancer.gov)用于开发分析并建立本出版物中所述分析的标准。

概述数据来源:UniProt

官方基因符号 其他别名
RAD51C系列 RAD51L2型
序列长度(AA) 分子量(Da)
376 42190
蛋白质名称
DNA修复蛋白RAD51同源物3
来源
UniProt公司
磷化SitePlus®
基因卡
人类蛋白质阿特拉斯

蛋白质序列悬停以查看完整序列

10 20 30 40 50
MRGKTFRFEM公司 二维码D类L(左)V(V)S公司F类P(P)L(左)S公司 P(P)A类V(V)R(右)VKLVSA公司 GFQTAEELLE公司 VKPSELSKEV公司
60 70 80 90 100
吉斯凯雷特 LQIIRRECLT公司 NKPRYAGTSE公司 SHKKCTALEL公司 LEQEHTQGFI公司
110 120 130 140 150
ITFCSALDDI公司 LGGGVPLMKT公司 TEICGAPGVG公司 KTQLCMQLAV公司 DVQIPECFGG公司
160 170 180 190 200
VAGEAVFIDT公司 EGSFMVDRVV型 DLATACIQHL公司 QLIAEKHKGE公司 EHRKALEDFT公司
210 220 230 240 250
LDNILSHIYY公司 FRCRDYTELL公司 AQVYLLPDFL公司 SEHSKVRLVI公司 VDGIAFPFRH公司
260 270 280 290 300
DLDDLSLRTR数据库 LLNGLAQMI公司 斯兰赫拉夫 ILTNQMTTKI公司 drncallvpa公司
310 320 330 340 350
LGESWGHAAT公司 IRLIFHWDRK公司 QRLATLYKSP公司 SQKECTVLFQ公司 IKPQGFRDTV电视
360 370 376
VTSACSLQTE公司 GSLSTRKRSR公司 DPEEEL公司

数据来源:UniProt


蛋白质图谱 折叠蛋白图

靶向肽分析细胞相对于SNPs、异构体和PTM的位置

Uniprot公司数据库登录 磷网站+®

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磷酸化 乙酰化 泛素化 其他

加载

装载机

CPTAC-3250的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
RAD51C系列
顺序
DLVSFPLSPAVR公司
修改类型
未修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
不适用
肽开始
13
肽末端
24
CPTAC标识
CPTAC-3250型
肽分子质量
1,299.7187
物种
人类 智者 (人类)
化验类型
富集免疫MRM
富集方法
肽免疫亲和力
矩阵
细胞裂解产物
提交实验室
弗雷德·哈钦森癌症研究中心
提交实验室PI
阿曼达·保罗维奇

出版物

查看详细信息 (在新窗口中打开)

一种基于多重质谱的分析方法,用于对DNA损伤响应的磷酸化进行稳健量化。Whiteaker JR、Zhao L、Saul R、Kaczmarczyk JA、Schoenherr RM、Moore HD、Jones-Weinert C、Ivey RG、Lin C、Hiltke T、Reding KW、Whiteley G、Wang P、Paulovich AG。辐射研究2018年2月23日。doi:10.1667/RR14963.1。[印刷前Epub]


分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
6500个QTRAP(Sciex)
内部标准
合成肽
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
C端子R处的13C和15N
信用证
超纳米液晶2D+(Eksigent)
色谱柱填料
复制Sil-Pur C18-AQ 3um
立柱尺寸
100 x 0.075毫米
流速
300微升/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
7岁(1+) 7.3 10.9 6.3 12.8 17.3 7.4 14.7 20.4 9.7 15 15 15
y4(1+) 24.1 10.9 6.2 28.3 15.2 12.4 37.2 18.7 13.9 15 15 15
9岁(1+) 12.5 5 11.6 15.3 11 13.5 19.8 12.1 17.8 15 15 15
8岁(1+) 17.2 9.9 10.7 20.6 14.9 12.3 26.8 17.9 16.3 15 15 15
总和 6 7.3 6.2 10.7 13.4 8.9 12.3 15.3 10.8 15 15 15


其他资源和评论


CPTAC-3287的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
RAD51C系列
肽修饰顺序
DLVSFPLS[+80.0]PAVR系统
修改类型
磷(ST)
蛋白质-修饰位点
20
肽-修饰位点
8
肽开始
13
肽末端
24
CPTAC标识
CPTAC-3287型
肽分子质量
1,379.6850
物种
人类 智者 (人类)
分析类型
富集免疫MRM
富集方法
肽免疫亲和力
矩阵
细胞裂解产物
提交实验室
弗雷德·哈钦森癌症研究中心
提交实验室PI
阿曼达·保罗维奇

出版物

查看详细信息 (在新窗口中打开)

一种基于多重质谱的分析方法,用于对DNA损伤响应的磷酸化进行稳健量化。Whiteaker JR、Zhao L、Saul R、Kaczmarczyk JA、Schoenherr RM、Moore HD、Jones-Weinert C、Ivey RG、Lin C、Hiltke T、Reding KW、Whiteley G、Wang P、Paulovich AG。辐射研究2018年2月23日。doi:10.1667/RR14963.1。[印刷前Epub]


分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
6500 QTRAP(Sciex)
内部标准
合成肽
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
C端子R处的13C和15N
信用证
超纳米液晶2D+(Eksigent)
色谱柱填料
复制Sil-Pur C18-AQ 3um
立柱尺寸
100 x 0.075毫米
流速
300微升/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
年8-98(1+) 32.6 19.7 17.4 35.7 31 28.7 48.3 36.7 33.6 15 15 15
7-98岁(1+) 11.1 19.3 14.9 18 28.2 25.7 21.1 34.2 29.7 15 15 15
年9-98(1+) 20.7 11.7 15.4 27.4 25.6 23.2 34.3 28.1 27.8 15 15 15
8岁(1+) 22.1 11.6 17.2 24.8 26.7 22.6 33.2 29.1 28.4 15 15 15
9岁(1+) 10.8 10.6 16.3 24.8 23.3 26.3 27 25.6 30.9 15 15 15
总和 10.1 10.3 14.1 14.4 23.7 24.1 17.6 25.8 27.9 15 15 15


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