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引用CPTAC分析门户时,请包括以下声明
我们感谢美国国家癌症研究所临床蛋白质组肿瘤分析联盟(CPTAC)分析门户网站(assesss.Cancer.gov)用于开发分析并建立本出版物中所述分析的标准。

概述数据来源:UniProt

官方基因符号 其他别名
GSTP1型 FAEES3、GST3
序列长度(AA) 分子量(Da)
210 23356
蛋白质名称
谷胱甘肽S-转移酶P
来源
UniProt公司
磷化SitePlus®
基因卡
人类蛋白质阿特拉斯

蛋白质序列悬停以查看完整序列

10 20 30 40 50
M(M)P(P)P(P)Y(Y)T型V(V)V(V)Y(Y)F类P(P) V(V)R(右)GRCAALRM公司 LLADQGQSWK公司 E类E类V(V)V(V)T型V(V)E类T型W公司 E类G公司S公司L(左)K(K)A类S公司C类L(左)Y(Y)
60 70 80 90 100
G公司L(左)P(P)K(K)F类D类G公司D类 L(左)T型L(左)Y(Y)S公司N个T型L(左) R(右)HLGRTLGLY公司 GKDQQEAALV公司 DMVNDGVEDL公司
110 120 130 140 150
RCK公司Y(Y)S公司L(左)Y(Y)T型 N个Y(Y)E类A类G公司K(K)DDYV公司 KALPGQLKPF公司 ETLLSQNQGG公司 KTFIVGDQIS公司
160 170 180 190 200
费德纳尔 LIHEVLAPGC公司 LDAFPLLSAY机场 VGRLSARPKL公司 K(K)A类F类L(左)A类S公司P(P)E类Y(Y)V(V)
210
N个L(左)P(P)N个G公司N个G公司K(K)

数据来源:UniProt


蛋白质图谱 折叠蛋白图

靶向肽分析细胞相对于SNPs、异构体和PTM的位置

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查看下面的详细分析信息
所有其他点链接到 UniProt公司



磷酸化 乙酰化 泛素化 其他

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装载机

CPTAC-1415的含量测定细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
GSTP1标准
肽修饰顺序
ASC[+57.0]LYGQLPK公司
修改类型
氨基甲基半胱氨酸
蛋白质-修饰位点
48
肽-修饰位点
肽开始
46
肽末端
55
CPTAC标识
CPTAC-1415型
肽分子质量
1,135.5696
物种
人类 智者 (人类)
化验类型
直接免疫MRM
矩阵
耗尽消化血浆
提交实验室
布罗德学院
提交实验室PI
史蒂文·卡尔

出版物

查看详细信息 (在新窗口中打开)

大规模实验室间研究,以开发、分析验证和应用高度多重定量肽分析来测量血浆中与癌症相关的蛋白质。Abbatiello SE、Schilling B、Mani DR、Zimmerman LJ、Hall SC、MacLean B、Albertolle M、Allen S、Burgess M、Cusack MP、Gosh M、Hedrick V、Held JM、Inerwicz HD、Jackson A、Keshian H、Kinsinger CR、Lyssand J、Makowski L、Mesri M、Rodriguez H、Rudnick P、Sadowski P、Sedransk N、Shaddox K、Skates SJ、Kuhn E、Smith D、Whiteaker JR、Whitwell C、Zhang S、,Borchers CH、Fisher SJ、Gibson BW、Liebler DC、MacCoss MJ、Neubert TA、Paulovich AG、Regnier FE、Tempst P、Carr SA。分子细胞蛋白质组学。2015年9月;14(9):2357-74. doi:10.1074/mcp。M114.047050。Epub 2015年2月18日。PMID:25693799


分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
匡提瓦TSQ
内部标准
重稳定同位素肽(δ8-10)
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
15牛
信用证
Easy NanoLC1000
色谱柱填料
阻垢剂C18,1.9um,200A
立柱尺寸
0.075 x 150毫米
流速
200 nL/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
7岁(1+) 4.1 3.9 2.2 5.8 7.7 5 7.1 8.6 5.5 15 15 15
y6(1+) 2.4 1.5 2.7 3.7 5.8 5.1 4.4 6 5.8 15 15 15
y5(1+) 6.3 2 1.9 6.9 6.4 4 9.3 6.7 4.4 15 15 15
总和 2.5 1.4 1.9 4.2 6 4.5 4.9 6.2 4.9 15 15 15


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CPTAC-1413的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
GSTP1标准
顺序
EEVVTVETWQEGSLK公司
修改类型
未修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
不适用
肽开始
31
肽末端
45
CPTAC标识
CPTAC-1413型
肽分子质量
1,732.8519
物种
人类 智者 (人类)
化验类型
直接免疫MRM
矩阵
耗尽消化血浆
提交实验室
布罗德研究所
提交实验室PI
史蒂文·卡尔

出版物

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大规模实验室间研究,以开发、分析验证和应用高度多重定量肽分析来测量血浆中与癌症相关的蛋白质。Abbatiello SE、Schilling B、Mani DR、Zimmerman LJ、Hall SC、MacLean B、Albertolle M、Allen S、Burgess M、Cusack MP、Gosh M、Hedrick V、Held JM、Inerwicz HD、Jackson A、Keshian H、Kinsinger CR、Lyssand J、Makowski L、Mesri M、Rodriguez H、Rudnick P、Sadowski P、Sedransk N、Shaddox K、Skates SJ、Kuhn E、Smith D、Whiteaker JR、Whitwell C、Zhang S、,Borchers CH、Fisher SJ、Gibson BW、Liebler DC、MacCoss MJ、Neubert TA、Paulovich AG、Regnier FE、Tempst P、Carr SA。分子细胞蛋白质组学。2015年9月;14(9):2357-74. doi:10.1074/mcp。M114.047050。Epub 2015年2月18日。PMID:25693799


分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
匡提瓦TSQ
内部标准
重稳定同位素肽(δ8-10)
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
15牛
信用证
Easy NanoLC1000
色谱柱填料
阻垢剂C18,1.9um,200A
立柱尺寸
0.075 x 150毫米
流速
200 nL/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
9岁(1+) 21.8 12.9 5 36.2 16.3 6.2 42.3 20.8 8 15 15 15
8岁(1+) 24.7 12.6 8.4 36.6 17.9 7.8 44.2 21.9 11.5 15 15 15
y11(1+) 15.7 9.4 4.6 46.4 11.7 4.8 49 15 6.6 15 15 15
总和 17.9 10.3 3.6 36.3 14 4.2 40.5 17.4 5.5 15 15 15


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CPTAC-1412的含量测定细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
GSTP1标准
顺序
FQDGDTLYQSNTILR公司
修改类型
未修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
不适用
肽开始
56
肽末端
71
CPTAC标识
CPTAC-1412型
肽分子质量
1,882.9425
物种
人类 智者 (人类)
化验类型
直接免疫MRM
矩阵
耗尽消化血浆
提交实验室
布罗德学院
提交实验室PI
史蒂文·卡尔

出版物

查看详细信息 (在新窗口中打开)

大规模实验室间研究,以开发、分析验证和应用高度多重定量肽分析来测量血浆中与癌症相关的蛋白质。Abbatiello SE、Schilling B、Mani DR、Zimmerman LJ、Hall SC、MacLean B、Albertolle M、Allen S、Burgess M、Cusack MP、Gosh M、Hedrick V、Held JM、Inerwicz HD、Jackson A、Keshian H、Kinsinger CR、Lyssand J、Makowski L、Mesri M、Rodriguez H、Rudnick P、Sadowski P、Sedransk N、Shaddox K、Skates SJ、Kuhn E、Smith D、Whiteaker JR、Whitwell C、Zhang S、,Borchers CH、Fisher SJ、Gibson BW、Liebler DC、MacCoss MJ、Neubert TA、Paulovich AG、Regnier FE、Tempst P、Carr SA。摩尔细胞蛋白质组学。2015年9月;14(9):2357-74. doi:10.1074/mcp。M114.047050。Epub 2015年2月18日。PMID:25693799


分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
Quantiva TSQ公司
内部标准
重稳定同位素肽(δ8-10)
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
15牛
信用证
Easy NanoLC1000
色谱柱填料
阻垢剂C18,1.9um,200A
立柱尺寸
0.075 x 150毫米
流速
200 nL/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
y10(1+) 11.3 4.8 2.8 32.7 17.2 14.5 34.6 17.9 14.8 15 15 15
8岁(1+) 9 4.8 5 33 17.6 13.7 34.2 18.2 14.6 15 15 15
9岁(1+) 12.5 4.3 3.3 29.5 17.7 16 32 18.2 16.3 15 15 15
总和 9.2 3.2 2.7 31.7 17.1 14 33 17.4 14.3 15 15 15


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CPTAC-1414的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
GSTP1标准
顺序
PPYTVVYFPVR
修改类型
未修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
不适用
肽开始
2
肽末端
12
CPTAC标识
CPTAC-1414型
肽分子质量
1,336.7180
物种
人类 智者 (人类)
化验类型
直接免疫MRM
矩阵
耗尽消化血浆
提交实验室
布罗德学院
提交实验室PI
史蒂文·卡尔

出版物

查看详细信息 (在新窗口中打开)

大规模实验室间研究,开发、分析验证并应用高度复用的定量肽分析方法来测量血浆中的癌症相关蛋白质。Abbatiello SE、Schilling B、Mani DR、Zimmerman LJ、Hall SC、MacLean B、Albertolle M、Allen S、Burgess M、Cusack MP、Gosh M、Hedrick V、Held JM、Inerwicz HD、Jackson A、Keshian H、Kinsinger CR、Lyssand J、Makowski L、Mesri M、Rodriguez H、Rudnick P、Sadowski P、Sedransk N、Shaddox K、Skates SJ、Kuhn E、Smith D、Whiteaker JR、Whitwell C、Zhang S、,Borchers CH、Fisher SJ、Gibson BW、Liebler DC、MacCoss MJ、Neubert TA、Paulovich AG、Regnier FE、Tempst P、Carr SA。分子细胞蛋白质组学。2015年9月;14(9):2357-74. doi:10.1074/mcp。M114.047050。Epub 2015年2月18日。PMID:25693799


分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
匡提瓦TSQ
内部标准
重稳定同位素肽(δ8-10)
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
15牛
信用证
Easy NanoLC1000
色谱柱填料
Reprosil C18,1.9微米,200A
立柱尺寸
0.075 x 150毫米
流速
200 nL/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
y6(1+) 5.3 4.3 3.7 10.3 7.5 5.3 11.6 8.6 6.5 15 15 15
8岁(1+) 4.7 3.6 11.9 6 4.9 12.8 7 5.7 15 15 15
y5(1+) 5 4.3 4.5 11.2 7.5 5.1 12.3 8.6 6.8 15 15 15
总和 3.7 3.7 3.6 10.4 6.9 4.9 11 7.8 6.1 15 15 15


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CPTAC-213的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
GSTP1标准
顺序
AFLASPEYVNLPINGNGK公司
修改类型
未修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
不适用
肽开始
192
肽末端
209
CPTAC标识
CPTAC-213型
肽分子质量
1,902.9840
物种
人类 智者 (人类)
化验类型
直接免疫MRM
矩阵
细胞系裂解液池
提交实验室
弗雷德·哈钦森癌症研究中心
提交实验室PI
阿曼达·保罗维奇

出版物

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证明大规模开发标准化分析以量化人类蛋白质的可行性。Kennedy JJ、Abbatiello SE、Kim K、Yan P、Whiteaker JR、Lin C、Kim JS、Zhang Y、Wang X、Ivey RG、Zhao L、Min H、Lee Y、Yu MH、Yang EG、Lee C、Wang P、Rodriguez H、Kim Y、Carr SA、Paulovich AG。Nat方法2014年2月;11(2):149-55. doi:10.1038/nmeth.2763。Epub 2013年12月8日。PMID:24317253


分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
5500个QTRAP(ABSCIEX)
内部标准
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
13摄氏度,15牛顿度
信用证
nanoLC-Ultra 2D,cHiPLC-nanoflex(Eksigent)
色谱柱填料
ChromXP C18-CL,3微米,120A
立柱尺寸
150 x 0.075毫米
流速
500 nL/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
y11(1+) 23.4 12.5 13.6 34.6 19.4 20 41.8 23.1 24.2 15 25 15
8岁(1+) 29.1 13 12.7 38.2 20.5 19.3 48 24.3 23.1 15 25 15
7岁(1+) 9 7.6 9.7 28 19.5 16.5 29.4 20.9 19.1 15 25 15
总和 12.9 6.6 9.6 26.9 18.1 16.1 29.8 19.3 18.7 15 25 15


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CPTAC-212的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
GSTP1标准
肽修饰顺序
ASC[+57.0]LYGQLPK公司
修改类型
氨基甲基半胱氨酸
蛋白质-修饰位点
48
肽-修饰位点
肽开始
46
肽末端
55
CPTAC标识
CPTAC-212型
肽分子质量
1,135.5696
物种
人类 智者 (人类)
化验类型
直接免疫MRM
矩阵
细胞系裂解液池
提交实验室
弗雷德·哈钦森癌症研究中心
提交实验室PI
阿曼达·保罗维奇

出版物

查看详细信息 (在新窗口中打开)

证明大规模开发标准化分析以量化人类蛋白质的可行性。Kennedy JJ、Abbatiello SE、Kim K、Yan P、Whiteaker JR、Lin C、Kim JS、Zhang Y、Wang X、Ivey RG、Zhao L、Min H、Lee Y、Yu MH、Yang EG、Lee C、Wang P、Rodriguez H、Kim Y、Carr SA、Paulovich AG。Nat方法2014年2月;11(2):149-55. doi:10.1038/nmeth.2763。Epub 2013年12月8日。PMID:24317253


分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
5500个QTRAP(ABSCIEX)
内部标准
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
15牛
信用证
nanoLC-Ultra 2D,cHiPLC-nanoflex(Eksigent)
色谱柱填料
ChromXP C18-CL,3微米,120A
立柱尺寸
150 x 0.075毫米
流速
500 nL/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
8岁(1+) 6.7 10.2 12.2 11.7 10.8 11.4 13.5 14.9 16.7 15 25 15
7岁(1+) 7.4 9.3 12.3 9.8 9.2 11.6 12.3 13.1 16.9 15 25 15
y6(1+) 6.3 9.2 12.2 10.3 9.6 11.7 12.1 13.3 16.9 15 25 15
总和 5.9 9.1 12.1 9.9 9.4 11.6 11.5 13.1 16.8 15 25 15


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CPTAC-701的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
GSTP1标准
顺序
伊莎莉·尼亚克(YISLIYTNYEAGK)
修改类型
未修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
不适用
肽开始
104
肽末端
116
CPTAC标识
CPTAC-701型
肽分子质量
1,533.7715
物种
人类 智者 (人类)
化验类型
富集免疫MRM
富集方法
肽免疫亲和力
矩阵
等离子体
提交实验室
弗雷德·哈钦森癌症研究中心
提交实验室PI
阿曼达·保罗维奇

出版物

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用于免疫多反应监测质谱分析的抗肽单克隆抗体很可能支持Western blot和ELISA。Schoenherr RM、Saul RG、Whiteaker JR、Yan P、Whiteley GR、Paulovich AG。分子细胞蛋白质组学。2015年2月;14(2):382-98. doi:10.1074/mcp。O114.043133。Epub 2014年12月15日。PMID:25512614


分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
5500 Q阱
内部标准
合成肽
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
C端子K处的13C和15N
信用证
Eksigent NanoLC 2D
色谱柱填料
ReproSil-Pur C18-AQ 3微米
立柱尺寸
100毫米x 75微米内径
流速
300 nL/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
7岁(1+) 16.8 3.9 6.7 18.7 6.4 10.3 25.1 7.5 12.3 15 15 15
8岁(1+) 11.2 3.1 5.9 14.1 7.2 9.2 18 7.8 10.9 15 15 15
9岁(1+) 10.1 5.5 6.7 11.1 8.6 9.7 15 10.2 11.8 15 15 15
总和 10.1 2.8 5.7 12.7 7 9.2 16.2 7.5 10.8 15 15 15


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CPTAC-3231的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
GSTP1标准
顺序
伊莎莉·尼亚克(YISLIYTNYEAGK)
修改类型
未修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
不适用
肽开始
104
肽末端
116
CPTAC标识
CPTAC-3231型
肽分子质量
1,533.7715
物种
人类 智者 (人类)
化验类型
富集免疫MRM
富集方法
肽免疫亲和力
矩阵
细胞裂解产物
提交实验室
弗雷德·哈钦森癌症研究中心
提交实验室PI
阿曼达·保罗维奇

出版物

查看详细信息 (在新窗口中打开)

一种基于多重质谱的分析方法,用于对DNA损伤响应的磷酸化进行稳健量化。Whiteaker JR、Zhao L、Saul R、Kaczmarczyk JA、Schoenherr RM、Moore HD、Jones-Weinert C、Ivey RG、Lin C、Hiltke T、Reding KW、Whiteley G、Wang P、Paulovich AG。辐射研究2018年2月23日。doi:10.1667/RR14963.1。[印刷前Epub]


分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
6500 QTRAP(Sciex)
内部标准
合成肽
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
C端子K处的13C和15N
信用证
超纳米液晶2D+(Eksigent)
色谱柱填料
复制Sil-Pur C18-AQ 3um
立柱尺寸
100 x 0.075毫米
流速
300微升/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
9岁(1+) 30.4 11.9 7.6 39.9 14.3 14 50.2 18.6 15.9 15 15 15
8岁(1+) 19.6 8.8 7.7 23.6 14.3 8.4 30.7 16.8 11.4 15 15 15
7岁(1+) 24.7 14.6 11.8 27.3 19.1 13.2 36.8 24 17.7 15 15 15
y6(1+) 44.6 17.3 8.3 46.8 26.1 10.5 64.6 31.3 13.4 15 15 15
总和 17.5 4.9 4.8 22.8 10.9 7.4 28.7 12 8.8 15 15 15


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