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引用CPTAC分析门户时，请包括以下声明
我们感谢美国国家癌症研究所临床蛋白质组肿瘤分析联盟（CPTAC）分析门户网站（assesss.Cancer.gov）用于开发分析并建立本出版物中所述分析的标准。

VCP公司

上次化验 下一步化验
可用分析

概述数据来源：UniProt

官方基因符号 其他别名
VCP公司 不适用
序列长度（AA） 分子量（Da）
806 89322
蛋白质名称
过渡性内质网ATP酶
来源
UniProt公司
磷化SitePlus®
基因卡 		人类蛋白质阿特拉斯

蛋白质序列悬停以查看完整序列

10 20 30 40 50
马萨诸塞州 DLSTAILKQK公司 NRPNRLIVDE公司 AINEDNSVSS公司 LSQPKMDELQ
60 70 80 90 100
LFRGDTVLLK公司 GKKRREAVCI公司 VLSDDTCSDE系统 KIRMNRVVRN公司 非直瞄无线电L（左）G公司D类V（V）我
110 120 130 140 150
S公司我问P（P）C类P（P）D类V（V）K（K）Y（Y） GKRIHVLPID公司 DTVEGITGNL公司 FEVYLKPYFL公司 EAYRPIRKGD公司
160 170 180 190 200
IFLVRGGMRA公司 VEFKVVETDP公司 SPYCIVAPDT公司 VIHCEGEPIK公司 REDEEESLNE公司
210 220 230 240 250
VGYDDIGGCR公司 KQLAQIKEMV公司 ELPLRHPALF公司 KAIGVKPPRG公司 伊利诺伊州
260 270 280 290 300
KTLIARAVAN公司 埃加夫林 GPEIMSK公司L（左）A类G公司 E类S公司E类S公司N个L（左）R（右）KAF公司 EEAEKNAPAI公司
310 320 330 340 350
IFIDELDAIA公司 PKREKTHGEV公司 ERRIVSQLLT公司 LMDGLKQRAH公司 VIVMAATNRP公司
360 370 380 390 400
NSIDPALRRF公司 GRF修订版 IPDATGRLEI公司 LQIHTKNMKL公司 ADDVDLEQVA公司
410 420 430 440 450
NETHGHVGAD公司 LAALCSEAL公司 克尔克姆德里 DLEDETIDAE（DLEDETIAE） VMNSLAVTMD公司
460 470 480 490 500
DFR公司W公司A类L（左）S公司问S公司N个 P（P）S公司A类L（左）R（右）ETVVE公司 VPQVTWEDIG公司 GLEDVKRELQ公司 低压型高压
510 520 530 540 550
DKFLKFGMTP公司 SKGVLFYGPP公司 GCGKTLLAKA公司 IANECQANFI公司 SIKGPELLTM公司
560 570 580 590 600
WFGESEANVR公司 EIFDKARQAA公司 PCVLFFDELD公司 SIAKARGGNI公司 GDGGGAADRV公司
610 620 630 640 650
INQILTEMDG公司 MSTKNVFII公司 GATNRPDIID协议 PAILRPGRLD公司 QLIYIPLPDE公司
660 670 680 690 700
KSRVAILKAN公司 LRKSPVAKDV公司 DLEFLAKMTN公司 GFSGADLTEI公司 CQRACKLAIR公司
710 720 730 740 750
ESIESIRRE公司 RERQTNPSAM公司 EVEEDDPVPE公司 伊尔德费姆 RFARRSVSDN公司
760 770 780 790 800
DIRKYEMFAQ公司 TLQQSRGFGS公司 FRFPSGNQGG公司 AGPSQGSGGG公司 TGGSVYTEDN公司
806
DDDLYG公司

数据来源：UniProt

蛋白质图谱 折叠蛋白图

靶向肽分析物相对于SNP、异构体和PTM的位置

Uniprot公司数据库登录 磷网站+®

单击节点上的点
查看下面的详细分析信息
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磷酸化 乙酰化 泛素化 其他

加载

装载机

CPTAC-295的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源：全景

官方基因符号
VCP公司
肽修饰顺序
LGDVISIQPC[+57.0]PDVK公司
修改类型
氨基甲基半胱氨酸
蛋白质-修饰位点
105
肽-修饰位点
10
肽开始
96
肽末端
109
CPTAC标识
CPTAC-295型
肽分子质量
1,539.7967
物种
人类 智者 （人类）
分析类型
直接MRM
矩阵
细胞系裂解液池
提交实验室
弗雷德·哈钦森癌症研究中心
提交实验室PI
阿曼达·保罗维奇

出版物

查看详细信息 （在新窗口中打开）

证明大规模开发标准化分析以量化人类蛋白质的可行性。Kennedy JJ、Abbatiello SE、Kim K、Yan P、Whiteaker JR、Lin C、Kim JS、Zhang Y、Wang X、Ivey RG、Zhao L、Min H、Lee Y、Yu MH、Yang EG、Lee C、Wang P、Rodriguez H、Kim Y、Carr SA、Paulovich AG。Nat方法2014年2月；11(2):149-55. doi:10.1038/nmeth.2763。Epub 2013年12月8日。PMID:24317253

化验参数 折叠分析参数

数据来源：全景

仪器
5500个QTRAP（ABSCIEX）
内部标准
肽
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
13摄氏度，15牛顿度
信用证
nanoLC-Ultra 2D，cHiPLC-nanoflex（Eksigent）
色谱柱填料
ChromXP C18-CL，3微米，120A
立柱尺寸
150 x 0.075毫米
流速
500 nL/分钟

色谱图

数据来源：全景

放大视图形象
放大视图形象
放大视图形象

响应曲线

数据来源：全景

放大视图形象
放大视图形象
看法放大图像

检索数据

装载机

可重复性

数据来源：全景

放大视图形象
  平均批内CV
（天内CV）		 平均层间CV
（日间CV）		 总CV
方程式		 n个=
碎片/过渡 低 医学 高 低 医学 高 低 医学 高 低 医学 高
y10（1+） 7.1 6.8 8.8 11.2 9 7.4 13.3 11.3 11.5 15 25 15
9岁（1+） 4.8 5.9 9.5 10.1 8.1 9.4 11.2 10 13.4 15 25 15
7岁（1+） 16.8 7.7 8.2 16.1 8.5 9 23.3 11.5 12.2 15 25 15
总和 5.3 6.2 8.9 9.2 8.1 8.6 10.6 10.2 12.4 15 25 15

其他资源和评论

资源
下载SOP
在中查看肽展开图
查看蛋白质展开图
评论

CPTAC-296的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源：全景

官方基因符号
VCP公司
肽顺序
WALSQSNPSALR公司
修改类型
未修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
不适用
肽开始
454
肽末端
465
CPTAC标识
CPTAC-296型
肽分子质量
1,328.6837
物种
人类 智者 （人类）
分析类型
直接MRM
矩阵
细胞系裂解液池
提交实验室
弗雷德·哈钦森癌症研究中心
提交实验室PI
阿曼达·保罗维奇

出版物

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证明大规模开发标准化分析以量化人类蛋白质的可行性。Kennedy JJ、Abbatiello SE、Kim K、Yan P、Whiteaker JR、Lin C、Kim JS、Zhang Y、Wang X、Ivey RG、Zhao L、Min H、Lee Y、Yu MH、Yang EG、Lee C、Wang P、Rodriguez H、Kim Y、Carr SA、Paulovich AG。Nat方法2014年2月；11(2):149-55. doi:10.1038/nmeth.2763。Epub 2013年12月8日。PMID:24317253

分析参数 折叠分析参数

数据来源：全景

仪器
5500个QTRAP（ABSCIEX）
内部标准
肽
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
13摄氏度，15牛顿度
液晶显示器
nanoLC-Ultra 2D，cHiPLC-nanoflex（Eksigent）
色谱柱填料
ChromXP C18-CL，3微米，120A
立柱尺寸
150 x 0.075毫米
流速
500 nL/分钟

色谱图

数据来源：全景

放大视图形象
放大视图形象
放大视图形象

响应曲线

数据来源：全景

放大视图形象
放大视图形象
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检索数据

装载机

可重复性

数据来源：全景

放大视图形象
  平均批内CV
（CV日内）		 平均层间CV
（日间CV）		 总CV
方程式		 n个=
碎片/过渡 低 医学 高 低 医学 高 低 医学 高 低 医学 高
y10（1+） 5.8 5.7 5.2 8.9 9.9 8.3 10.6 11.4 9.8 15 25 15
9岁（1+） 7.7 6.2 4.4 8.2 8.1 7.9 11.2 10.2 9 15 25 15
7岁（1+） 8.5 7.1 4.1 9.1 9.4 7.8 12.5 11.8 8.8 15 25 15
总和 4.9 4.9 4.1 6.4 8.3 7.8 8.1 9.6 8.8 15 25 15

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非CPTAC-4013的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源：全景

官方基因符号
Vcp（最大持续功率）
肽顺序
LAGESESNLR公司
修改类型
未修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
不适用
肽开始
278
肽末端
287
CPTAC标识
非CPTAC-4013
肽分子质量
1,074.5306
物种
穆斯 肌肉 （鼠标）
化验类型
直接MRM
矩阵
等离子
提交实验室
UVic-Genome BC蛋白质组学中心
提交实验室PI
克里斯托夫·博切尔斯

出版物

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使用500多反应监测质谱血浆分析对实验室小鼠菌株进行分子表型分析。Michaud SA、Sinclair NJ、PetrošováH、Palmer AL、Pistawka AJ、Zhang S、Hardie DB、Mohammed Y Eshghi A1、Richard VR、Sickmann A、Borchers CH.Commun Biol。2018年6月27日；1:78. doi:10.1038/s42003-018-0087-6。2018年电子采集。

分析参数 折叠分析参数

数据来源：全景

仪器
安捷伦6490/6495 QQQ
内部标准
合成肽
肽标准纯度
>80%
肽标准标签类型
C端子R处的13C和15N
信用证
1290 LC（安捷伦）
色谱柱填料
Zorbax Eclipse Plus C18，1.8µm
立柱尺寸
2.1 x 150毫米
流速
400微升/分钟

色谱图

数据来源：全景

放大视图形象
放大视图形象
放大视图形象

响应曲线

数据来源：全景

放大视图形象
放大视图形象
看法放大图像

检索数据

装载机

可重复性

数据来源：全景

放大视图形象
  平均内部CV
（CV日内）		 平均层间CV
（日间CV）		 总CV
方程式		 n个=
碎片/过渡 低 医学 高 低 医学 高 低 医学 高 低 医学 高
b3（1+） 28.5 5.9 10.2 27.7 9.6 10.5 39.7 11.3 14.6 15 15 15
y4（1+） 21.2 6.8 8.3 23.8 7.9 9.7 31.9 10.4 12.8 15 15 15
y6（1+） 15.6 7.1 7 15.5 6.9 7.4 22 9.9 10.2 15 15 15
8岁（1+） 7.6 6.5 4.9 13.2 9.9 6.2 15.2 11.8 7.9 15 15 15
9岁（1+） 22.8 8.1 7.2 32.5 10.2 10 39.7 13 12.3 15 15 15
总和 5 4.1 3.7 13.7 6.8 5 14.6 7.9 6.2 15 15 15

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