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引用CPTAC分析门户时,请包括以下声明
我们感谢美国国家癌症研究所临床蛋白质组肿瘤分析联盟(CPTAC)分析门户网站(assesss.Cancer.gov)用于开发分析并建立本出版物中所述分析的标准。

概述数据来源:UniProt

官方基因符号 其他别名
GSS公司 不适用
序列长度(AA) 分子量(Da)
474 52385
蛋白质名称
谷胱甘肽合成酶
来源
UniProt公司
磷化SitePlus®
基因卡
人类蛋白质阿特拉斯

蛋白质序列悬停以查看完整序列

10 20 30 40 50
MATNWGSLLQ公司 DKQQLEELAR公司 QAVDRALAEG公司 VLLRTSQEPT公司 SSEVVSYAPF公司
60 70 80 90 100
TLFPSLVPSA公司 LLEQAYAVQM公司 DFNLLVDAVS公司 QNAAFLEQTL公司 SSTIKQDDFT公司
110 120 130 140 150
ARLFDIHKQV公司 斯里兰卡E类A类T型V(V)F类 L(左)L(左)N个SDYMF公司 QRSADGSPAL公司 克钦蒂萨
160 170 180 190 200
SFGGLASRTP公司 AVHRHVLSVL公司 SKTKEAGKIL公司 SNNPSKGLAL公司 GIAKAWELYG公司
210 220 230 240 250
斯帕瓦利亚 QEKERNIFDQ公司 A类E类N个E类L(左)L(左)A类 NIHVIRRTFE公司 DISEKGSLDQ公司
260 270 280 290 300
DRRLFVDGQE公司 IAVVYFRDGY公司 MPRQYSLQNW公司 厄勒施 AAKCPDIATQ公司
310 320 330 340 350
LAGTKKVQQE公司 LSRPGMLEML公司 LPGQPEAVAR公司 LRATFAGLYS公司 LDVGEEGDQA公司
360 370 380 390 400
IAEALAAPSR公司 FVLKPQREGG公司 全球导航卫星系统 QALKQLKDSE公司 ERASYILMEK公司
410 420 430 440 450
IEPEPFENCL公司 LRPGSPARVV系列 QCISELGIFG公司 VYVRQEKTLV公司 MNKHVGHLLR公司
460 470 474
TKAIEHADGG公司 VAAGVAVLDN公司 PYPV公司

数据来源:UniProt


蛋白质图谱 折叠蛋白图

靶向肽分析物相对于SNP、异构体和PTM的位置

Uniprot公司数据库登录 磷网站+®

单击节点上的点
查看下面的详细分析信息
所有其他点链接到 UniProt公司



磷酸化 乙酰化 泛素化 其他

加载

装载机

CPTAC-211的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
GSS公司
顺序
艾内拉
修改类型
未修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
不适用
肽开始
222
肽末端
230
CPTAC标识
CPTAC-211型
肽分子质量
1,027.5662
物种
人类 智者 (人类)
分析类型
直接MRM
矩阵
细胞系裂解液池
提交实验室
弗雷德·哈钦森癌症研究中心
提交实验室PI
阿曼达·保罗维奇

出版物

查看详细信息 (在新窗口中打开)

证明大规模开发标准化分析以量化人类蛋白质的可行性。Kennedy JJ、Abbatiello SE、Kim K、Yan P、Whiteaker JR、Lin C、Kim JS、Zhang Y、Wang X、Ivey RG、Zhao L、Min H、Lee Y、Yu MH、Yang EG、Lee C、Wang P、Rodriguez H、Kim Y、Carr SA、Paulovich AG。Nat方法2014年2月;11(2):149-55. doi:10.1038/nmeth.2763。Epub 2013年12月8日。电话:24317253


分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
5500个QTRAP(ABSCIEX)
内部标准
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
13摄氏度,15牛顿度
信用证
nanoLC-Ultra 2D,cHiPLC-nanoflex(Eksigent)
色谱柱填料
ChromXP C18-CL,3微米,120A
立柱尺寸
150 x 0.075毫米
流速
500 nL/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
y6(1+) 5.4 8.7 5.4 5.4 10 6.4 7.6 13.3 8.4 15 25 15
y5(1+) 18.1 9.7 6.3 17.8 12.7 7.3 25.4 16 9.6 15 25 15
y4(1+) 11.9 11 4.1 14.9 11.3 7.2 19.1 15.8 8.3 15 25 15
总和 7.1 7.9 3.8 7.9 9.8 5.6 10.6 12.6 6.8 15 25 15


其他资源和评论

评论

CPTAC-210的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
GSS公司
顺序
EGIAQTVFLGLNR公司
修改类型
未修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
不适用
肽开始
113
肽末端
125
CPTAC标识
CPTAC-210型
肽分子质量
1,416.7725
物种
人类 智者 (人类)
分析类型
直接MRM
矩阵
细胞系裂解液池
提交实验室
弗雷德·哈钦森癌症研究中心
提交实验室PI
阿曼达·保罗维奇

出版物

查看详细信息 (在新窗口中打开)

证明大规模开发标准化分析以量化人类蛋白质的可行性。Kennedy JJ、Abbatiello SE、Kim K、Yan P、Whiteaker JR、Lin C、Kim JS、Zhang Y、Wang X、Ivey RG、Zhao L、Min H、Lee Y、Yu MH、Yang EG、Lee C、Wang P、Rodriguez H、Kim Y、Carr SA、Paulovich AG。Nat方法2014年2月;11(2):149-55. doi:10.1038/nmeth.2763。Epub 2013年12月8日。PMID:24317253


分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
5500个QTRAP(ABSCIEX)
内部标准
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
13摄氏度,15牛顿度
信用证
nanoLC-Ultra 2D,cHiPLC-nanoflex(Eksigent)
色谱柱填料
ChromXP C18-CL,3微米,120A
立柱尺寸
150 x 0.075毫米
流速
500 nL/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
8岁(1+) 8.2 10.8 7.2 13.1 14.1 12.6 15.5 17.8 14.5 15 25 15
7岁(1+) 9.1 15.2 4.7 14.7 13.9 8.9 17.3 20.6 10.1 15 25 15
y6(1+) 18.5 15.2 4.9 34.3 30.6 17.2 39 34.2 17.9 15 25 15
总和 10.7 12.9 4.8 19.2 20.1 12.2 22 23.9 13.1 15 25 15


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