显示导航→
在引用CPTAC分析门户时,请包括以下声明
我们感谢美国国家癌症研究所临床蛋白质组肿瘤分析联盟(CPTAC)分析门户网站(assesss.Cancer.gov)用于开发分析并建立本出版物中所述分析的标准。

概述数据来源:UniProt

官方基因符号 其他别名
PTK2(PTK2) FAK,FAK1
序列长度(AA) 分子量(Da)
1052 119233
蛋白质名称
粘着斑激酶1
来源
UniProt公司
磷化SitePlus®
基因卡
人类蛋白质阿特拉斯

蛋白质序列悬停以查看完整序列

10 20 30 40 50
MAAAYLDPNL公司 NHTPNSSTKT公司 HLGTGMERSP公司 GAMERVLKVF公司 HYFESNSEPT公司
60 70 80 90 100
TWASIIRHGD公司 ATDVRGIIQK公司 IVDSHKVKHV公司 ACYGFRLSHL公司 RSEEVHLHV型
110 120 130 140 150
DMGVSSVREK公司 叶拉佩尤 凯尔里尔普 KGFLNQFTED公司 KPTLNFFYQQ公司
160 170 180 190 200
VKSDYMLEIA公司 DQVDQEIALK公司 LGCLEIRRSY公司 WEMRGNALEK公司 KSNYEVLEKD公司
210 220 230 240 250
VGLKRFFPKS公司 LLDSVKAKTL公司 RKLIQQTFRQ公司 FANLREESI公司 LKFFEILSPV公司
260 270 280 290 300
YRFDKECFKC公司 ALGSSWIISV公司 ELAIGPEEGI公司 SYLTDKGCNP公司 THLADFTQVQ公司
310 320 330 340 350
TIQYSNSEDK公司 DRKGMLQLKI公司 阿加佩普尔特夫 APSLTIAENM公司 ADLIDGYCRL语言
360 370 380 390 400
VNGTSQSFII公司 RPQKEGERAL公司 PSIPKLANSE蛋白激酶 KQGMRTHAVS公司 VSETDDYAEI公司
410 420 430 440 450
IDEEDTYTMP公司 斯特戴伊奎尔 RIELGRCIGE公司 GQFGDVQGI公司 YMSPENPALA公司
460 470 480 490 500
VAIKTCKNCT公司 SDSVREKFLQ公司 EALTMRQFDH公司 PHIVKLIGVI公司 TENPVWIIME公司
510 520 530 540 550
LCTLGELRSF公司 LQVRKYSLDL公司 ASLILYAYQL公司 STALAYLESK公司 RFVHRDIAAR公司
560 570 580 590 600
NVLVSSNDCV公司 KLGDFGLSR公司Y(Y) M(M)E类D类S公司T型Y(Y)Y(Y)K(K)AS公司 KGKLPIKWMA公司 PESINFRRFT公司
610 620 630 640 650
SASDVWMFGV公司 CMWEILMHGV公司 KPFQGVKNND公司 维格林(VIGRIENGER) LPMPPNCPPT公司
660 670 680 690 700
LYSLMTKCWA公司 YDPSRRPRFT公司 ELK公司A类L(左)S公司T型L(左) E类E类E类K(K)AQQEER公司 MESRRQAT先生
710 720 730 740 750
VSWDSGSDE公司 应用程序 PSPRSSEGFY公司 PSPQHMVQTN公司 HYQVSGYPGS公司
760 770 780 790 800
HGITAMAGSI公司 YPGQASLLDQ公司 TDSWNHRPQE公司 IAMWQPNVED公司 STVLDLRGIG公司
810 820 830 840 850
QVLPTHLMEE公司 RLIRQQQEME公司 EDQRWLEKEE公司 RFLKPDVRLS系统 RGSIDREDGS公司
860 870 880 890 900
LQGPIGNQHI公司 YQPVGKPDPA公司 APPKKPPRPG公司 APGHLGSLAS公司 LSSPADSYNE公司
910 920 930 940 950
GVKLQPQEIS公司 PPPTANLDRS公司 NDKVYENVTG公司 LVKAVIEMSS公司 KIQPAPEEY公司
960 970 980 990 1000
VPMVKEVGLA公司 LRTLLATVDE公司 蒂普尔帕斯 REIEMAQKLL公司 NSDLGELINK公司
1010 1020 1030 1040 1050
MKLAQQYVMT公司 SLQQEYKKQM公司 LTAAHALAVD公司 AKNLLDVIDQ公司 ARLKMLGQTR公司
1052
酸碱度

数据来源:UniProt


蛋白质图谱 折叠蛋白图

靶向肽分析物相对于SNP、异构体和PTM的位置

Uniprot公司数据库登录 磷网站+®

单击节点上的点
查看下面的详细分析信息
所有其他点链接到 UniProt公司



磷酸化 乙酰化 泛素化 其他

加载

装载机

CPTAC-1785的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
PTK2(PTK2)
肽修饰顺序
YMEDSTY[+80.0]YK公司
修改类型
磷(Y)
蛋白质-修饰位点
576
肽-修饰位点
7
肽开始
570
肽末端
578
CPTAC标识
CPTAC-1785
肽分子质量
1278.4516年
物种
人类 智者 (人类)
分析类型
直接PRM
矩阵
大肠杆菌裂解物
提交实验室
约翰·霍普金斯大学/潘迪
提交实验室PI
阿克希利什·潘迪

分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
Orbitrap Fusion Lumos公司
内部标准
100亿摩尔
肽标准纯度
原油(~60%)
肽标准标签类型
C端子K处的13C和15N
信用证
Easy nLC 1200系统
色谱柱填料
C18 2微米100A
立柱尺寸
内径75微米x 50厘米
流速
300 nl/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
y5(1+) 58.7 8.5 5.4 59.4 9.3 5.9 83.5 12.6 8 15 15 15
y2(1+) 173.2 17.7 12.2 175.4 17.3 9.9 246.5 24.8 15.7 15 15 15
b2(1+) 124.7 16.5 7.7 117 20.1 7.2 171 26 10.5 15 15 15
y6(1+) 46.2 10.7 5.2 49.1 15.7 5.6 67.4 19 7.6 15 15 15
7岁(1+) 33.3 8.2 4.9 50.4 8.5 5.2 60.4 11.8 7.1 15 15 15
y3(1+) 107.8 16.6 8 97.7 15.5 8.2 145.5 22.7 11.5 15 15 15
总和 25.6 4.8 2.6 25.2 6.1 2.6 35.9 7.8 3.7 15 15 15


其他资源和评论

评论

CPTAC-2852的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
PTK2(PTK2)
顺序
aqlstileek公司
修改类型
未修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
不适用
肽开始
674
肽末端
684
CPTAC标识
CPTAC-2852型
肽分子质量
1,259.6609
物种
人类 Sapiens公司
分析类型
直接PRM
矩阵
肿瘤消化
提交实验室
圣路易斯华盛顿大学
提交实验室PI
里德·汤森

分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
ThermoFisher,Q-Exactive公司
内部标准
柱上25 fmol
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
C端子K处的13C和15N
信用证
Easy-nLC 1000 Thermo Scientific公司
色谱柱填料
第18页
立柱尺寸
75微米x 50厘米
流速
300 nL/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
7岁(1+) 11.4 4.7 3.7 12.9 6.6 4.4 17.2 8.1 5.7 15 15 15
y5(1+) 8.1 3.7 2.4 12.8 6.1 4.3 15.1 7.1 4.9 15 15 15
y4(1+) 11.9 4.4 2.3 14.4 7.1 4.6 18.7 8.4 5.1 15 15 15
总和 7.6 3.8 2.1 12 6.1 4 14.2 7.2 4.5 15 15 15


其他资源和评论

评论