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引用CPTAC分析门户时,请包括以下声明
我们感谢美国国家癌症研究所临床蛋白质组肿瘤分析联盟(CPTAC)分析门户网站(assesss.Cancer.gov)用于开发分析并建立本出版物中所述分析的标准。

概述数据来源:UniProt

官方基因符号 其他别名
ASS1系统 自动装配系统
序列长度(AA) 分子量(Da)
412 46530
蛋白质名称
精氨酸琥珀酸合成酶
来源
UniProt公司
磷化SitePlus®
基因卡
人类蛋白质阿特拉斯

蛋白质序列悬停以查看完整序列

10 20 30 40 50
MSSKGSVVLA公司 YSGGLDTSCI公司 LVWLKEQGYD公司 维亚兰尼 KEDFEEARKK公司
60 70 80 90 100
ALKLGAKKVF公司 IEDVSREFVE公司 EFIWPAIQSS公司 ALYEDRYLLG公司 TSLARPCIAR公司
110 120 130 140 150
KQVEIAQREG公司 AKYVSHGATG公司 KGNDQVR公司F类E类L(左) S公司C类Y(Y)S公司L(左)一个P(P)K VIAPWRMPEF公司
160 170 180 190 200
YNRFKGRNDL公司 MEYAKQHGIP公司 IPVTPKNPWS公司 MDENLMHISY公司 EAGILENPKN公司
210 220 230 240 250
QAPPGLYTKT公司 QDPAK公司一个P(P)N个T型P(P) D类L(左)E类E类F类K公斤 VPVKVTNVKD公司 GTTHQTSLEL公司
260 270 280 290 300
FMYLNEVAGK公司 HGVGRIDIVE公司 NRFIGMKSRG公司 IYETPAGTIL公司 伊哈利迪亚夫
310 320 330 340 350
TMDREVRKIK公司 QGLGLKFAEL公司 VYTGFWHSPE公司 CEFVRHCIAK公司 SQERVEGKVQ公司
360 370 380 390 400
VSVLKGQVYI公司 勒格雷斯利 NEELVSMNVQ公司 GDYEPTDATG公司 FININSLRLK公司
410 412
EYHRLQSKVT公司 阿拉斯加州

数据来源:UniProt


蛋白质图谱 折叠蛋白质图谱

靶向肽分析细胞相对于SNPs、异构体和PTM的位置

Uniprot公司数据库登录 磷网站+®

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磷酸化 乙酰化 泛素化 其他

加载

装载机

CPTAC-170的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
ASS1系统
顺序
APNTPDILEIEFK公司
修改类型
未修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
不适用
肽开始
216
肽末端
228
CPTAC标识
CPTAC-170型
肽分子质量
1,485.7715
物种
人类 智者 (人类)
化验类型
直接MRM
矩阵
细胞系裂解液池
提交实验室
弗雷德·哈钦森癌症研究中心
提交实验室PI
阿曼达·保罗维奇

出版物

查看详细信息 (在新窗口中打开)

证明大规模开发标准化分析以量化人类蛋白质的可行性。Kennedy JJ、Abbatiello SE、Kim K、Yan P、Whiteaker JR、Lin C、Kim JS、Zhang Y、Wang X、Ivey RG、Zhao L、Min H、Lee Y、Yu MH、Yang EG、Lee C、Wang P、Rodriguez H、Kim Y、Carr SA、Paulovich AG。Nat方法2014年2月;11(2):149-55。doi:10.1038/nmeth.2763。Epub 2013年12月8日。PMID:24317253


分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
5500个QTRAP(ABSCIEX)
内部标准
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
13摄氏度,15牛顿度
信用证
nanoLC-Ultra 2D,cHiPLC-nanoflex(Eksigent)
色谱柱填料
ChromXP C18-CL,3微米,120A
立柱尺寸
150 x 0.075毫米
流速
500 nL/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
y10(1+) 20.7 14.2 9.8 25.7 27.5 23.4 33 30.9 25.4 15 25 15
9岁(1+) 14.6 11.2 7.5 33.2 26.7 25.6 36.3 29 26.7 15 25 15
y6(1+) 51.7 12.1 17 64.9 24.6 28.3 83 27.4 33 15 25 15
总和 16.7 10.2 7.8 33.9 26.2 25.1 37.8 28.1 26.3 15 25 15


其他资源和评论

评论

CPTAC-169的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
ASS1系统
肽修饰顺序
FELSC[+57.0]YSLAPQIK公司
修改类型
氨基甲基半胱氨酸
蛋白质-修饰位点
132
肽-修饰位点
5
肽开始
128
肽末端
140
CPTAC标识
CPTAC-169型
肽分子质量
1,554.7752
物种
人类 智者 (人类)
分析类型
直接MRM
矩阵
细胞系裂解液池
提交实验室
弗雷德·哈钦森癌症研究中心
提交实验室PI
阿曼达·保罗维奇

出版物

查看详细信息 (在新窗口中打开)

证明大规模开发标准化检测方法以量化人类蛋白质的可行性。Kennedy JJ、Abbatiello SE、Kim K、Yan P、Whiteaker JR、Lin C、Kim JS、Zhang Y、Wang X、Ivey RG、Zhao L、Min H、Lee Y、Yu MH、Yang EG、Lee C、Wang P、Rodriguez H、Kim Y、Carr SA、Paulovich AG。Nat方法2014年2月;11(2):149-55. doi:10.1038/nmeth.2763。Epub 2013年12月8日。PMID:24317253


分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
5500个QTRAP(ABSCIEX)
内部标准
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
13摄氏度,15牛顿度
信用证
nanoLC-Ultra 2D,cHiPLC-nanoflex(Eksigent)
色谱柱填料
ChromXP C18-CL,3微米,120A
立柱尺寸
150 x 0.075毫米
流速
500 nL/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均批内CV
(天内CV)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
y10(1+) 11 5.9 16.6 13.1 9.8 15.7 17.1 11.4 22.8 15 25 15
9岁(1+) 12.1 6.5 14.3 13.4 8.3 15.3 18.1 10.5 20.9 15 25 15
8岁(1+) 16.2 5.9 15 16.4 9.6 15.3 23.1 11.3 21.4 15 25 15
总和 7.3 5.1 14.9 11.3 8.8 14.9 13.5 10.2 21.1 15 25 15


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