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引用CPTAC分析门户时,请包括以下声明
我们感谢美国国家癌症研究所临床蛋白质组肿瘤分析联盟(CPTAC)分析门户网站(assesss.Cancer.gov)用于开发分析并建立本出版物中所述分析的标准。

概述数据来源:UniProt

官方基因符号 其他别名
PDGFRB公司 PDGFR、PDGFR1
序列长度(AA) 分子量(Da)
1106 123968
蛋白质名称
血小板衍生生长因子受体β
来源
UniProt公司
磷化SitePlus®
基因卡
人类蛋白质阿特拉斯

蛋白质序列悬停以查看完整序列

10 20 30 40 50
LPGAMPAL先生 ALKGELLLS公司 LLLLL EPQIS公司 QGLVVTPPGPG项目 ELVLNVSSTF公司
60 70 80 90 100
VLTCSGSAPV公司 VWERMSQEPP公司 QEMAKAQDGT公司 FSSVLTLTNL公司 TGLDTGEYFC公司
110 120 130 140 150
THNDSRGLET公司 DERKRLYIFV公司 PDPTVGFLPN公司 DAEELFIFLT公司 EITEITIPCR公司
160 170 180 190 200
VTDPQLVVTL公司 赫克格德瓦普 VPYDHQRGFS公司 GIFEDRSYIC公司 KTTIGDREVD公司
210 220 230 240 250
SDAYYVYRLQ公司 VSSINVSVNA公司 VQTVVRQGEN公司 ITLMCIVIGN公司 EVVNFEWTYP公司
260 270 280 290 300
RKESGRLVEP公司 VTDFLLDMPY公司 HIRSILHIPS公司 AELEDSGTYT公司 CNVTESVNDH公司
310 320 330 340 350
QDEKAINITV公司 VESGYVR公司L(左)L(左)G公司 E类V(V)G公司T型L(左)F类A类E类L(左) H(H)R(右)SRTLQVVF公司 EAYPPPTVLW公司
360 370 380 390 400
FKDNRTLGDS公司 Sageialster公司 NVSETRYVSE公司 LTLVRVKVAE公司 AGHYTMRAFH公司
410 420 430 440 450
EDAEVQLSFQ公司 LQINVPVRVL公司 ELSESHPDSG公司 EQTVRCRGRG公司 MPQPNIIWSA公司
460 470 480 490 500
CRDLKRCPRE公司 LPPTLLGNSS公司 EEESQLETNV公司 泰威QEFE VVSTLRLQHV公司
510 520 530 540 550
DRPLSVRCTL公司 RNAVGQDTQE VIVVPHSLPF病毒 KVVVISAILA公司 LVVLTIISLI公司
560 570 580 590 600
ILIMLWQKKP公司 RYEIRWKVIE公司 SVSSDGHEYI公司 YVDPMQLPYD公司 STWELPRDQL公司
610 620 630 640 650
VLGRTLGSGA公司 FGQVVEATAH公司 GLSHSQATMK公司 VAVKMLKSTA公司 RSSEKQALMS公司
660 670 680 690 700
ELKIMSHLGP公司 HLNVVLLGA公司 CTK公司G公司G公司P(P)Y(Y) T型E类Y(Y)C类R(右)YGDLV公司 DYLHRNKHTF公司
710 720 730 740 750
LQHHSDKRRP公司 PSAELYSNAL公司 PVGLPLPSHV公司 SLTGESDGGY公司 MDMSKDESVD公司
760 770 780 790 800
YVPMLDMKGD公司 VKYADIESSN公司 YMAPYDNYVP公司 SAPERTCRAT公司 管线PVLSY
810 820 830 840 850
MDLVGFSYQV公司 安格梅FLASK NCVHRDLAAR公司 NVLICEGKLV公司 基德福格拉德
860 870 880 890 900
IMRDSNYISK公司 GSTFLPLKWM公司 阿佩西夫斯利 TTLSDVWSFG公司 ILLWEIFTLG公司
910 920 930 940 950
GTPYPELPMN公司 EQFYNAIKRG公司 YRMAQPAHAS公司 DEIYEIMQKC公司 周FEIRPP
960 970 980 990 1000
FSQLVLLER公司 LLGEGYKKY公司 QQVDEEFLRS公司 DHPAILRSQA公司 RLPGFHGLRS公司
1010 1020 1030 1040 1050
PLDTSSVLYT公司 AVQPNEGND(平均值) YIIPLPDPKP公司 EVADEGPLEG公司 SPSLASSTLN公司
1060 1070 1080 1090 1100
EVNTSSTISC公司 DSPLEPQDEP公司 EPEPQLELQV公司 EPEPELEQLP公司 DSGCPAPRAE公司
1106
AEDSFL公司

数据来源:UniProt


蛋白质图谱 折叠蛋白图

靶向肽分析物相对于SNP、异构体和PTM的位置

Uniprot公司数据库登录 磷网站+®

单击节点上的点
查看下面的详细分析信息
所有其他点链接到 UniProt公司



磷酸化 乙酰化 泛素化 其他

加载

装载机

CPTAC-1630的含量测定细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
PDGFRB公司
顺序
LLGEVGTLQFAELHR有限责任公司
修改类型
未修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
不适用
肽开始
318
肽末端
332
CPTAC标识
CPTAC-1630型
肽分子质量
1,681.9152
物种
人类 智者 (人类)
分析类型
直接MRM或SRM
矩阵
卵巢癌肿瘤组织裂解物
提交实验室
太平洋西北国家实验室
提交实验室PI
刘涛(Tao Liu)

分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
TSQ华帝
内部标准
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
C端子R处的13C和15N
液晶显示器
Waters nanoACQUITY(零件号176016000)
色谱柱填料
Waters BEH C18,1.7 um 130º(零件号186007485)
立柱尺寸
100微米x 100毫米
流速
0.5微升/分钟

分析复用 展开分析面板

太平洋西北国家实验室-方向SRM3

CPTAC-1593:
ABI2公司。
阿尔夫森纳
CPTAC-1594:
ALDH2。
醋酸乙烯酯
CPTAC-1595:
ANP32B。
ELVLDNC[+57.0]克
CPTAC-1596:
AP1B1。
LLSTDPVAAK公司
CPTAC-1597:
ARPC2。
VFMGEFK(VFMQEFK)
CPTAC-1598:
BRD2。
LMFSNC[+57.0]YK公司
CPTAC-1599:
CDH1。
GLDARPEVTR公司
CPTAC-1600:
CBX3。
DSDEADLVLAK公司
CPTAC-1601:
CDC42。
NVFDEAILAALEPPK公司
CPTAC-1602:
CDK9。
IGQGTFGEVFK公司
CPTAC-1603:
C20或27。
LLSVVPVPEGYSVK公司
CPTAC-1604:
文档2。
迪尔普维特克
CPTAC-1605:
EHD2。
腿板
CPTAC-1606:
EML1。
VQMQEDDIQLK公司
CPTAC-1607:
ENY2。
ALVPDSVK公司
CPTAC-1608:
图1:。
GILLFGPPGTGK公司
CPTAC-1609:
GRB2。
阿塔代尔斯夫克
CPTAC-1610:
GTPBP1。
VGDNDFLEVR公司
CPTAC-1611:
C15或38-AP3S2。
TGASWTDNIMAQK公司
CPTAC-1612:
HM13。
SFEAPIK公司
CPTAC-1613:
EPHX1。
DVELLYPVK公司
CPTAC-1614:
ITGA1。
FGTAIAAVK公司
CPTAC-1615:
PRKCA公司。
GTEELYAIK公司
CPTAC-1616:
LNPK公司。
IVEYLVGDGPQNR公司
CPTAC-1617:
LRP1。
阿尔斯甘夫利克
CPTAC-1618:
MCM2。
格拉拉夫格普克
CPTAC-1619:
MTA1。
YQADITDLLK公司
CPTAC-1620:
千年虫。
TLVTLEQSR公司
CPTAC-1621:
NEK7。
VQIFDLMDAK公司
CPTAC-1622:
NF1。
LVFIDC[+57.0]PGK公司
CPTAC-1623:
FAM129A。
VLTSEDEYNLLSDR公司
CPTAC-1624:
NMRAL1。
LGFPGAR公司
CPTAC-1625:
OSBPL10。
LLEHGEEYVFTLPSAYAR公司
CPTAC-1626:
PIK3R1。
TATGYGFAEPYNLYSSLK公司
CPTAC-1627:
帕金森2。
AIYHDLEQSIR公司
CPTAC-1628:
第2页。
SVIDPVPAPVGDSHVDGAAK公司
CPTAC-1629:
PELP1。
TGSAVAPVHPPNR公司
CPTAC-1630:
PDGFRB。
LLGEVGTLQFAELHR有限责任公司
CPTAC-1631:
PIK3CA公司。
LINLTDILK公司
CPTAC-1632:
ARL6IP5。
AWDDFFPGSDR
CPTAC-1633:
RNF121。
长城汽车[+57.0]IVGK
CPTAC-1634:
波兰。
HFVGILNK公司
CPTAC-1635:
PDCD11。
VTPNEGLTVSFPFGK公司
CPTAC-1636:
SMARCA5。
TEQEEDELLTESSK公司
CPTAC-1637:
SSBP1。
SGDSEVYQLGDVSQK公司
CPTAC-1638:
STAT5B。
ATQLLEGLVQELQK公司
CPTAC-1639:
统计6。
SVSWSQFNK公司
CPTAC-1640:
STRN(弹簧)。
SELTDSASVLDNFK公司
CPTAC-1641:
SVIL公司。
YGSFEEASYPILNR公司
CPTAC-1642:
VARS公司。
NVIHPFLSR公司
CPTAC-1643:
CCT6A。
GIDPFSLDALSK公司
CPTAC-1644:
TGM2。
赛格泰克[+57.0]C[+57.0]GPVPVR
CPTAC-1645:
TIA1。
AAFAPFGR公司
CPTAC-1646:
TMEM43。
LEDPHVDIIR公司
CPTAC-1647:
TRA2A公司。
YGPLSGVNVYDQR公司

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
y6(1+) 9.4 2.2 3.2 18.4 6.3 7.1 20.7 6.7 7.8 15 15 15
8岁(1+) 12.4 4.4 4.5 16.3 6.2 5.7 20.5 7.6 7.3 15 15 15
y10(1+) 14.1 5.6 5.1 19.9 9.9 8.9 24.4 11.4 10.3 15 15 15
总和 6.8 1.9 2.6 15.2 6.4 5.9 16.7 6.7 6.4 15 15 15


其他资源和评论

评论

CPTAC-3063的含量测定细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
PDGFRB公司
肽修饰顺序
GGPIYIITEYC[+57.0]R公司
修改类型
甲酰胺(C)
蛋白质-修饰位点
685
肽-修饰位点
11
肽开始
674
肽末端
685
CPTAC标识
CPTAC-3063型
肽分子质量
1,440.7071
物种
人类 智者
分析类型
直接MRM或SRM
矩阵
肿瘤消化
提交实验室
圣路易斯华盛顿大学
提交实验室PI
里德·汤森

分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
赛默飞世尔,Q-Exactive
内部标准
柱上25 fmol
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
C端子R处的13C和15N
液晶显示器
Easy-nLC 1000 Thermo Scientific公司
色谱柱填料
第18号
立柱尺寸
75微米x 50厘米
流速
300 nL/分钟

分析复用 展开分析面板

太平洋西北国家实验室-方向SRM3

CPTAC-1593:
ABI2公司。
阿尔夫森纳
CPTAC-1594:
ALDH2。
VAEQTPLTALYVANLIK公司
CPTAC-1595:
ANP32B。
ELVLDNC[+57.0]克
CPTAC-1596:
AP1B1。
LLSTDPVAAK公司
CPTAC-1597:
ARPC2。
VFMGEFK(VFMQEFK)
CPTAC-1598:
BRD2。
LMFSNC[+57.0]YK公司
CPTAC-1599:
CDH1。
天然气
CPTAC-1600:
CBX3。
DSDEADLVLAK公司
CPTAC-1601:
CDC42。
NVFDEAILAALEPPK公司
CPTAC-1602:
CDK9。
IGQGTFGEVFK公司
CPTAC-1603:
C20或27。
LLSVVPVPEGYSVK公司
CPTAC-1604:
文档2。
DILLPVITK公司
CPTAC-1605型:
EHD2。
腿板
CPTAC-1606:
EML1。
VQMQEDDIQLK公司
CPTAC-1607:
ENY2。
ALVPDSVK公司
CPTAC-1608:
图1:。
GILLFGPPGTGK公司
CPTAC-1609:
GRB2。
阿塔代尔斯夫克
CPTAC-1610:
GTPBP1。
VGDNDFLEVR公司
CPTAC-1611:
C15或38-AP3S2。
TGASWTDNIMAQK公司
CPTAC-1612:
嗯13。
SFEAPIK公司
CPTAC-1613:
EPHX1。
DVELLYPVK公司
CPTAC-1614:
ITGA1。
FGTAIAAVK公司
CPTAC-1615:
PRKCA公司。
GTEELYAIK公司
CPTAC-1616:
LNPK公司。
IVEYLVGDGPQNR公司
CPTAC-1617:
LRP1。
AALSGANVLTLIEK公司
CPTAC-1618:
MCM2。
格拉拉夫格普克
CPTAC-1619:
MTA1。
YQADITDLLK公司
CPTAC-1620:
MYO1G。
TLVTLEQSR公司
CPTAC-1621:
NEK7。
VQIFDLMDAK公司
CPTAC-1622:
NF1。
LVFIDC[+57.0]PGK公司
CPTAC-1623:
FAM129A。
VLTSEDEYNLLSDR公司
CPTAC-1624:
NMRAL1。
LGFPGAR公司
CPTAC-1625:
OSBPL10。
LLEHGEEYVFTLPSAYAR公司
CPTAC-1626:
PIK3R1。
TATGYGFAEPYNLYSSLK公司
CPTAC-1627:
帕金森2。
AIYHDLEQSIR公司
CPTAC-1628:
第2页。
SVIDPVPAPVGDSHVDGAAK公司
CPTAC-1629:
PELP1。
TGSAVAPVHPPNR公司
CPTAC-1630:
PDGFRB。
LLGEVGTLQFAELHR有限责任公司
CPTAC-1631:
PIK3CA公司。
LINLTDILK公司
CPTAC-1632:
ARL6IP5。
AWDDFFPGSDR公司
CPTAC-1633:
RNF121。
长城汽车[+57.0]IVGK
CPTAC-1634:
波兰。
HFVGILNK公司
CPTAC-1635:
PDCD11。
VTPNEGLTVSFPFGK公司
CPTAC-1636:
SMARCA5。
TEQEEDELLTESSK公司
CPTAC-1637:
SSBP1。
SGDSEVYQLGDVSQK
CPTAC-1638:
STAT5B。
ATQLLEGLVQELQK公司
CPTAC-1639:
统计6。
SVSWSQFNK公司
CPTAC-1640:
STRN(弹簧)。
SELTDSASVLDNFK公司
CPTAC-1641:
SVIL公司。
YGSFEEASYPILNR公司
CPTAC-1642:
VARS公司。
NVIHPFLSR公司
CPTAC-1643:
CCT6A。
GIDPFSLDALSK公司
CPTAC-1644:
TGM2。
赛格泰克[+57.0]C[+57.0]GPVPVR
CPTAC-1645:
TIA1。
美国食品药品监督管理局
CPTAC-1646:
TMEM43。
LEDPHVDIIR公司
CPTAC-1647:
TRA2A公司。
YGPLSGVNVYDQR公司

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
8岁(1+) 4 5 2.9 7.6 5.2 2.8 8.6 7.2 4 15 15 15
y6(1+) 2.9 5.2 2.8 6.1 5.2 3.1 6.8 7.4 4.2 15 15 15
7岁(1+) 4.1 4.8 2.6 7.2 4.7 2.7 8.3 6.7 3.7 15 15 15
总和 3.1 4.9 2.6 6.7 4.9 2.8 7.4 6.9 3.8 15 15 15


其他资源和评论

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