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引用CPTAC分析门户时,请包括以下声明
我们感谢美国国家癌症研究所临床蛋白质组肿瘤分析联盟(CPTAC)分析门户网站(assesss.Cancer.gov)用于开发分析并建立本出版物中所述分析的标准。

概述数据来源:UniProt

官方基因符号 其他别名
PRKCA公司 PKCA、PRKACA
序列长度(AA) 分子量(Da)
672 76750
蛋白质名称
蛋白激酶Cα型
来源
UniProt公司
磷化SitePlus®
基因卡
人类蛋白质阿特拉斯

蛋白质序列悬停以查看完整序列

10 20 30 40 50
MADVFPGNDS公司 TASQDVANRF公司 ARKGALRQKN公司 VHEVKDHKFI公司 ARFFKQPTFC公司
60 70 80 90 100
SHCTDFIWGF公司 GKQGFQCQVC公司 CFVVHKRCHE公司 FVTFSCPGAD公司 KGPDTDDPRS公司
110 120 130 140 150
KHKFKIHTYG公司 SPTFCDHCGS公司 LLYGLIHQGM公司 KCDTCDMNHH公司 KQCVINVPSL公司
160 170 180 190 200
CGMDHTEKRG公司 RIYLKAEVAD公司 EKLHVTVRDA公司 KNLIPMDPNG公司 LSDPYVKLKL公司
210 220 230 240 250
IPDPKNESKQ公司 KTKTIR公司S公司T型L(左)N个 P(P)N个E类S公司F类T型F类K(K) LKPSDDRR公司L(左) S公司E类D类D类R(右)T型
260 270 280 290 300
TRNDFMGSLS公司 FGVSELMKMP公司 ASGWYKLLNQ公司 EEGEYYNVPI公司 聚乙二醇
310 320 330 340 350
LRQKFEKAKL公司 GPAGNKVISP公司 SEDRKQPSNN公司 LDRVKLTDFN公司 FLMVLGKGSF公司
360 370 380 390 400
GKVMLADRK公司G公司 T型E类E类L(左)Y(Y)一个K(K)伊利诺伊州 KKDVVIQDDD公司 VECTMVEKRV公司 LALLDKPPFL公司
410 420 430 440 450
TQLHSCFQTV公司 DRLYFVMEYV公司 NGGDLMYHIQ公司 QVGKFKEPQA公司 VFYAAEISIG公司
460 470 480 490 500
LFFLHKRGII语 YRDLKLDNVM公司 LDSEGHIKIA公司 DFGMCKEHMM公司 DGVTTRTFCG公司
510 520 530 540 550
TPDYIAPEII公司 AYQPYGKSVD公司 WWAYGVLYE公司 MLAGQPPFDG公司 EDEDELFQSI公司
560 570 580 590 600
MEHNVSYPKS公司 LSKEAVSVCK公司 GLMTKHPAKR公司 LGCGPEGERD公司 VREHAFFRRI公司
610 620 630 640 650
DWEKLENREI公司 QPPFKPKVCG公司 KGAENFDKFF公司 TRGQPVLTPP项目 DQLVIANIDQ公司
660 670 672
SDFEGFSYVN公司 PQFVHPILQS公司 成人影片

数据来源:UniProt


蛋白质图谱 折叠蛋白质图谱

靶向肽分析细胞相对于SNPs、异构体和PTM的位置

Uniprot公司数据库登录 磷网站+®

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查看下面的详细分析信息
所有其他点链接到 UniProt公司



磷酸化 乙酰化 泛素化 其他

加载

装载机

CPTAC-1615的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
PRKCA公司
顺序
GTEELYAIK公司
修改类型
未修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
不适用
肽开始
360
肽末端
368
CPTAC标识
CPTAC-1615型
肽分子质量
1,022.5284
物种
人类 智者 (人类)
分析类型
直接MRM或SRM
矩阵
卵巢癌肿瘤组织裂解物
提交实验室
太平洋西北国家实验室
提交实验室PI
刘涛(Tao Liu)

分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
TSQ华帝
内部标准
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
C端子K处的13C和15N
信用证
Waters nanoACQUITY(零件号176016000)
色谱柱填料
Waters BEH C18,1.7 um 130º(零件号186007485)
立柱尺寸
100微米x 100毫米
流量
0.5微升/分钟

分析复用 展开分析面板

太平洋西北国家实验室-方向SRM3

CPTAC-1593:
ABI2公司。
阿尔夫森纳
CPTAC-1594:
ALDH2。
VAEQTPLTALYVANLIK公司
CPTAC-1595:
ANP32B。
ELVLDNC[+57.0]克
CPTAC-1596:
AP1B1。
LLSTDPVAAK公司
CPTAC-1597:
ARPC2。
VFMGEFK(VFMQEFK)
CPTAC-1598:
BRD2。
LMFSNC[+57.0]YK公司
CPTAC-1599:
CDH1。
GLDARPEVTR公司
CPTAC-1600:
CBX3。
DSDEADLVLAK公司
CPTAC-1601:
CDC42。
NVFDEAILAALEPPK公司
CPTAC-1602型:
CDK9。
IGQGTFGEVFK公司
CPTAC-1603型:
C20或27。
LLSVVPVPEGYSVK公司
CPTAC-1604:
文档2。
DILLPVITK公司
CPTAC-1605:
EHD2。
腿板
CPTAC-1606:
EML1。
VQMQEDDIQLK公司
CPTAC-1607:
ENY2。
ALVPDSVK公司
CPTAC-1608:
图1:。
GILLFGPPGTGK公司
CPTAC-1609:
GRB2。
阿塔代尔斯夫克
CPTAC-1610:
GTPBP1。
VGDNDFLEVR公司
CPTAC-1611:
C15或38-AP3S2。
TGASWTDNIMAQK公司
CPTAC-1612:
HM13。
SFEAPIK公司
CPTAC-1613:
EPHX1。
DVELLYPVK公司
CPTAC-1614:
ITGA1。
FGTAIAAVK公司
CPTAC-1615:
PRKCA公司。
GTEELYAIK公司
CPTAC-1616:
LNPK公司。
IVEYLVGDGPQNR公司
CPTAC-1617:
LRP1。
阿尔斯甘夫利克
CPTAC-1618:
MCM2。
格拉拉夫格普克
CPTAC-1619:
MTA1。
YQADITDLLK公司
CPTAC-1620:
千年虫。
TLVTLEQSR公司
CPTAC-1621:
NEK7。
VQIFDLMDAK公司
CPTAC-1622:
NF1。
左心室射血分数[+57.0]PGK
CPTAC-1623:
FAM129A。
VLTSEDEYNLLSDR公司
CPTAC-1624:
NMRAL1。
LGFPGAR公司
CPTAC-1625:
OSBPL10。
LLEHGEEYVFTLPSAYAR公司
CPTAC-1626:
PIK3R1。
TATGYGFAEPYNLYSSLK公司
CPTAC-1627:
PACSIN2。
AIYHDLEQSIR公司
CPTAC-1628:
PAK2。
SVIDPVPAPVGDSHVDGAAK公司
CPTAC-1629:
PELP1。
TGSAVAPVHPPNR公司
CPTAC-1630:
PDGFRB。
LLGEVGTLQFAELHR有限责任公司
CPTAC-1631:
PIK3CA公司。
LINLTDILK公司
CPTAC-1632:
ARL6IP5。
AWDDFFPGSDR公司
CPTAC-1633:
RNF121。
长城汽车[+57.0]IVGK
CPTAC-1634:
波兰。
HFVGILNK公司
CPTAC-1635:
PDCD11。
VTPNEGLTVSFPFGK公司
CPTAC-1636:
SMARCA5。
TEQEEDELLTESSK公司
CPTAC-1637:
SSBP1。
SGDSEVYQLGDVSQK公司
CPTAC-1638:
STAT5B。
ATQLLEGLVQELQK公司
CPTAC-1639:
统计6。
SVSWSQFNK公司
CPTAC-1640:
STRN(弹簧)。
SELTDSASVLDNFK公司
CPTAC-1641:
SVIL公司。
YGSFEEASYPILNR公司
CPTAC-1642:
VARS公司。
NVIHPFLSR公司
CPTAC-1643:
CCT6A。
GIDPFSLDALSK公司
CPTAC-1644:
TGM2。
赛格泰克[+57.0]C[+57.0]GPVPVR
CPTAC-1645:
TIA1。
AAFAPFGR公司
CPTAC-1646:
TMEM43。
LEDPHVDIIR公司
CPTAC-1647:
TRA2A公司。
YGPLSGVNVYDQR公司

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均批内CV
(天内CV)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
y4(1+) 9 6.4 5.4 14 7.6 6.7 16.6 9.9 8.6 15 15 15
y6(1+) 9.9 3.4 3.4 14.4 5.9 7.5 17.5 6.8 8.2 15 15 15
7岁(1+) 4.7 3.3 2.2 11.1 5.8 3.2 12.1 6.7 3.9 15 15 15
总和 3.9 1.9 1.9 12 5.1 4.9 12.6 5.4 5.3 15 15 15


其他资源和评论

评论

CPTAC-3173的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
PRKCA公司
顺序
lsveidwdr公司
修改类型
未修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
不适用
肽开始
240
肽末端
249
CPTAC标识
CPTAC-3173型
肽分子质量
1,317.6354
物种
人类 智者
分析类型
直接MRM或SRM
矩阵
肿瘤消化
提交实验室
圣路易斯华盛顿大学
提交实验室PI
里德·汤森

分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
赛默飞世尔,Q-Exactive
内部标准
柱上25 fmol
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
C端子R处的13C和15N
信用证
Easy-nLC 1000 Thermo Scientific公司
色谱柱填料
第18号
立柱尺寸
75微米x 50厘米
流速
300 nL/分钟

分析复用 展开分析面板

太平洋西北国家实验室-方向SRM3

CPTAC-1593:
ABI2公司。
ALFDSYTNLER公司
CPTAC-1594:
ALDH2。
VAEQTPLTALYVANLIK公司
CPTAC-1595:
ANP32B。
ELVLDNC[+57.0]克
CPTAC-1596:
AP1B1。
LLSTDPVAAK公司
CPTAC-1597:
ARPC2。
VFMGEFK(VFMQEFK)
CPTAC-1598:
BRD2。
LMFSNC[+57.0]YK公司
CPTAC-1599:
CDH1。
GLDARPEVTR公司
CPTAC-1600:
CBX3。
DSDEADLVLAK公司
CPTAC-1601:
CDC42。
NVFDEAILAALEPPK公司
CPTAC-1602:
CDK9。
IGQGTFGEVFK公司
CPTAC-1603:
C20或27。
LLSVVPVPEGYSVK公司
CPTAC-1604:
文档2。
DILLPVITK公司
CPTAC-1605:
EHD2。
腿板
CPTAC-1606:
EML1。
VQMQEDDIQLK公司
CPTAC-1607:
ENY2。
ALVPDSVK公司
CPTAC-1608:
图1:。
GILLFGPPGTGK公司
CPTAC-1609:
GRB2。
阿塔代尔斯夫克
CPTAC-1610:
GTPBP1。
VGDNDFLEVR公司
CPTAC-1611:
C15或38-AP3S2。
TGASWTDNIMAQK公司
CPTAC-1612:
HM13。
SFEAPIK公司
CPTAC-1613:
EPHX1。
DVELLYPVK公司
CPTAC-1614:
ITGA1。
FGTAIAAVK公司
CPTAC-1615:
PRKCA公司。
GTEELYAIK公司
CPTAC-1616:
LNPK公司。
IVEYLVGDGPQNR公司
CPTAC-1617:
LRP1。
阿尔斯甘夫利克
CPTAC-1618:
MCM2。
格拉拉夫格普克
CPTAC-1619:
MTA1。
YQADITDLLK公司
CPTAC-1620:
千年虫。
TLVTLEQSR公司
CPTAC-1621:
NEK7。
VQIFDLMDAK公司
CPTAC-1622:
NF1。
LVFIDC[+57.0]PGK公司
CPTAC-1623:
FAM129A。
VLTSEDEYNLLSDR公司
CPTAC-1624:
NMRAL1。
LGFPGAR公司
CPTAC-1625:
OSBPL10。
LLEHGEEYVFTLPSAYAR公司
CPTAC-1626:
PIK3R1。
TATGYGFAEPYNLYSSLK公司
CPTAC-1627:
蛋白酶2。
AIYHDLEQSIR公司
CPTAC-1628:
第2页。
SVIDPVPAPVGDSHVDGAAK公司
CPTAC-1629:
PELP1。
TGSAVAPVHPPNR公司
CPTAC-1630:
PDGFRB。
LLGEVGTLQFAELHR有限责任公司
CPTAC-1631:
PIK3CA公司。
LINLTDILK公司
CPTAC-1632:
ARL6IP5。
AWDDFFPGSDR公司
CPTAC-1633:
RNF121。
长城汽车[+57.0]IVGK
CPTAC-1634:
波兰。
HFVGILNK公司
CPTAC-1635:
PDCD11。
VTPNEGLTVSFPFGK公司
CPTAC-1636:
SMARCA5。
TEQEEDELLTESSK公司
CPTAC-1637:
SSBP1。
SGDSEVYQLGDVSQK公司
CPTAC-1638:
STAT5B。
ATQLLEGLVQELQK公司
CPTAC-1639:
统计6。
SVSWSQFNK公司
CPTAC-1640:
STRN(弹簧)。
SELTDSASVLDNFK公司
CPTAC-1641:
SVIL公司。
YGSFEEASYPILNR公司
CPTAC-1642:
VARS公司。
NVIHPFLSR公司
CPTAC-1643:
CCT6A。
GIDPFSLDALSK公司
CPTAC-1644:
TGM2。
赛格泰克[+57.0]C[+57.0]GPVPVR
CPTAC-1645:
TIA1。
AAFAPFGR公司
CPTAC-1646:
TMEM43。
LEDPHVDIIR公司
CPTAC-1647:
TRA2A公司。
YGPLSGVNVYDQR公司

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均批内CV
(天内CV)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
7岁(1+) 6.1 5.4 5.9 6.7 15 19.2 9.1 15.9 20.1 15 15 15
y5(1+) 5.3 4.8 5.5 5.6 13.9 18 7.7 14.7 18.8 15 15 15
y3(1+) 4.3 4.3 4.7 5.6 12.1 15.5 7.1 12.8 16.2 15 15 15
总和 5.1 4.8 5.3 5.7 13.7 17.7 7.6 14.5 18.5 15 15 15


其他资源和评论

评论

CPTAC-3172的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
PRKCA公司
顺序
STLNPQWNESFTFK公司
修改类型
未修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
不适用
肽开始
217
肽末端
230
CPTAC标识
CPTAC-3172型
肽分子质量
1,697.8049
物种
人类 智者
分析类型
直接MRM或SRM
矩阵
肿瘤消化
提交实验室
圣路易斯华盛顿大学
提交实验室PI
里德·汤森

分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
ThermoFisher,Q-Exactive公司
内部标准
柱上25 fmol
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
C端子K处的13C和15N
信用证
Easy-nLC 1000 Thermo Scientific公司
色谱柱填料
第18号
立柱尺寸
75微米x 50厘米
流速
300 nL/分钟

分析复用 展开分析面板

太平洋西北国家实验室-方向SRM3

CPTAC-1593:
ABI2公司。
阿尔夫森纳
CPTAC-1594:
ALDH2。
VAEQTPLTALYVANLIK公司
CPTAC-1595:
ANP32B。
ELVLDNC[+57.0]克
CPTAC-1596:
AP1B1。
LLSTDPVAAK公司
CPTAC-1597:
ARPC2。
VFMGEFK(VFMQEFK)
CPTAC-1598:
BRD2。
LMFSNC[+57.0]YK公司
CPTAC-1599:
CDH1。
GLDARPEVTR公司
CPTAC-1600:
CBX3。
DSDEADLVLAK公司
CPTAC-1601型:
CDC42。
NVFDEAILAALEPPK公司
CPTAC-1602:
CDK9。
IGQGTFGEVFK公司
CPTAC-1603:
C20或27。
LLSVVPVPEGYSVK公司
CPTAC-1604:
文档2。
DILLPVITK公司
CPTAC-1605:
EHD2。
LEGHGLPANLPR公司
CPTAC-1606:
EML1。
vqmqeddiqlk版本
CPTAC-1607:
ENY2。
ALVPDSVK公司
CPTAC-1608:
图1:。
GILLFGPPGTGK公司
CPTAC-1609:
GRB2。
阿塔代尔斯夫克
CPTAC-1610:
GTPBP1。
VGDNDFLEVR公司
CPTAC-1611:
C15或38-AP3S2。
TGASWTDNIMAQK公司
CPTAC-1612:
HM13。
SFEAPIK公司
CPTAC-1613:
EPHX1。
DVELLYPVK公司
CPTAC-1614:
ITGA1。
FGTAIAAVK公司
CPTAC-1615:
PRKCA公司。
GTEELYAIK公司
CPTAC-1616:
LNPK公司。
IVEYLVGDGPQNR公司
CPTAC-1617:
LRP1。
阿尔斯甘夫利克
CPTAC-1618:
MCM2。
格拉拉夫格普克
CPTAC-1619:
MTA1。
YQADITDLLK公司
CPTAC-1620:
千年虫。
TLVTLEQSR公司
CPTAC-1621:
NEK7。
VQIFDLMDAK公司
CPTAC-1622:
NF1。
LVFIDC[+57.0]PGK公司
CPTAC-1623:
FAM129A。
VLTSEDEYNLLSDR公司
CPTAC-1624:
NMRAL1。
LGFPGAR公司
CPTAC-1625:
OSBPL10。
LLEHGEEYVFTLPSAYAR公司
CPTAC-1626:
PIK3R1。
TATGYGFAEPYNLYSSLK公司
CPTAC-1627:
帕金森2。
AIYHDLEQSIR公司
CPTAC-1628:
第2页。
SVIDPVPAPVGDSHVDGAAK公司
CPTAC-1629:
PELP1。
TGSAVAPVHPPNR公司
CPTAC-1630:
PDGFRB。
LLGEVGTLQFAELHR有限责任公司
CPTAC-1631:
PIK3CA公司。
LINLTDILK公司
CPTAC-1632:
ARL6IP5。
AWDDFFPGSDR公司
CPTAC-1633:
RNF121。
长城汽车[+57.0]IVGK
CPTAC-1634:
波兰。
HFVGILNK公司
CPTAC-1635:
PDCD11。
VTPNEGLTVSFPFGK公司
CPTAC-1636:
SMARCA5。
TEQEEDELLTESSK公司
CPTAC-1637:
SSBP1。
SGDSEVYQLGDVSQK公司
CPTAC-1638:
STAT5B。
ATQLLEGLVQELQK公司
CPTAC-1639:
统计6。
SVSWSQFNK公司
CPTAC-1640:
STRN(弹簧)。
SELTDSASVLDNFK公司
CPTAC-1641:
SVIL公司。
YGSFEEASYPILNR公司
CPTAC-1642:
VARS公司。
NVIHPFLSR公司
CPTAC-1643:
CCT6A。
吉普夫斯达尔斯克
CPTAC-1644:
TGM2。
分段[+57.0]C[+57.0]GPVPVR
CPTAC-1645:
TIA1。
AAFAPFGR公司
CPTAC-1646:
TMEM43。
LEDPHVDIIR公司
CPTAC-1647:
TRA2A公司。
YGPLSGVNVYDQR公司

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均批内CV
(天内CV)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
y5(1+) 19.9 6.5 4.2 23.4 5.2 4.3 30.7 8.3 6 15 15 15
7岁(1+) 14.4 5 4.7 13.7 4.8 5.5 19.9 6.9 7.2 15 15 15
8岁(1+) 8.8 4.2 5.2 10.1 3.7 5.4 13.4 5.6 7.5 15 15 15
总和 11.4 4.8 4.3 11.8 3.9 4.8 16.4 6.2 6.4 15 15 15


其他资源和评论

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