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引用CPTAC分析门户时,请包括以下声明
我们感谢美国国家癌症研究所临床蛋白质组肿瘤分析联盟(CPTAC)分析门户网站(assesss.Cancer.gov)用于开发分析并建立本出版物中所述分析的标准。

概述数据来源:UniProt

官方基因符号 其他别名
CDH1型 CDHE、UVO
序列长度(AA) 分子量(Da)
882 97456
蛋白质名称
钙粘蛋白-1
来源
UniProt公司
磷化SitePlus®
基因卡
人类蛋白质阿特拉斯

蛋白质序列悬停以查看完整序列

10 20 30 40 50
MGPWSRSLSA公司 LLLLL QVSSW有限责任公司 LCQEPEPCHP公司 GFDAESYTFT公司 VPRRHLERGR公司
60 70 80 90 100
VLGRVNFEDC公司 TGRQR公司T型A类Y(Y)F类 L(左)D类T型R(右)FKVGTD公司 GVITVKRPLR公司 FHNPQIHFLV公司
110 120 130 140 150
偏航速度 STKVTLNTVG公司 HHHRPPPHQA公司 SVSGIQAELL公司 TFPNSSPGLR公司
160 170 180 190 200
RQKRDWVIPP公司 ISCPENEKGP公司 FPKNLVQIKS公司 NKDKEGKVFY公司 SITGQGADTP公司
210 220 230 240 250
PVGVFIIERE公司 TGWLKVTEPL公司 DRERIATYTL公司 FSHAVSSNGN公司 AVEDPMEILI公司
260 270 280 290 300
TVTDQNDNKP公司 EFTQEVFKGS公司 VMEGALPGTS公司 VMEVTATDAD公司 DDVNTYNAAI公司
310 320 330 340 350
AYTILSQDPE公司 LPDKNMFTIN公司 R(右)N个T型G公司V(V)V(V)V(V)T型 T型G公司L(左)D类R(右)ESFPT公司 YTLVQAADL公司
360 370 380 390 400
QGEGLSTTAT公司 阿维夫特恩德 NPPIFNPTTY公司 K(K)G公司V(V)P(P)E类N个E类A类N个 V(V)V(V)T型T型L(左)K(K)车辆防盗装置
410 420 430 440 450
ADAPNTPAWE接头 AVYTILNDDG公司 GQFVVTTNPV公司 NNDGILKTAK公司 德国劳埃德船级社D类F类E类A类K(K)Y(Y)
460 470 480 490 500
ILHVAVTNVV PFEVSLTTST公司 ATVTVDVLDV电视 NEAPIFVPPE公司 KRVEVSEDFG公司
510 520 530 540 550
VGQEITSYTA公司 QEPDTFMEQK ITYRIWRDTA公司 NWLEINPDTG公司 AISTRAELDR公司
560 570 580 590 600
EDFEHVKNST公司 YTALIIATDN公司 GSPVATGTGT公司 LLLILSDVND公司 纳皮普蒂
610 620 630 640 650
FFCERNPKPQ公司 VINIIDADLP公司 PNTSPFTAEL公司 THGASANWTI公司 QYNDPTQESI公司
660 670 680 690 700
ILKPKMALEV公司 GDYKINLKLM公司 DNQNKDQVTT公司 列夫斯维克(LEVSVCDCEG) AAGVCRKAQP公司
710 720 730 740 750
VEAGLQIPAI公司 LGILGGILAL公司 百合花 LRRRAVKEP公司 LLPPEDDTRD公司
760 770 780 790 800
NVYYYDEEGG公司 GEEDQDFDLS公司 昆士兰州G公司L(左)D类A类R(右)P(P) E类V(V)T型R(右)N个D类V(V)A类P(P)T型 L(左)M(M)V(V)P(P)R(右)YLPR公司
810 820 830 840 850
PANPDEIGNF公司 IDENLKAADT公司 DPTAPPYDSL公司 LVFDYEGSGS公司 EAASLSSLNS公司
860 870 880 882
瑞典克朗(SESDKDQDYD) YLNEWGNRFK公司 KLADMYGGGE公司 尽职调查

数据来源:UniProt


蛋白质图谱 折叠蛋白图

靶向肽分析物相对于SNP、异构体和PTM的位置

Uniprot公司数据库登录 磷网站+®

单击节点上的点
查看下面的详细分析信息
所有其他点链接到 UniProt公司



磷酸化 乙酰化 泛素化 其他

加载

装载机

CPTAC-5772的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
CDH1型
顺序
天然气
修改类型
未修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
肽开始
775
肽末端
784
CPTAC标识
CPTAC-5772型
肽分子质量
1,112.5938
物种
人类 智者 (人类)
分析类型
丰富MRM或SRM
富集方法
不适用
矩阵
细胞裂解液
提交实验室
Fred Hutchinson癌症研究中心、H.Lee Moffitt癌症中心和研究所、Broad Institute
提交实验室PI
阿曼达·保罗维奇(Amanda Paulovich)、约翰·库门(John Koomen)、史蒂文·卡尔(Steven A.Carr)

出版物

查看详细信息 (在新窗口中打开)

基于靶向质谱的分析能够对受体酪氨酸激酶、MAP激酶和AKT信号进行多重量化。Whiteaker JR、Sharma K、Hoffman MA、Kuhn E、Zhao L、Cocco AR、Schoenherr RM、Kennedy JJ、Voytovich U、Lin C、Fang B、Bowers K、Whiteley G、Colantonio S、Bocik W、Roberts R、Hiltke T、Boja E、Rodriguez H、McCormick F、Holderfield M、Carr SA、Koomen JM、Paulovich AG。细胞报告方法doi:10.1016/j.crmeth.2021.100015。


分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
SCIEX 5500/Thermo Quantiva公司
内部标准
稳定同位素标记标准
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
C端子R处的13C和15N
信用证
Dionex旗舰版3000
色谱柱填料
C18肽映射100
立柱尺寸
75微米ID x 25厘米长
流速
300 nL/分钟

分析复用 展开分析面板

太平洋西北国家实验室-方向SRM3

CPTAC-1593:
ABI2公司。
阿尔夫森纳
CPTAC-1594:
ALDH2。
VAEQTPLTALYVANLIK公司
CPTAC-1595:
ANP32B。
ELVLDNC[+57.0]克
CPTAC-1596:
AP1B1。
LLSTDPVAAK公司
CPTAC-1597:
ARPC2。
VFMGEFK(VFMQEFK)
CPTAC-1598:
BRD2。
LMFSNC[+57.0]YK公司
CPTAC-1599:
CDH1。
天然气
CPTAC-1600:
CBX3。
DSDEADLVLAK公司
CPTAC-1601:
CDC42。
NVFDEAILAALEPPK公司
CPTAC-1602:
CDK9。
IGQGTFGEVFK公司
CPTAC-1603:
C20或27。
LLSVVPVPEGYSVK公司
CPTAC-1604:
文档2。
DILLPVITK公司
CPTAC-1605:
EHD2。
腿板
CPTAC-1606:
EML1。
VQMQEDDIQLK公司
CPTAC-1607型:
ENY2。
ALVPDSVK公司
CPTAC-1608型:
图1:。
GILLFGPPGTGK公司
CPTAC-1609:
GRB2。
阿塔代尔斯夫克
CPTAC-1610:
GTPBP1。
VGDNDFLEVR公司
CPTAC-1611:
C15或38-AP3S2。
TGASWTDNIMAQK公司
CPTAC-1612:
嗯13。
SFEAPIK公司
CPTAC-1613:
EPHX1。
DVELLYPVK公司
CPTAC-1614:
ITGA1。
FGTAIAAVK公司
CPTAC-1615:
PRKCA公司。
GTEELYAIK公司
CPTAC-1616:
LNPK公司。
IVEYLVGDGPQNR公司
CPTAC-1617:
LRP1。
阿尔斯甘夫利克
CPTAC-1618:
MCM2。
格拉拉夫格普克
CPTAC-1619:
MTA1。
YQADITDLLK公司
CPTAC-1620:
千年虫。
TLVTLEQSR公司
CPTAC-1621:
NEK7。
VQIFDLMDAK公司
CPTAC-1622:
NF1。
LVFIDC[+57.0]PGK公司
CPTAC-1623:
FAM129A。
VLTSEDEYNLLSDR公司
CPTAC-1624:
NMRAL1。
LGFPGAR公司
CPTAC-1625:
OSBPL10。
LLEHGEEYVFTLPSAYAR公司
CPTAC-1626:
PIK3R1。
TATGYGFAEPYNLYSSLK公司
CPTAC-1627:
帕金森2。
AIYHDLEQSIR公司
CPTAC-1628:
第2页。
SVIDPVPAPVGDSHVDGAAK公司
CPTAC-1629:
PELP1。
TGSAVAPVHPPNR公司
CPTAC-1630:
PDGFRB。
LLGEVGTLQFAELHR有限责任公司
CPTAC-1631:
PIK3CA公司。
LINLTDILK公司
CPTAC-1632:
ARL6IP5。
AWDDFFPGSDR公司
CPTAC-1633:
RNF121。
长城汽车[+57.0]IVGK
CPTAC-1634:
波兰。
HFVGILNK公司
CPTAC-1635:
PDCD11。
VTPNEGLTVSFPFGK公司
CPTAC-1636:
SMARCA5。
TEQEEDELLTESSK公司
CPTAC-1637:
SSBP1。
SGDSEVYQLGDVSQK
CPTAC-1638:
STAT5B。
ATQLLEGLVQELQK公司
CPTAC-1639:
统计6。
SVSWSQFNK公司
CPTAC-1640:
STRN(弹簧)。
SELTDSASVLDNFK公司
CPTAC-1641:
SVIL公司。
YGSFEEASYPILNR公司
CPTAC-1642:
VARS公司。
NVIHPFLSR公司
CPTAC-1643:
CCT6A。
GIDPFSLDALSK公司
CPTAC-1644:
TGM2。
赛格泰克[+57.0]C[+57.0]GPVPVR
CPTAC-1645:
TIA1。
AAFAPFGR公司
CPTAC-1646:
TMEM43。
LEDPHVDIIR公司
CPTAC-1647:
TRA2A公司。
YGPLSGVNVYDQR公司

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
y5(1+) 18.2 6.7 2.7 26.6 17.7 8.9 32.2 18.9 9.3 15 15 15
y3(1+) 18.4 8 2.9 24.1 18.4 9.3 30.3 20.1 9.7 15 15 15
总和 17.5 6.9 2.7 25.6 17.8 9 31 19.1 9.4 15 15 15


其他资源和评论

评论

CPTAC-5773的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
CDH1型
顺序
GQVPENEANVVITTLK公司
修改类型
未修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
肽开始
382
肽末端
397
CPTAC标识
CPTAC-5773型
肽分子质量
1,710.9152
物种
人类 智者 (人类)
分析类型
富集MRM或SRM
富集方法
不适用
矩阵
细胞裂解液
提交实验室
Fred Hutchinson癌症研究中心、H.Lee Moffitt癌症中心和研究所、Broad Institute
提交实验室PI
阿曼达·保罗维奇(Amanda Paulovich)、约翰·库门(John Koomen)、史蒂文·卡尔(Steven A.Carr)

出版物

查看详细信息 (在新窗口中打开)

基于靶向质谱的分析能够对受体酪氨酸激酶、MAP激酶和AKT信号进行多重量化。Whiteaker JR、Sharma K、Hoffman MA、Kuhn E、Zhao L、Cocco AR、Schoenherr RM、Kennedy JJ、Voytovich U、Lin C、Fang B、Bowers K、Whiteley G、Colantonio S、Bocik W、Roberts R、Hiltke T、Boja E、Rodriguez H、McCormick F、Holderfield M、Carr SA、Koomen JM、Paulovich AG。细胞报告方法doi:10.1016/j.crmeth.2021.100015。


分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
SCIEX 5500/Thermo Quantiva公司
内部标准
稳定同位素标记标准
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
C端子K处的13C和15N
信用证
Dionex旗舰版3000
色谱柱填料
C18肽映射100
立柱尺寸
75微米ID x 25厘米长
流速
300 nL/分钟

分析复用 展开分析面板

太平洋西北国家实验室-方向SRM3

CPTAC-1593:
ABI2公司。
阿尔夫森纳
CPTAC-1594:
ALDH2。
VAEQTPLTALYVANLIK公司
CPTAC-1595:
ANP32B。
ELVLDNC[+57.0]克
CPTAC-1596:
AP1B1。
LLSTDPVAAK公司
CPTAC-1597:
ARPC2。
VFMGEFK(VFMQEFK)
CPTAC-1598:
BRD2。
LMFSNC[+57.0]YK公司
CPTAC-1599:
CDH1。
GLDARPEVTR公司
CPTAC-1600:
CBX3。
DSDEADLVLAK公司
CPTAC-1601型:
CDC42。
NVFDEAILAALEPPK公司
CPTAC-1602:
CDK9。
IGQGTFGEVFK公司
CPTAC-1603:
C20或27。
LLSVVPVPEGYSVK公司
CPTAC-1604:
文档2。
DILLPVITK公司
CPTAC-1605:
EHD2。
腿板
CPTAC-1606:
EML1。
VQMQEDDIQLK公司
CPTAC-1607:
ENY2。
ALVPDSVK公司
CPTAC-1608:
图1。
GILLFGPPGTGK公司
CPTAC-1609:
GRB2。
阿塔代尔斯夫克
CPTAC-1610:
GTPBP1。
VGDNDFLEVR公司
CPTAC-1611:
C15或38-AP3S2。
TGASWTDNIMAQK公司
CPTAC-1612:
HM13。
SFEAPIK公司
CPTAC-1613:
EPHX1。
DVELLYPVK公司
CPTAC-1614:
ITGA1。
FGTAIAAVK公司
CPTAC-1615:
PRKCA公司。
GTEELYAIK公司
CPTAC-1616:
LNPK公司。
IVEYLVGDGPQNR公司
CPTAC-1617:
LRP1。
阿尔斯甘夫利克
CPTAC-1618:
MCM2。
格拉拉夫格普克
CPTAC-1619:
MTA1。
YQADITDLLK公司
CPTAC-1620:
千年虫。
TLVTLEQSR公司
CPTAC-1621:
NEK7。
VQIFDLMDAK公司
CPTAC-1622:
NF1。
LVFIDC[+57.0]PGK公司
CPTAC-1623:
FAM129A。
VLTSEDEYNLLSDR公司
CPTAC-1624:
NMRAL1。
LGFPGAR公司
CPTAC-1625:
OSBPL10。
LLEHGEEYVFTLPSAYAR公司
CPTAC-1626:
PIK3R1。
TATGYGFAEPYNLYSSLK公司
CPTAC-1627:
帕金森2。
AIYHDLEQSIR公司
CPTAC-1628:
第2页。
SVIDPVPAPVGDSHVDGAAK公司
CPTAC-1629:
PELP1。
TGSAVAPVHPPNR公司
CPTAC-1630:
PDGFRB。
LLGEVGTLQFAELHR有限责任公司
CPTAC-1631:
PIK3CA公司。
LINLTDILK公司
CPTAC-1632:
ARL6IP5。
AWDDFFPGSDR公司
CPTAC-1633:
RNF121。
肾小球滤过率[+57.0]静脉滴注
CPTAC-1634:
波兰。
HFVGILNK公司
CPTAC-1635:
PDCD11。
VTPNEGLTVSFPFGK公司
CPTAC-1636:
SMARCA5。
TEQEEDELLTESSK公司
CPTAC-1637:
SSBP1。
SGDSEVYQLGDVSQK公司
CPTAC-1638:
STAT5B。
ATQLLEGLVQELQK公司
CPTAC-1639:
统计6。
SVSWSQFNK公司
CPTAC-1640:
STRN(弹簧)。
SELTDSASVLDNFK公司
CPTAC-1641:
SVIL公司。
YGSFEEASYPILNR公司
CPTAC-1642:
VARS公司。
NVIHPFLSR公司
CPTAC-1643:
CCT6A。
GIDPFSLDALSK公司
CPTAC-1644:
TGM2。
赛格泰克[+57.0]C[+57.0]GPVPVR
CPTAC-1645:
TIA1。
AAFAPFGR公司
CPTAC-1646:
TMEM43。
LEDPHVDIIR公司
CPTAC-1647:
TRA2A。
YGPLSGVNVYDQR公司

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
y6(1+) 52.2 11.5 6.7 51 35.1 17.1 73 36.9 18.4 14 14 14
y13(1+) 35.2 9.3 7.7 53.7 37.9 16.4 64.2 39 18.1 14 14 14
9岁(1+) 44.9 19.1 9.8 60 31 14.2 74.9 36.4 17.3 14 14 14
y5(1+) 41.9 17.4 8.5 43.6 34.6 21.6 60.5 38.7 23.2 14 14 14
y4(1+) 32.9 17.8 7 38.3 33.5 18.4 50.5 37.9 19.7 14 14 14
总和 28.9 12.7 6.5 43.9 34.6 17.1 52.6 36.9 18.3 14 14 14


其他资源和评论

评论

非CPTAC-5542的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
CDH1型
顺序
GLDARPEVTR公司
修改类型
未修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
6
肽开始
775
肽末端
784
CPTAC标识
非CPTAC-5542
肽分子质量
1112.5938个
物种
人类 智者 (人类)
分析类型
丰富MRM或SRM
富集方法
不适用
矩阵
细胞系
提交实验室
莫菲特癌症中心
提交实验室PI
约翰·库门

出版物

查看详细信息 (在新窗口中打开)

基于靶向质谱的分析能够对受体酪氨酸激酶、MAP激酶和AKT信号进行多重量化。Whiteaker JR、Sharma K、Hoffman MA、Kuhn E、Zhao L、Cocco AR、Schoenherr RM、Kennedy JJ、Voytovich U、Lin C、Fang B、Bowers K、Whiteley G、Colantonio S、Bocik W、Roberts R、Hiltke T、Boja E、Rodriguez H、McCormick F、Holderfield M、Carr SA、Koomen JM、Paulovich AG。细胞报告方法doi:10.1016/j.crmeth.2021.100015。


分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
RSLCnano和Quantiva
内部标准
SIS肽
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
C端子R处的13C和15N
信用证
RSLC纳米
色谱柱填料
C18肽映射100
立柱尺寸
75微米ID x 25厘米长
流速
300 nL/分钟

分析复用 展开分析面板

太平洋西北国家实验室-方向SRM3

CPTAC-1593:
ABI2公司。
阿尔夫森纳
CPTAC-1594:
ALDH2。
VAEQTPLTALYVANLIK公司
CPTAC-1595:
ANP32B。
ELVLDNC[+57.0]克
CPTAC-1596:
AP1B1。
LLSTDPVAAK公司
CPTAC-1597:
ARPC2。
VFMGEFK(VFMQEFK)
CPTAC-1598:
BRD2。
LMFSNC[+57.0]YK公司
CPTAC-1599:
CDH1。
GLDARPEVTR公司
CPTAC-1600:
CBX3。
DSDEADLVLAK公司
CPTAC-1601:
CDC42。
NVFDEAILAALEPPK公司
CPTAC-1602:
CDK9。
IGQGTFGEVFK公司
CPTAC-1603:
C20或27。
LLSVVPVPEGYSVK公司
CPTAC-1604:
文档2。
DILLPVITK公司
CPTAC-1605:
EHD2。
腿板
CPTAC-1606:
EML1。
VQMQEDDIQLK公司
CPTAC-1607:
ENY2。
ALVPDSVK公司
CPTAC-1608:
图1:。
吉尔夫格
CPTAC-1609:
GRB2。
阿塔代尔斯夫克
CPTAC-1610:
GTPBP1。
VGDNDFLEVR公司
CPTAC-1611:
C15或38-AP3S2。
TGASWTDNIMAQK公司
CPTAC-1612:
HM13。
SFEAPIK公司
CPTAC-1613:
EPHX1。
DVELLYPVK公司
CPTAC-1614:
ITGA1。
FGTAIAAVK公司
CPTAC-1615:
PRKCA公司。
GTEELYAIK公司
CPTAC-1616:
LNPK公司。
IVEYLVGDGPQNR公司
CPTAC-1617:
LRP1。
阿尔斯甘夫利克
CPTAC-1618:
MCM2。
格拉拉夫格普克
CPTAC-1619:
MTA1。
YQADITDLLK公司
CPTAC-1620:
MYO1G。
TLVTLEQSR公司
CPTAC-1621:
NEK7。
VQIFDLMDAK公司
CPTAC-1622:
NF1。
LVFIDC[+57.0]PGK公司
CPTAC-1623:
FAM129A。
VLTSEDEYNLLSDR公司
CPTAC-1624:
NMRAL1。
LGFPGAR公司
CPTAC-1625:
OSBPL10。
列日
CPTAC-1626:
PIK3R1。
TATGYGFAEPYNLYSSLK公司
CPTAC-1627:
蛋白酶2。
AIYHDLEQSIR公司
CPTAC-1628:
第2页。
SVIDPVPAPVGDSHVDGAAK公司
CPTAC-1629:
PELP1。
TGSAVAPVHPPNR公司
CPTAC-1630:
PDGFRB。
LLGEVGTLQFAELHR有限责任公司
CPTAC-1631:
PIK3CA公司。
LINLTDILK公司
CPTAC-1632:
ARL6IP5。
AWDDFFPGSDR公司
CPTAC-1633:
RNF121。
长城汽车[+57.0]IVGK
CPTAC-1634:
波兰。
HFVGILNK公司
CPTAC-1635:
PDCD11。
VTPNEGLTVSFPFGK公司
CPTAC-1636:
SMARCA5。
TEQEEDELLTESSK公司
CPTAC-1637:
SSBP1。
SGDSEVYQLGDVSQK公司
CPTAC-1638:
定子5b。
ATQLLEGLVQELQK公司
CPTAC-1639:
统计6。
SVSWSQFNK公司
CPTAC-1640:
STRN(弹簧)。
SELTDSASVLDNFK公司
CPTAC-1641:
SVIL公司。
YGSFEEASYPILNR公司
CPTAC-1642:
VARS公司。
NVIHPFLSR公司
CPTAC-1643:
CCT6A。
GIDPFSLDALSK公司
CPTAC-1644:
TGM2。
赛格泰克[+57.0]C[+57.0]GPVPVR
CPTAC-1645:
TIA1。
美国食品药品监督管理局
CPTAC-1646:
TMEM43。
发光二极管
CPTAC-1647:
TRA2A公司。
YGPLSGVNVYDQR公司

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
y3(1+) 18.2 7.1 2.1 24 19 9.4 30.1 20.3 9.6 14 14 14
y4(1+) 20.2 6.5 2.4 28.1 20.4 9.8 34.6 21.4 10.1 14 14 14
y5(1+) 18.5 5.5 2.2 26.8 18.6 9.1 32.6 19.4 9.4 14 14 14
总和 17.1 5.6 2.1 25.5 18.8 9.2 30.7 19.6 9.4 14 14 14


其他资源和评论

评论

非CPTAC-5541的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
CDH1型
顺序
GQVPENEANVVITTLK公司
修改类型
未修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
6
肽开始
382
肽末端
397
CPTAC标识
非CPTAC-5541
肽分子质量
1710.9152年
物种
人类 智者 (人类)
分析类型
丰富MRM或SRM
富集方法
不适用
矩阵
细胞系
提交实验室
莫菲特癌症中心
提交实验室PI
约翰·库门

出版物

查看详细信息 (在新窗口中打开)

基于靶向质谱的分析能够对受体酪氨酸激酶、MAP激酶和AKT信号进行多重量化。Whiteaker JR、Sharma K、Hoffman MA、Kuhn E、Zhao L、Cocco AR、Schoenherr RM、Kennedy JJ、Voytovich U、Lin C、Fang B、Bowers K、Whiteley G、Colantonio S、Bocik W、Roberts R、Hiltke T、Boja E、Rodriguez H、McCormick F、Holderfield M、Carr SA、Koomen JM、Paulovich AG。细胞报告方法doi:10.1016/j.crmeth.2021.100015。


分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
RSLCnano和Quantiva
内部标准
SIS肽
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
C端子K处的13C和15N
信用证
RSLC纳米
色谱柱填料
C18肽映射100
立柱尺寸
75微米ID x 25厘米长
流速
300 nL/分钟

分析复用 展开分析面板

太平洋西北国家实验室-方向SRM3

CPTAC-1593:
ABI2公司。
阿尔夫森纳
CPTAC-1594:
ALDH2。
VAEQTPLTALYVANLIK公司
CPTAC-1595:
ANP32B。
ELVLDNC[+57.0]克
CPTAC-1596:
第1b1页。
LLSTDPVAAK公司
CPTAC-1597:
ARPC2。
VFMGEFK(VFMQEFK)
CPTAC-1598:
BRD2。
LMFSNC[+57.0]YK公司
CPTAC-1599:
CDH1。
GLDARPEVTR公司
CPTAC-1600:
CBX3。
dsdeadlvllak公司
CPTAC-1601:
CDC42。
NVFDEAILAALEPPK公司
CPTAC-1602:
CDK9。
IGQGTFGEVFK公司
CPTAC-1603:
C20或27。
LLSVVPVPEGYSVK公司
CPTAC-1604:
文档2。
DILLPVITK公司
CPTAC-1605:
EHD2。
腿板
CPTAC-1606:
EML1。
VQMQEDDIQLK公司
CPTAC-1607:
ENY2。
ALVPDSVK公司
CPTAC-1608型:
图1:。
GILLFGPPGTGK公司
CPTAC-1609型:
GRB2。
阿塔代尔斯夫克
CPTAC-1610:
GTPBP1。
VGDNDFLEVR公司
CPTAC-1611:
C15或38-AP3S2。
TGASWTDNIMAQK公司
CPTAC-1612:
HM13。
SFEAPIK公司
CPTAC-1613:
EPHX1。
DVELLYPVK公司
CPTAC-1614:
ITGA1。
FGTAIAAVK公司
CPTAC-1615:
PRKCA公司。
GTEELYAIK公司
CPTAC-1616:
LNPK公司。
IVEYLVGDGPQNR公司
CPTAC-1617:
LRP1。
阿尔斯甘夫利克
CPTAC-1618:
MCM2。
格拉拉夫格普克
CPTAC-1619:
MTA1。
YQADITDLLK公司
CPTAC-1620:
千年虫。
TLVTLEQSR公司
CPTAC-1621:
NEK7。
VQIFDLMDAK公司
CPTAC-1622:
NF1。
LVFIDC[+57.0]PGK公司
CPTAC-1623:
FAM129A。
VLTSEDEYNLLSDR公司
CPTAC-1624:
NMRAL1。
LGFPGAR公司
CPTAC-1625:
OSBPL10。
LLEHGEEYVFTLPSAYAR公司
CPTAC-1626:
PIK3R1。
TATGYGFAEPYNLYSSLK公司
CPTAC-1627:
蛋白酶2。
AIYHDLEQSIR公司
CPTAC-1628:
第2页。
SVIDPVPAPVGDSHVDGAAK公司
CPTAC-1629:
PELP1。
TGSAVAPVHPPNR公司
CPTAC-1630:
PDGFRB。
LLGEVGTLQFAELHR有限责任公司
CPTAC-1631:
PIK3CA公司。
LINLTDILK公司
CPTAC-1632:
ARL6IP5。
AWDDFFPGSDR公司
CPTAC-1633:
RNF121。
长城汽车[+57.0]IVGK
CPTAC-1634:
波尔1e。
HFVGILNK公司
CPTAC-1635:
PDCD11。
VTPNEGLTVSFPFGK公司
CPTAC-1636:
SMARCA5。
TEQEEDELLTESSK公司
CPTAC-1637:
SSBP1。
SGDSEVYQLGDVSQK公司
CPTAC-1638:
STAT5B。
CPTAC-1639:
统计6。
SVSWSQFNK公司
CPTAC-1640:
STRN(弹簧)。
SELTDSASVLDNFK公司
CPTAC-1641:
SVIL公司。
YGSFEEASYPILNR公司
CPTAC-1642:
VARS公司。
NVIHPFLSR公司
CPTAC-1643:
CCT6A。
GIDPFSLDALSK公司
CPTAC-1644:
TGM2。
赛格泰克[+57.0]C[+57.0]GPVPVR
CPTAC-1645:
TIA1。
AAFAPFGR公司
CPTAC-1646:
TMEM43。
LEDPHVDIIR公司
CPTAC-1647:
TRA2A公司。
YGPLSGVNVYDQR公司

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
y4(1+) 32.9 17.8 7 38.3 33.5 18.4 50.5 37.9 19.7 14 14 14
y5(1+) 41.9 17.4 8.5 43.6 34.6 21.6 60.5 38.7 23.2 14 14 14
y6(1+) 52.2 11.5 6.7 51 35.1 17.1 73 36.9 18.4 14 14 14
9岁(1+) 44.9 19.1 9.8 60 31 14.2 74.9 36.4 17.3 14 14 14
y13(1+) 35.2 9.3 7.7 53.7 37.9 16.4 64.2 39 18.1 14 14 14
总和 28.9 12.7 6.5 43.9 34.6 17.1 52.6 36.9 18.3 14 14 14


其他资源和评论

评论

非CPTAC-5370的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
CDH1型
顺序
NDVAPTLMSVPR公司
修改类型
未修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
不适用
肽开始
785
肽末端
796
CPTAC标识
非CPTAC-5370
肽分子质量
1,298.6653
物种
人类 智者 (人类)
分析类型
直接MRM或SRM
矩阵
细胞裂解液
提交实验室
莫菲特癌症中心
提交实验室PI
约翰·库门

出版物

查看详细信息 (在新窗口中打开)

基于靶向质谱的分析能够对受体酪氨酸激酶、MAP激酶和AKT信号进行多重量化。Whiteaker JR、Sharma K、Hoffman MA、Kuhn E、Zhao L、Cocco AR、Schoenherr RM、Kennedy JJ、Voytovich U、Lin C、Fang B、Bowers K、Whiteley G、Colantonio S、Bocik W、Roberts R、Hiltke T、Boja E、Rodriguez H、McCormick F、Holderfield M、Carr SA、Koomen JM、Paulovich AG。细胞报告方法doi:10.1016/j.crmeth.2021.100015。


分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
RSLCnano和Quantiva
内部标准
稳定同位素标记标准
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
C端子R处的13C和15N
信用证
RSLC纳米
色谱柱填料
C18肽映射100
立柱尺寸
75微米ID x 25厘米长
流速
300 nl/分钟

分析复用 展开分析面板

太平洋西北国家实验室-方向SRM3

CPTAC-1593:
ABI2公司。
阿尔夫森纳
CPTAC-1594:
ALDH2。
VAEQTPLTALYVANLIK公司
CPTAC-1595:
ANP32B。
ELVLDNC[+57.0]克
CPTAC-1596:
AP1B1。
LLSTDPVAAK公司
CPTAC-1597:
ARPC2。
VFMGEFK(VFMQEFK)
CPTAC-1598:
BRD2。
LMFSNC[+57.0]YK公司
CPTAC-1599:
CDH1。
天然气
CPTAC-1600:
CBX3。
DSDEADLVLAK公司
CPTAC-1601:
CDC42。
NVFDEAILAALEPPK公司
CPTAC-1602:
CDK9。
IGQGTFGEVFK公司
CPTAC-1603:
C20或27。
LLSVVPVPEGYSVK公司
CPTAC-1604:
文档2。
DILLPVITK公司
CPTAC-1605:
EHD2。
腿板
CPTAC-1606:
EML1。
VQMQEDDIQLK公司
CPTAC-1607型:
ENY2。
ALVPDSVK公司
CPTAC-1608型:
图1:。
GILLFGPPGTGK公司
CPTAC-1609:
GRB2。
阿塔代尔斯夫克
CPTAC-1610:
GTPBP1。
VGDNDFLEVR公司
CPTAC-1611:
C15或38-AP3S2。
TGASWTDNIMAQK公司
CPTAC-1612:
嗯13。
SFEAPIK公司
CPTAC-1613:
EPHX1。
DVELLYPVK公司
CPTAC-1614:
ITGA1。
FGTAIAAVK公司
CPTAC-1615:
PRKCA公司。
GTEELYAIK公司
CPTAC-1616:
LNPK公司。
IVEYLVGDGPQNR公司
CPTAC-1617:
LRP1。
阿尔斯甘夫利克
CPTAC-1618:
MCM2。
格拉拉夫格普克
CPTAC-1619:
MTA1。
YQADITDLLK公司
CPTAC-1620:
千年虫。
TLVTLEQSR公司
CPTAC-1621:
NEK7。
VQIFDLMDAK公司
CPTAC-1622:
NF1。
LVFIDC[+57.0]PGK公司
CPTAC-1623:
FAM129A。
VLTSEDEYNLLSDR公司
CPTAC-1624:
NMRAL1。
LGFPGAR公司
CPTAC-1625:
OSBPL10。
LLEHGEEYVFTLPSAYAR公司
CPTAC-1626:
PIK3R1。
TATGYGFAEPYNLYSSLK公司
CPTAC-1627:
帕金森2。
AIYHDLEQSIR公司
CPTAC-1628:
第2页。
SVIDPVPAPVGDSHVDGAAK公司
CPTAC-1629:
PELP1。
TGSAVAPVHPPNR公司
CPTAC-1630:
PDGFRB。
LLGEVGTLQFAELHR有限责任公司
CPTAC-1631:
PIK3CA公司。
LINLTDILK公司
CPTAC-1632:
ARL6IP5。
AWDDFFPGSDR公司
CPTAC-1633:
RNF121。
长城汽车[+57.0]IVGK
CPTAC-1634:
波兰。
HFVGILNK公司
CPTAC-1635:
PDCD11。
VTPNEGLTVSFPFGK公司
CPTAC-1636:
SMARCA5。
TEQEEDELLTESSK公司
CPTAC-1637:
SSBP1。
SGDSEVYQLGDVSQK
CPTAC-1638:
STAT5B。
ATQLLEGLVQELQK公司
CPTAC-1639:
统计6。
SVSWSQFNK公司
CPTAC-1640:
STRN(弹簧)。
SELTDSASVLDNFK公司
CPTAC-1641:
SVIL公司。
YGSFEEASYPILNR公司
CPTAC-1642:
VARS公司。
NVIHPFLSR公司
CPTAC-1643:
CCT6A。
GIDPFSLDALSK公司
CPTAC-1644:
TGM2。
赛格泰克[+57.0]C[+57.0]GPVPVR
CPTAC-1645:
TIA1。
AAFAPFGR公司
CPTAC-1646:
TMEM43。
LEDPHVDIIR公司
CPTAC-1647:
TRA2A公司。
YGPLSGVNVYDQR公司

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
b3(1+) 3.6 1.9 2.2 4.8 2.7 3.4 6 3.3 4 15 15 15
8岁(1+) 5 2.2 1.9 3.6 3.2 2.8 6.2 3.9 3.4 15 15 15
9岁(1+) 2.8 1.6 2.5 4.7 2.4 3.4 5.5 2.9 4.2 15 15 15
y10(1+) 9.3 4.9 4.8 11.2 5 5.7 14.6 7 7.5 15 15 15
总和 2.9 1.7 1.1 3.4 2.2 2.6 4.5 2.8 2.8 15 15 15


其他资源和评论

评论

非CPTAC-5367的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
CDH1型
顺序
NTGVISVVTTGLDR公司
修改类型
未修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
不适用
肽开始
322
肽末端
335
CPTAC标识
非CPTAC-5367
肽分子质量
1,430.7729
物种
人类 智者 (人类)
分析类型
直接MRM或SRM
矩阵
细胞裂解液
提交实验室
莫菲特癌症中心
提交实验室PI
约翰·库门

出版物

查看详细信息 (在新窗口中打开)

基于靶向质谱的分析能够对受体酪氨酸激酶、MAP激酶和AKT信号进行多重量化。Whiteaker JR、Sharma K、Hoffman MA、Kuhn E、Zhao L、Cocco AR、Schoenherr RM、Kennedy JJ、Voytovich U、Lin C、Fang B、Bowers K、Whiteley G、Colantonio S、Bocik W、Roberts R、Hiltke T、Boja E、Rodriguez H、McCormick F、Holderfield M、Carr SA、Koomen JM、Paulovich AG。细胞报告方法doi:10.1016/j.crmeth.2021.100015。


分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
RSLCnano和Quantiva
内部标准
稳定同位素标记标准
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
C端子R处的13C和15N
信用证
RSLC纳米
色谱柱填料
C18肽映射100
立柱尺寸
75微米ID x 25厘米长
流速
300 nl/分钟

分析复用 展开分析面板

太平洋西北国家实验室-方向SRM3

CPTAC-1593:
ABI2公司。
阿尔夫森纳
CPTAC-1594:
ALDH2。
VAEQTPLTALYVANLIK公司
CPTAC-1595:
ANP32B。
ELVLDNC[+57.0]克
CPTAC-1596:
第1b1页。
LLSTDPVAAK公司
CPTAC-1597:
ARPC2。
VFMGEFK(VFMQEFK)
CPTAC-1598:
BRD2。
LMFSNC[+57.0]YK公司
CPTAC-1599:
CDH1。
GLDARPEVTR公司
CPTAC-1600:
CBX3。
dsdeadlvllak公司
CPTAC-1601:
CDC42。
NVFDEAILAALEPPK公司
CPTAC-1602:
CDK9。
IGQGTFGEVFK公司
CPTAC-1603:
C20或27。
LLSVVPVPEGYSVK公司
CPTAC-1604:
文档2。
DILLPVITK公司
CPTAC-1605:
EHD2。
腿板
CPTAC-1606:
EML1。
VQMQEDDIQLK公司
CPTAC-1607:
ENY2。
ALVPDSVK公司
CPTAC-1608型:
图1:。
GILLFGPPGTGK公司
CPTAC-1609型:
GRB2。
阿塔代尔斯夫克
CPTAC-1610:
GTPBP1。
VGDNDFLEVR公司
CPTAC-1611:
C15或38-AP3S2。
TGASWTDNIMAQK公司
CPTAC-1612:
HM13。
SFEAPIK公司
CPTAC-1613:
EPHX1。
DVELLYPVK公司
CPTAC-1614:
ITGA1。
FGTAIAAVK公司
CPTAC-1615:
PRKCA公司。
GTEELYAIK公司
CPTAC-1616:
LNPK公司。
IVEYLVGDGPQNR公司
CPTAC-1617:
LRP1。
阿尔斯甘夫利克
CPTAC-1618:
MCM2。
格拉拉夫格普克
CPTAC-1619:
MTA1。
YQADITDLLK公司
CPTAC-1620:
千年虫。
TLVTLEQSR公司
CPTAC-1621:
NEK7。
VQIFDLMDAK公司
CPTAC-1622:
NF1。
LVFIDC[+57.0]PGK公司
CPTAC-1623:
FAM129A。
VLTSEDEYNLLSDR公司
CPTAC-1624:
NMRAL1。
LGFPGAR公司
CPTAC-1625:
OSBPL10。
LLEHGEEYVFTLPSAYAR公司
CPTAC-1626:
PIK3R1。
TATGYGFAEPYNLYSSLK公司
CPTAC-1627:
蛋白酶2。
AIYHDLEQSIR公司
CPTAC-1628:
第2页。
SVIDPVPAPVGDSHVDGAAK公司
CPTAC-1629:
PELP1。
TGSAVAPVHPPNR公司
CPTAC-1630:
PDGFRB。
LLGEVGTLQFAELHR有限责任公司
CPTAC-1631:
PIK3CA公司。
LINLTDILK公司
CPTAC-1632:
ARL6IP5。
AWDDFFPGSDR公司
CPTAC-1633:
RNF121。
长城汽车[+57.0]IVGK
CPTAC-1634:
波尔1e。
HFVGILNK公司
CPTAC-1635:
PDCD11。
VTPNEGLTVSFPFGK公司
CPTAC-1636:
SMARCA5。
TEQEEDELLTESSK公司
CPTAC-1637:
SSBP1。
SGDSEVYQLGDVSQK公司
CPTAC-1638:
STAT5B。
CPTAC-1639:
统计6。
SVSWSQFNK公司
CPTAC-1640:
STRN(弹簧)。
SELTDSASVLDNFK公司
CPTAC-1641:
SVIL公司。
YGSFEEASYPILNR公司
CPTAC-1642:
VARS公司。
NVIHPFLSR公司
CPTAC-1643:
CCT6A。
GIDPFSLDALSK公司
CPTAC-1644:
TGM2。
赛格泰克[+57.0]C[+57.0]GPVPVR
CPTAC-1645:
TIA1。
AAFAPFGR公司
CPTAC-1646:
TMEM43。
LEDPHVDIIR公司
CPTAC-1647:
TRA2A公司。
YGPLSGVNVYDQR公司

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
8岁(1+) 7.4 4.1 3.6 12.8 5.8 4.3 14.8 7.1 5.6 15 15 15
9岁(1+) 5.2 4.8 3.4 7 4.8 3.9 8.7 6.8 5.2 15 15 15
y10(1+) 6.7 3.4 5 6.7 3.6 4.4 9.5 5 6.7 15 15 15
y6(1+) 9.2 5.1 3.9 10.5 6.2 5.2 14 8 6.5 15 15 15
7岁(1+) 3.6 1.7 2.9 4.7 2.9 3.2 5.9 3.4 4.3 15 15 15
总和 2.8 2.3 2.6 3.3 2.8 4.3 3.6 4 15 15 15


其他资源和评论

评论

非CPTAC-5366的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
CDH1型
顺序
TAYFSLDTR公司
修改类型
未修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
不适用
肽开始
66
肽末端
74
CPTAC标识
非CPTAC-5366
肽分子质量
1,072.5189
物种
人类 智者 (人类)
分析类型
直接MRM或SRM
矩阵
细胞裂解液
提交实验室
莫菲特癌症中心
提交实验室PI
约翰·库门

出版物

查看详细信息 (在新窗口中打开)

基于靶向质谱的分析能够对受体酪氨酸激酶、MAP激酶和AKT信号进行多重量化。Whiteaker JR、Sharma K、Hoffman MA、Kuhn E、Zhao L、Cocco AR、Schoenherr RM、Kennedy JJ、Voytovich U、Lin C、Fang B、Bowers K、Whiteley G、Colantonio S、Bocik W、Roberts R、Hiltke T、Boja E、Rodriguez H、McCormick F、Holderfield M、Carr SA、Koomen JM、Paulovich AG。细胞报告方法doi:10.1016/j.crmeth.2021.100015。


分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
RSLCnano和Quantiva
内部标准
稳定同位素标记标准
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
C端子R处的13C和15N
信用证
RSLC纳米
色谱柱填料
C18肽映射100
立柱尺寸
75微米ID x 25厘米长
流速
300 nl/分钟

分析复用 展开分析面板

太平洋西北国家实验室-方向SRM3

CPTAC-1593:
ABI2公司。
阿尔夫森纳
CPTAC-1594:
ALDH2。
VAEQTPLTALYVANLIK公司
CPTAC-1595:
ANP32B。
ELVLDNC[+57.0]克
CPTAC-1596:
AP1B1。
LLSTDPVAAK公司
CPTAC-1597:
ARPC2。
VFMGEFK(VFMQEFK)
CPTAC-1598:
BRD2。
LMFSNC[+57.0]YK公司
CPTAC-1599:
CDH1。
GLDARPEVTR公司
CPTAC-1600:
CBX3。
DSDEADLVLAK公司
CPTAC-1601型:
CDC42。
NVFDEAILAALEPPK公司
CPTAC-1602:
CDK9。
IGQGTFGEVFK公司
CPTAC-1603:
C20或27。
LLSVVPVPEGYSVK公司
CPTAC-1604:
文档2。
DILLPVITK公司
CPTAC-1605:
EHD2。
腿板
CPTAC-1606:
EML1。
VQMQEDDIQLK公司
CPTAC-1607:
ENY2。
ALVPDSVK公司
CPTAC-1608:
图1。
GILLFGPPGTGK公司
CPTAC-1609:
GRB2。
阿塔代尔斯夫克
CPTAC-1610:
GTPBP1。
VGDNDFLEVR公司
CPTAC-1611:
C15或38-AP3S2。
TGASWTDNIMAQK公司
CPTAC-1612:
HM13。
SFEAPIK公司
CPTAC-1613:
EPHX1。
DVELLYPVK公司
CPTAC-1614:
ITGA1。
FGTAIAAVK公司
CPTAC-1615:
PRKCA公司。
GTEELYAIK公司
CPTAC-1616:
LNPK公司。
IVEYLVGDGPQNR公司
CPTAC-1617:
LRP1。
阿尔斯甘夫利克
CPTAC-1618:
MCM2。
格拉拉夫格普克
CPTAC-1619:
MTA1。
YQADITDLLK公司
CPTAC-1620:
千年虫。
TLVTLEQSR公司
CPTAC-1621:
NEK7。
VQIFDLMDAK公司
CPTAC-1622:
NF1。
LVFIDC[+57.0]PGK公司
CPTAC-1623:
FAM129A。
VLTSEDEYNLLSDR公司
CPTAC-1624:
NMRAL1。
LGFPGAR公司
CPTAC-1625:
OSBPL10。
LLEHGEEYVFTLPSAYAR公司
CPTAC-1626:
PIK3R1。
TATGYGFAEPYNLYSSLK公司
CPTAC-1627:
蛋白酶2。
AIYHDLEQSIR公司
CPTAC-1628:
第2页。
SVIDPVPAPVGDSHVDGAAK公司
CPTAC-1629:
PELP1。
TGSAVAPVHPPNR公司
CPTAC-1630:
PDGFRB。
LLGEVGTLQFAELHR有限责任公司
CPTAC-1631:
PIK3CA公司。
LINLTDILK公司
CPTAC-1632:
ARL6IP5。
AWDDFFPGSDR公司
CPTAC-1633:
RNF121。
肾小球滤过率[+57.0]静脉滴注
CPTAC-1634:
波兰。
HFVGILNK公司
CPTAC-1635:
PDCD11。
VTPNEGLTVSFPFGK公司
CPTAC-1636:
SMARCA5。
TEQEEDELLTESSK公司
CPTAC-1637:
SSBP1。
SGDSEVYQLGDVSQK公司
CPTAC-1638:
STAT5B。
ATQLLEGLVQELQK公司
CPTAC-1639:
统计6。
SVSWSQFNK公司
CPTAC-1640:
STRN(弹簧)。
SELTDSASVLDNFK公司
CPTAC-1641:
SVIL公司。
YGSFEEASYPILNR公司
CPTAC-1642:
VARS公司。
NVIHPFLSR公司
CPTAC-1643:
CCT6A。
GIDPFSLDALSK公司
CPTAC-1644:
TGM2。
赛格泰克[+57.0]C[+57.0]GPVPVR
CPTAC-1645:
TIA1。
AAFAPFGR公司
CPTAC-1646:
TMEM43。
LEDPHVDIIR公司
CPTAC-1647:
TRA2A。
YGPLSGVNVYDQR公司

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
7岁(1+) 3.7 1.8 2.5 3.4 3.3 3.2 5 3.8 4.1 15 15 15
y6(1+) 4.2 3.5 3.5 4.8 4.1 3.1 6.4 5.4 4.7 15 15 15
b3(1+) 7.4 4 3.1 8 5 5.1 10.9 6.4 6 15 15 15
y5(1+) 2.8 2.2 4.2 5.1 2.5 5 5.9 3.3 15 15 15
总和 1.4 2.4 2.3 2.9 3.8 2.7 3.2 4.5 3.5 15 15 15


其他资源和评论

评论

CPTAC-1599的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
CDH1型
顺序
GLDARPEVTR公司
修改类型
未修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
不适用
肽开始
775
肽末端
784
CPTAC标识
CPTAC-1599型
肽分子质量
1,112.5938
物种
人类 智者 (人类)
分析类型
直接MRM或SRM
矩阵
卵巢癌肿瘤组织裂解物
提交实验室
太平洋西北国家实验室
提交实验室PI
刘涛(Tao Liu)

分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
TSQ Vantage公司
内部标准
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
C端子R处的13C和15N
信用证
Waters nanoACQUITY(零件号176016000)
色谱柱填料
Waters BEH C18,1.7 um 130º(零件号186007485)
立柱尺寸
100微米x 100毫米
流速
0.5微升/分钟

分析复用 展开分析面板

太平洋西北国家实验室-方向SRM3

CPTAC-1593:
ABI2公司。
阿尔夫森纳
CPTAC-1594:
ALDH2。
VAEQTPLTALYVANLIK公司
CPTAC-1595:
ANP32B。
ELVLDNC[+57.0]克
CPTAC-1596:
AP1B1。
LLSTDPVAAK公司
CPTAC-1597:
ARPC2。
VFMQEFK公司
CPTAC-1598:
BRD2。
LMFSNC[+57.0]YK型
CPTAC-1599:
CDH1。
GLDARPEVTR公司
CPTAC-1600:
CBX3。
DSDEADLVLAK公司
CPTAC-1601:
CDC42。
NVFDEAILAALEPPK公司
CPTAC-1602:
CDK9。
IGQGTFGEVFK公司
CPTAC-1603型:
C20或27。
LLSVVPVPEGYSVK公司
CPTAC-1604:
文档2。
DILLPVITK公司
CPTAC-1605:
EHD2。
腿板
CPTAC-1606:
EML1。
VQMQEDDIQLK公司
CPTAC-1607:
ENY2。
ALVPDSVK公司
CPTAC-1608:
图1:。
GILLFGPPGTGK公司
CPTAC-1609:
GRB2。
阿塔代尔斯夫克
CPTAC-1610:
GTPBP1。
VGDNDFLEVR公司
CPTAC-1611:
C15或f38-AP3S2。
TGASWTDNIMAQK公司
CPTAC-1612:
HM13。
SFEAPIK公司
CPTAC-1613:
EPHX1。
DVELLYPVK公司
CPTAC-1614:
ITGA1。
FGTAIAAVK公司
CPTAC-1615:
PRKCA公司。
GTEELYAIK公司
CPTAC-1616:
LNPK公司。
IVEYLVGDGPQNR公司
CPTAC-1617:
LRP1。
阿尔斯甘夫利克
CPTAC-1618:
MCM2。
格拉拉夫格普克
CPTAC-1619:
MTA1。
YQADITDLLK公司
CPTAC-1620:
千年虫。
TLVTLEQSR公司
CPTAC-1621:
NEK7。
VQIFDLMDAK公司
CPTAC-1622:
NF1。
LVFIDC[+57.0]PGK公司
CPTAC-1623:
FAM129A。
VLTSEDEYNLLSDR公司
CPTAC-1624:
NMRAL1。
LGFPGAR公司
CPTAC-1625:
OSBPL10。
LLEHGEEYVFTLPSAYAR公司
CPTAC-1626:
PIK3R1。
TATGYGFAEPYNLYSSLK公司
CPTAC-1627:
蛋白酶2。
AIYHDLEQSIR公司
CPTAC-1628:
PAK2。
SVIDPVPAPVGDSHVDGAAK公司
CPTAC-1629:
PELP1。
TGSAVAPVHPPNR公司
CPTAC-1630:
PDGFRB。
LLGEVGTLQFAELHR有限责任公司
CPTAC-1631:
PIK3CA公司。
LINLTDILK公司
CPTAC-1632:
ARL6IP5。
AWDDFFPGSDR公司
CPTAC-1633:
RNF121。
长城汽车[+57.0]IVGK
CPTAC-1634:
波兰。
HFVGILNK公司
CPTAC-1635:
PDCD11。
vtpnegltvtsfpfgk
CPTAC-1636:
SMARCA5。
特凯代尔特斯克
CPTAC-1637:
SSBP1。
SGDSEVYQLGDVSQK公司
CPTAC-1638:
STAT5B。
ATQLLEGLVQELQK公司
CPTAC-1639:
统计6。
SVSWSQFNK公司
CPTAC-1640:
STRN(弹簧)。
SELTDSASVLDNFK公司
CPTAC-1641:
SVIL公司。
YGSFEEASYPILNR公司
CPTAC-1642:
VARS公司。
NVIHPFLSR公司
CPTAC-1643:
CCT6A。
GIDPFSLDALSK公司
CPTAC-1644:
TGM2。
赛格泰克[+57.0]C[+57.0]GPVPVR
CPTAC-1645:
TIA1。
AAFAPFGR公司
CPTAC-1646:
TMEM43。
LEDPHVDIIR公司
CPTAC-1647:
TRA2A公司。
YGPLSGVNVYDQR公司

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
7岁(2+) 3.2 1.4 1.2 11.9 5 5 12.3 5.2 5.1 15 15 15
y3(1+) 10.6 5.1 4.6 19.3 5.9 8.8 22 7.8 9.9 15 15 15
y5(1+) 7.9 2.8 13.2 4.8 6.2 15.4 5.6 6.9 15 15 15
总和 2.4 1.2 0.9 11.9 4.7 5.1 12.1 4.9 5.2 15 15 15


其他资源和评论

评论

非CPTAC-3565的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
加拿大存托凭证1
顺序
GLDFEAK公司
修改类型
未修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
不适用
肽开始
443
肽末端
449
CPTAC标识
非CPTAC-3565
肽分子质量
778.3861
物种
穆斯 肌肉 (鼠标)
分析类型
直接MRM或SRM
矩阵
等离子
提交实验室
UVic-Genome BC蛋白质组学中心
提交实验室PI
克里斯托夫·博切尔斯

出版物

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使用500多反应监测质谱血浆分析对实验室小鼠菌株进行分子表型分析。Michaud SA、Sinclair NJ、PetrošováH、Palmer AL、Pistawka AJ、Zhang S、Hardie DB、Mohammed Y Eshghi A1、Richard VR、Sickmann A、Borchers CH.Commun Biol。2018年6月27日;1:78. doi:10.1038/s42003-018-0087-6。2018年eCollection。


分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
安捷伦6490/6495 QQQ
内部标准
合成肽
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
C端子K处的13C和15N
信用证
1290 LC(安捷伦)
色谱柱填料
Zorbax Eclipse Plus C18,1.8µm
立柱尺寸
2.1 x 150毫米
流速
400微升/分钟

分析复用 展开分析面板

太平洋西北国家实验室-方向SRM3

CPTAC-1593:
ABI2公司。
阿尔夫森纳
CPTAC-1594:
ALDH2。
VAEQTPLTALYVANLIK公司
CPTAC-1595:
ANP32B。
ELVLDNC[+57.0]克
CPTAC-1596:
AP1B1。
LLSTDPVAAK公司
CPTAC-1597:
ARPC2。
VFMGEFK(VFMQEFK)
CPTAC-1598:
BRD2。
LMFSNC[+57.0]YK公司
CPTAC-1599:
CDH1。
GLDARPEVTR公司
CPTAC-1600型:
CBX3。
DSDEADLVLAK公司
CPTAC-1601型:
CDC42。
NVFDEAILAALEPPK公司
CPTAC-1602:
CDK9。
IGQGTFGEVFK公司
CPTAC-1603:
C20或27。
LLSVVPVPEGYSVK公司
CPTAC-1604:
文档2。
DILLPVITK公司
CPTAC-1605:
EHD2。
腿板
CPTAC-1606:
EML1。
VQMQEDDIQLK公司
CPTAC-1607:
ENY2。
ALVPDSVK公司
CPTAC-1608:
图1:。
GILLFGPPGTGK公司
CPTAC-1609:
GRB2。
阿塔代尔斯夫克
CPTAC-1610:
GTPBP1。
VGDNDFLEVR公司
CPTAC-1611:
C15或38-AP3S2。
TGASWTDNIMAQK公司
CPTAC-1612:
HM13。
斯费皮克
CPTAC-1613:
EPHX1。
DVELLYPVK公司
CPTAC-1614:
ITGA1。
FGTAIAAVK公司
CPTAC-1615:
PRKCA公司。
GTEELYAIK公司
CPTAC-1616:
LNPK公司。
IVEYLVGDGPQNR公司
CPTAC-1617:
LRP1。
阿尔斯甘夫利克
CPTAC-1618:
MCM2。
格拉拉夫格普克
CPTAC-1619:
MTA1。
YQADITDLLK公司
CPTAC-1620:
千年虫。
TLVTLEQSR公司
CPTAC-1621:
NEK7。
VQIFDLMDAK公司
CPTAC-1622:
NF1。
LVFIDC[+57.0]PGK公司
CPTAC-1623:
FAM129A。
VLTSEDEYNLLSDR公司
CPTAC-1624:
NMRAL1。
LGFPGAR公司
CPTAC-1625:
OSBPL10。
LLEHGEEYVFTLPSAYAR公司
CPTAC-1626:
PIK3R1。
TATGYGFAEPYNLYSSLK公司
CPTAC-1627:
蛋白酶2。
AIYHDLEQSIR公司
CPTAC-1628:
第2页。
SVIDPVPAPVGDSHVDGAAK公司
CPTAC-1629:
PELP1。
TGSAVAPVHPPNR公司
CPTAC-1630:
PDGFRB。
LLGEVGTLQFAELHR公司
CPTAC-1631:
PIK3CA公司。
LINLTDILK公司
CPTAC-1632:
ARL6IP5。
AWDDFFPGSDR公司
CPTAC-1633:
RNF121。
长城汽车[+57.0]IVGK
CPTAC-1634:
波兰。
HFVGILNK公司
CPTAC-1635:
PDCD11。
VTPNEGLTVSFPFGK公司
CPTAC-1636:
SMARCA5。
TEQEEDELLTESSK公司
CPTAC-1637:
SSBP1。
SGDSEVYQLGDVSQK公司
CPTAC-1638:
STAT5B。
ATQLLEGLVQELQK公司
CPTAC-1639:
统计6。
SVSWSQFNK公司
CPTAC-1640:
STRN(弹簧)。
SELTDSASVLDNFK公司
CPTAC-1641:
SVIL公司。
YGSFEEASYPILNR公司
CPTAC-1642:
VARS公司。
NVIHPFLSR公司
CPTAC-1643:
第6a条。
GIDPFSLDALSK公司
CPTAC-1644:
TGM2。
赛格泰克[+57.0]C[+57.0]GPVPVR
CPTAC-1645:
TIA1。
AAFAPFGR公司
CPTAC-1646:
TMEM43。
LEDPHVDIIR公司
CPTAC-1647:
TRA2A公司。
YGPLSGVNVYDQR公司

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
b3(1+) 16.1 7.4 4.3 24.8 8.8 5.3 29.6 11.5 6.8 15 15 15
y6(2+) 25.3 10.6 9.6 23 12.8 9.2 34.2 16.6 13.3 15 15 15
y2(1+) 10.4 3.9 4 16.4 7.8 5.7 19.4 8.7 7 15 15 15
y4(1+) 10.9 7.7 4.2 25.8 10.6 6.4 28 13.1 7.7 15 15 15
y5(1+) 4.9 3.7 3.7 9.3 6.5 4.5 10.5 7.5 5.8 15 15 15
总和 5.2 2.7 12.8 6.5 3.7 13.8 7.2 4.6 15 15 15


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