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引用CPTAC分析门户时,请包括以下声明
我们感谢美国国家癌症研究所临床蛋白质组肿瘤分析联盟(CPTAC)分析门户网站(assesss.Cancer.gov)用于开发分析并建立本出版物中所述分析的标准。

概述数据来源:UniProt

官方基因符号 其他别名
甲基乙基酮3 不适用
序列长度(AA) 分子量(Da)
604 67068
蛋白质名称
NADP-依赖苹果酸酶,线粒体
来源
UniProt公司
磷化SitePlus®
基因卡
人类蛋白质阿特拉斯

蛋白质序列悬停以查看完整序列

10 20 30 40 50
MGAALGTGTR公司 LAPWPGRACG公司 ALPRWTPTAP公司 AQGCHSKPGP公司 ARPVPLKRG公司
60 70 80 90 100
YDVTRNPHLN公司 克格马夫特勒 LQLGIHGLIP公司 PCFLSQDVQL公司 LRIMRYYERQ公司
110 120 130 140 150
QSDLDKYIL公司 MTLQDRNEKL公司 财政年度V(V)L(左)T型S公司D类V(V)E类 K(K)FMPIVYTPT公司 VGLACQHYGL公司
160 170 180 190 200
TFRRPRGLFI公司 TIHDKGHLAT公司 MLNSWPEDNI公司 KAVVVTDGER公司 ILGLGDLGCY公司
210 220 230 240 250
GMGIPVGKLA公司 LYTACGGVNP公司 QQCLPVLLDV公司 GTNNEELLRD公司 PLYIGLKHQR公司
260 270 280 290 300
vhgkaydll公司 DEFMQAVTDK公司 FGINCLIQFE公司 DFANANAFRL公司 LNKYRNKYCM公司
310 320 330 340 350
FNDDIQGTAS公司 阴道的 里克克尔斯恩 VFVQGAGEA公司 AMGIAHLLVM公司
360 370 380 390 400
阿列克格夫卡 EATRKIWMVD公司 SKGLIVKGRS公司 HLNHEKEMFA公司 QDHPEVNSLE公司
410 420 430 440 450
EVVRLVKPTA公司 IIGVAAIAGA公司 FTEQILRDMA公司 SFHERPIIFA公司 LSNPTSKAEC公司
460 470 480 490 500
TAEKCYRVTE公司 希腊F类A类S公司S公司P(P) F类K(K)SVTLEDGK公司 TFIPGQGNNA公司 YVFPGVALGV公司
510 520 530 540 550
IAGGIRHIPD公司 EIFLLTAEQI公司 AQEVSEQHLS公司 QGRLYPPLST公司 IRDVSLRIAI病毒
560 570 580 590 600
KVLDYAYKHN公司 去年PEPKD KEAFVRSLVY公司 TPDYDSFTLD公司 SYTWPKEAMN公司
604
VQTV(VQTV)

数据来源:UniProt


蛋白质图谱 折叠蛋白图

靶向肽分析物相对于SNP、异构体和PTM的位置

Uniprot公司数据库登录 磷网站+®

单击节点上的点
查看下面的详细分析信息
所有其他点链接到 UniProt公司



磷酸化 乙酰化 泛素化 其他

加载

装载机

CPTAC-1537的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
ME3公司
顺序
吉法斯格斯普夫克
修改类型
未修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
不适用
肽开始
463
肽末端
472
CPTAC标识
CPTAC-1537型
肽分子质量
1,009.5233
物种
人类 智者 (人类)
分析类型
直接MRM或SRM
矩阵
卵巢癌肿瘤组织裂解物
提交实验室
太平洋西北国家实验室
提交实验室PI
刘涛(Tao Liu)

分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
TSQ华帝
内部标准
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
C端子K处的13C和15N
液晶显示器
Waters nanoACQUITY(零件号176016000)
色谱柱填料
Waters BEH C18,1.7 um 130º(零件号186007485)
立柱尺寸
100微米x 100毫米
流速
0.4微升/分钟

分析复用 展开分析面板

太平洋西北国家实验室-方向SRM1


色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
y8(2+) 8.4 6.1 5.6 20.8 29.4 23.6 22.4 30 24.3 15 15 15
y3(1+) 11.3 6.7 4.4 25.2 31.1 26.8 27.6 31.8 27.2 15 15 15
y6(1+) 3.2 7 2.4 25.1 30 23.8 25.3 30.8 23.9 15 15 15
7岁(1+) 5.8 6.6 4.1 23.4 32.4 25.2 24.1 33.1 25.5 15 15 15
总和 3.4 5.4 2.3 22.5 30.5 24.4 22.8 31 24.5 15 15 15


其他资源和评论

评论

CPTAC-1536的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
ME3公司
顺序
VLTSDVEK公司
修改类型
未修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
不适用
肽开始
124
肽末端
131
CPTAC标识
CPTAC-1536型
肽分子质量
889.4757
物种
人类 智者 (人类)
分析类型
直接MRM或SRM
矩阵
卵巢癌肿瘤组织裂解物
提交实验室
太平洋西北国家实验室
提交实验室PI
刘涛(Tao Liu)

分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
TSQ华帝
内部标准
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
C端子K处的13C和15N
液晶显示器
Waters nanoACQUITY(零件号176016000)
色谱柱填料
Waters BEH C18,1.7 um 130º(零件号186007485)
立柱尺寸
100微米x 100毫米
流速
0.4微升/分钟

分析复用 展开分析面板

太平洋西北国家实验室-方向SRM1


色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
y3(1+) 4.8 4.1 3.9 26.3 17.2 7.1 26.7 17.7 8.1 15 15 15
y4(1+) 11.8 4.2 4.6 23.9 16.3 9.9 26.7 16.8 10.9 15 15 15
y5(1+) 6.5 3.6 5.2 21.6 13.8 6.8 22.6 14.3 8.6 15 15 15
总和 4.5 2.3 3.3 22.6 15.4 6.9 23 15.6 7.6 15 15 15


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