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引用CPTAC分析门户时,请包括以下声明
我们感谢美国国家癌症研究所临床蛋白质组肿瘤分析联盟(CPTAC)分析门户网站(assesss.Cancer.gov)用于开发分析并建立本出版物中所述分析的标准。

概述数据来源:UniProt

官方基因符号 其他别名
PTMS公司 不适用
序列长度(AA) 分子量(Da)
102 11530
蛋白质名称
副胸腺素
来源
UniProt公司
磷化SitePlus®
基因卡
人类蛋白质阿特拉斯

蛋白质序列悬停以查看完整序列

10 20 30 40 50
瑞典克朗S公司E类A类A类A类 E类L(左)S公司A类K(K)DLKEK公司 KEKVEEKASR公司 科克科夫 EENGAEEEEE公司
60 70 80 90 100
预计 爱格(EGEEEDEEE) EEDDEGPALK公司 R(右)A类A类E类E类E类D类E类A类D类 P(P)K(K)R(右)QKTENGA公司
102
沙特阿拉伯

数据来源:UniProt


蛋白质图谱 折叠蛋白质图谱

靶向肽分析细胞相对于SNPs、异构体和PTM的位置

Uniprot公司数据库登录 磷网站+®

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磷酸化 乙酰化 泛素化 其他

加载

装载机

CPTAC-1533的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
PTMS公司
顺序
AAEEEDEADPKR公司
修改类型
未修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
不适用
肽开始
82
肽末端
93
CPTAC标识
CPTAC-1533型
肽分子质量
1,358.5950
物种
人类 智者 (人类)
分析类型
直接MRM或SRM
矩阵
卵巢癌肿瘤组织裂解物
提交实验室
太平洋西北国家实验室
提交实验室PI
刘涛(Tao Liu)

分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
TSQ华帝
内部标准
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
C端子R处的13C和15N
信用证
Waters nanoACQUITY(零件号176016000)
色谱柱填料
Waters BEH C18,1.7 um 130º(零件号186007485)
立柱尺寸
100微米x 100毫米
流量
0.4微升/分钟

分析复用 展开分析面板

太平洋西北国家实验室-方向SRM1


色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均批内CV
(天内CV)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
8岁(2+) 16.4 7.8 12.4 38.9 14.3 14.3 42.2 16.3 18.9 15 15 15
9岁(2+) 9.6 15.1 10.1 32.1 27.9 12.5 33.5 31.7 16.1 15 15 15
y10(2+) 7.1 6.9 4.3 26.1 18.3 13.7 27 19.6 14.4 15 15 15
总和 6.9 6 3.9 27.8 18 12.3 28.6 19 12.9 15 15 15


其他资源和评论

评论

CPTAC-1532的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
PTMS公司
顺序
SVEAAAELSAK公司
修改类型
未修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
不适用
肽开始
5
肽末端
15
CPTAC标识
CPTAC-1532型
肽分子质量
1074.5557美元
物种
人类 智者 (人类)
分析类型
直接MRM或SRM
矩阵
卵巢癌肿瘤组织裂解物
提交实验室
太平洋西北国家实验室
提交实验室PI
刘涛(Tao Liu)

分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
TSQ华帝
内部标准
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
C端子K处的13C和15N
信用证
Waters nanoACQUITY(零件号176016000)
色谱柱填料
Waters BEH C18,1.7 um 130º(零件号186007485)
立柱尺寸
100微米x 100毫米
流量
0.4微升/分钟

分析复用 展开分析面板

太平洋西北国家实验室-方向SRM1


色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均批内CV
(天内CV)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
7岁(1+) 18.1 4.4 6.8 54 37.8 40.1 57 38.1 40.7 15 15 15
8岁(1+) 14.7 8.8 53.4 36.3 37.5 55.4 37.4 37.6 15 15 15
9岁(1+) 4.8 4 63 36.6 37.4 63.2 36.8 37.5 15 15 15
总和 4.5 3.1 57.6 36.5 37.8 57.8 36.6 37.9 15 15 15


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