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在引用CPTAC分析门户时,请包括以下声明
我们感谢美国国家癌症研究所临床蛋白质组肿瘤分析联盟(CPTAC)分析门户网站(assesss.Cancer.gov)用于开发分析并建立本出版物中所述分析的标准。

美国资产负债管理委员会

概述数据来源:UniProt

官方基因符号 其他别名
美国资产负债管理委员会 MEMD公司
序列长度(AA) 分子量(Da)
583 65102
蛋白质名称
CD166抗原
来源
UniProt公司
磷化SitePlus®
基因卡
人类蛋白质阿特拉斯

蛋白质序列悬停以查看完整序列

10 20 30 40 50
消息GASSCR LLFCLLISAT有限责任公司 VFRPGLGWYT公司 VNSAYGDTII公司 IPCRLDVPQN公司
60 70 80 90 100
LMFGKWKYEK公司 PDGSPVFIAF公司 RSSTKK公司S公司V(V)Y(Y) D类D类V(V)P(P)E类Y(Y)K(K)博士L(左) N个L(左)S公司E类N个Y(Y)T型L(左)S公司
110 120 130 140 150
S公司N个A类R(右)ISDEKR公司 FVCMLVTEDN公司 VFEAPTIV千伏 FKQPSKPEIV公司 SK公司A类L(左)F类L(左)E类T型E类
160 170 180 190 200
L(左)K(K)KLGDCISE公司 DSYPDGNITW公司 YRNGKVLHPL公司 EGAVVIIFKK公司 EMDPVTQLYT公司
210 220 230 240 250
MTSTLEYKTT公司 KADIQMPFTC公司 SVTYYGPSGQ公司 KTIHSEQAVF公司 DIYYPTEQVT公司
260 270 280 290 300
IQVLPPKNAI公司 KEGDNITLKC公司 LGNGNPPPEE公司 FLFYLPGQPE公司 周长
310 320 330 340 350
TDVRRNATGD系统 YKCSLIDKKS公司 MIASTAITVH公司 YLDLSLNPSG公司 EVTRQIGDAL公司
360 370 380 390 400
PVSCTISASR公司 NATVVWMKDN公司 IRLRSSPSFS公司 SLHYQDAGNY公司 VCETALQEVE公司
410 420 430 440 450
GLKKRESLTL公司 IVEGKPQIKM公司 TKKTDPSGLS公司 K(K)T型C类H(H)V(V)E类G公司F类 P(P)K(K)P(P)A类W公司T型T型
460 470 480 490 500
G公司S公司G公司S公司V(V)N个T型E类 E类S公司P(P)Y(Y)N个G公司R(右) 斯基斯潘 VTLTCTAENQ公司 LERTVNSLNV公司
510 520 530 540 550
塞西佩德 阿迪斯德内尔 KVNDQAKLIV公司 吉夫格利拉 LVAGVVYWLY公司
560 570 580 583
MKKSKTASKH公司 VNKDLGNMEE公司 NKLEENNHK公司 TEA公司

数据来源:UniProt


蛋白质图谱 折叠蛋白质图谱

靶向肽分析物相对于SNP、异构体和PTM的位置

Uniprot公司数据库登录 磷网站+®

单击节点上的点
查看下面的详细分析信息
所有其他点链接到 UniProt公司



磷酸化 乙酰化 泛素化 其他

加载

装载机

CPTAC-6040的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
美国资产负债管理委员会
顺序
ALFLETEQLK公司
修改类型
未修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
不适用
肽开始
143
肽末端
152
CPTAC标识
CPTAC-6040型
肽分子质量
1,190.6547
物种
人类
分析类型
浓缩MRM
富集方法
不适用
矩阵
FFPE肺肿瘤组织裂解液池
提交实验室
弗雷德·哈钦森癌症研究中心
提交实验室PI
阿曼达·保罗维奇

出版物

查看详细信息 (在新窗口中打开)

Whiteaker JR、Zhao L、Schoenherr RM、Huang D、Lundeen RA、Voytovich U、Kennedy JJ、Ivey RG、Lin C、Murillo OD、Lorentzen TD、Colantonio S、Caceres TW、Roberts RR、Knotts JG、Reading JJ、Perry CD、Richardson CW、Garcia-Buntley SS、Bocik W、Hewitt SM、Chowdhury S、Vandermeer J、Smith SD、Gopal AK、Ramchurren N、Fling SP、Wang P、Paulovich AG。用于量化免疫调节蛋白的多重分析支持免疫治疗临床试验的相关研究。前Oncol。2023年5月2日;13:1168710. doi:10.3389/fonc.2023.1168710。PMID:37205196;预防性维修识别码:PMC10185886。


分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
QTRAP 5500号
内部标准
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
C端子K处的13C和15N
液晶显示器
Eksigent纳米LC 425
色谱柱填料
3µm ChromXP C18EP,120º
立柱尺寸
150 x 0.075毫米
流速
0.3微升/分钟

分析复用 展开分析面板

约翰·霍普金斯大学-F


色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
b3(1+) 13.4 5.6 6.8 16.8 8.3 7.2 21.5 10 9.9 15 15 15
y4(1+) 22.7 8 8.5 23.5 7.1 8.6 32.7 10.7 12.1 15 15 15
y5(1+) 17.9 5.6 6.4 20.8 7.9 8.9 27.4 9.7 11 15 15 15
y6(1+) 14.5 6.1 6.3 16.4 5.7 6.6 21.9 8.3 9.1 15 15 15
7岁(1+) 17.3 5.6 6.5 20.3 6.2 8.5 26.7 8.4 10.7 15 15 15
8岁(1+) 13.8 5.8 5.6 17.1 6.1 9.9 22 8.4 11.4 15 15 15
8岁(2+) 12.6 6.9 8.1 19.6 5 6.6 23.3 8.5 10.4 15 15 15
总和 13.7 5.8 6.1 17 6.1 7.4 21.8 8.4 9.6 15 15 15


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评论

CPTAC-1502的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
美国资产负债管理委员会
肽修饰顺序
LN[+1.0]LSEN[+1.0]YTLSISNAR公司
修改类型
脱酰胺的(N),脱酰胺的(N)
蛋白质-修饰位点
91, 95
肽-修饰位点
2, 6
肽开始
90
肽末端
104
CPTAC标识
CPTAC-1502型
肽分子质量
1,695.8315
物种
人类 智者 (人类)
分析类型
直接MRM
矩阵
人卵巢肿瘤组织消化
提交实验室
约翰霍普金斯大学
提交实验室PI
Daniel Chan、Hui Zhang、Zhen Zhang

分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
TSQ华帝
内部标准
稳定同位素标记肽
肽标准纯度
原油(约60%)
肽标准标签类型
C端子R处的13C和15N
液晶显示器
Accela 1250第四纪低泵
色谱柱填料
C18,3µm,300º
立柱尺寸
1.0毫米内径x 15厘米
流速
50微升/分钟

分析复用 展开分析面板

约翰·霍普金斯大学-F


色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
y6(1+) 47.7 14.4 5.1 45 17.1 9 65.6 22.4 10.3 15 15 15
7岁(1+) 79.9 45.9 10.2 97 51.6 10.1 125.7 69.1 14.4 15 15 15
8岁(1+) 105.9 33.6 9.6 107.3 39.6 9.9 150.8 51.9 13.8 15 15 15
总和 46.3 16 5.7 60 24 7.5 75.8 28.8 9.4 15 15 15


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CPTAC-1503的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
美国资产负债管理委员会
肽修饰顺序
TIIC[+57.0]HVEGFPKPAIQWTITGSGSVIN[+1.0]数量
修改类型
脱酰胺甲酰胺(C)(N)
蛋白质-修饰位点
435, 457
肽-修饰位点
4, 26
肽开始
432
肽末端
468
CPTAC标识
CPTAC-1503型
肽分子质量
4,100.0313
物种
人类 智者 (人类)
分析类型
直接MRM
矩阵
人卵巢肿瘤组织消化
提交实验室
约翰霍普金斯大学
提交实验室PI
Daniel Chan、Hui Zhang、Zhen Zhang

分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
TSQ华帝
内部标准
稳定同位素标记肽
肽标准纯度
原油(约60%)
肽标准标签类型
C端子R处的13C和15N
液晶显示器
Accela 1250第四纪低泵
色谱柱填料
C18,3µm,300º
立柱尺寸
1.0毫米内径x 15厘米
流速
50微升/分钟

分析复用 展开分析面板

约翰·霍普金斯大学-F


色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
9岁(1+) 23.9 9.1 8.2 19.3 7.7 8.5 30.7 11.9 11.8 15 15 15
y6(1+) 11.4 4.6 3.8 15 5.6 3.2 18.8 7.2 5 15 15 15
8岁(1+) 21.9 12.1 4.8 23 11.2 5.9 31.8 16.5 7.6 15 15 15
总和 8.4 4.3 3.5 11.6 4.9 2.8 14.3 6.5 4.5 15 15 15


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非CPTAC-3640的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
阿尔卡姆
顺序
SVQYDDVPEYK公司
修改类型
未修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
不适用
肽开始
77
肽末端
87
CPTAC标识
非CPTAC-3640
肽分子质量
1,341.6089
物种
穆斯 肌肉 (鼠标)
分析类型
直接MRM
矩阵
等离子
提交实验室
UVic-Genome BC蛋白质组学中心
提交实验室PI
克里斯托夫·博切尔斯

分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
安捷伦6490/6495 QQQ
内部标准
合成肽
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
C端子K处的13C和15N
液晶显示器
1290 LC(安捷伦)
色谱柱填料
Zorbax Eclipse Plus C18,1.8µm
立柱尺寸
2.1 x 150毫米
流速
400微升/分钟

分析复用 展开分析面板

约翰·霍普金斯大学-F


色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
8岁(1+) 11.5 6.3 4.7 20.8 8.3 7 23.8 10.4 8.4 15 15 15
b3(1+) 18.9 10.7 6.4 17.9 9 7.7 26 14 10 15 15 15
9岁(2+) 13.2 6.3 5.2 15 8.3 5 20 10.4 7.2 15 15 15
y2(1+) 11.4 8.7 6.9 22.8 10.9 6.7 25.5 13.9 9.6 15 15 15
y4(1+) 12.1 7 4.1 10.6 9.4 5.1 16.1 11.7 6.5 15 15 15
总和 3.5 3.6 1.7 7.9 5.2 3.6 8.6 6.3 4 15 15 15


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