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引用CPTAC分析门户时,请包括以下声明
我们要感谢美国国家癌症研究所的临床蛋白质组肿瘤分析联盟(CPTAC)检测门户网站(assays.cance.gov)用于开发分析并建立本出版物中所述分析的标准。

概述数据来源:UniProt

官方基因符号 其他别名
MBP公司 不适用
序列长度(AA) 分子量(Da)
169 18323
蛋白质名称
髓鞘碱性蛋白
来源
UniProt公司
磷化SitePlus®
基因卡
人类蛋白质阿特拉斯

蛋白质序列悬停以查看完整序列

10 20 30 40 50
AAQKRPSQRS公司 基拉萨斯特姆 HAR公司H(H)G公司F类P(P)R(右)H(H) RDTGILDSLG公司 RFFGSDRGAP公司
60 70 80 90 100
KRGSGKDGHH公司 AARTTHYGSL公司 PQKAQGHRPQ认证 DENPVHFFK公司 NIVTPRTPPP公司
110 120 130 140 150
SQGKGRGLSL公司 SRFSWGAEGQ公司 KPGFGYGGRA公司 SDYKSAHKGL公司 千克/小时
160 169
KIFKLGGRDS公司 RSGSPMARR公司

数据来源:UniProt


蛋白质图谱 折叠蛋白图

靶向肽分析物相对于SNP、异构体和PTM的位置

Uniprot公司数据库登录 磷网站+®

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磷酸化 乙酰化 泛素化 其他

加载

装载机

CPTAC-1475的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
MBP公司
序列
HGFLPR公司
修改类型
未修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
不适用
肽开始
24
肽末端
29
CPTAC标识
CPTAC-1475型
肽分子质量
725.3973
物种
Bos公司 金牛 (牛)
分析类型
直接MRM
矩阵
耗尽消化血浆
提交实验室
布罗德学院
提交实验室PI
史蒂文·卡尔

出版物

查看详细信息 (在新窗口中打开)

大规模实验室间研究,以开发、分析验证和应用高度多重定量肽分析来测量血浆中与癌症相关的蛋白质。Abbatiello SE、Schilling B、Mani DR、Zimmerman LJ、Hall SC、MacLean B、Albertelle M、Allen S、Burgess M、Cusack MP、Gosh M、Hedrick V、Held JM、Inerowicz HD、Jackson A、Keshishihian H、Kinsinger CR、Lyssand J、Makowski L、Mesri M、Rodriguez H、Rudnick P、Sadowski P、Sedrask N、Shaddox K、Skates SJ、Kuhn E、Smith D、Whiteaker JR、Whitwell C、Zhang S,Borchers CH、Fisher SJ、Gibson BW、Liebler DC、MacCoss MJ、Neubert TA、Paulovich AG、Regnier FE、Tempst P、Carr SA。分子细胞蛋白质组学。2015年9月;14(9):2357-74. doi:10.1074/mcp。M114.047050。Epub 2015年2月18日。PMID:25693799


分析参数 塌陷分析参数

数据来源:全景

仪器
匡提瓦TSQ
内部标准
重稳定同位素肽(δ8-10)
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
15亿
信用证
Easy NanoLC1000
色谱柱填料
阻垢剂C18,1.9um,200A
立柱尺寸
0.075 x 150毫米
流速
200 nL/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
y5(1+) 2.1 1.2 4.7 6.7 3.6 5.6 7 3.8 15 15 15
y4(1+) 3.2 2.6 1.8 4.9 6.8 4 5.9 7.3 4.4 15 15 15
y3(1+) 4 3.6 3.7 5.9 8.4 4.7 7.1 9.1 6 15 15 15
总和 2.5 2.1 1.3 4.5 6.7 3.7 5.1 7 3.9 15 15 15


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