MESSI公司 swMATH ID: 33875 软件作者： 梅赛德斯·佩雷斯·米兰（Mercedes Pérez Milán）、艾丽西娅·狄肯斯坦（Alicia Dickenstein） 描述： MESSI生物系统的结构。我们介绍了一个生物系统的一般框架，称为MESSI系统，它描述了酶底物或与中间体交换类型的修饰，并基于网络结构证明了一般结果。许多翻译后修饰网络都是MESSI系统。例如：[Feliu和Wiuf（2012a）]中的基序、顺序分布和过程多位点磷酸化网络、[Angeli等人（2007）]中大多数示例、磷酸化级联、[Kothamachu等人（2015）]中所述的双组分系统、[Shinar和Feinberg（2010）]中细菌EnvZ/OmpR网络以及所有线性网络。我们表明，在质量作用动力学下，MESSI系统是保守的。我们通过显式消除中间络合物简化了对这些系统稳态的研究，并给出了条件以确保对各种稳态进行显式合理参数化（受[Feliu和Wiuf（2013a，2013b），Thomson和Gunawardena（2009）]的启发）。我们定义了具有复曲面稳态的MESSI系统的一个重要子类[Pérez Millán等人（2012）]，并为具有复曲面稳定状态的MESSI系统提供了一个简单的算法来确定其多稳态能力。在这种情况下，该算法基于定向拟阵理论，提供了发生多平稳性的速率常数。 主页： https://arxiv.org/abs/1612.08763 相关软件： 重新记录；QEPCAD公司；枫叶；crntwin公司；CoNtRol公司；二进制值.m2；雏菊；数学软件；单一；西安的；贝尔蒂尼；Maple二项式；GNU并联；RAGlib公司；parest_dae；数字代数几何；投影CAD；寄生虫学；正则链；PHC包 引用于： 24文件 标准条款 1出版物描述软件，包括1出版物在zbMATH中 年份 MESSI生物系统的结构。 Zbl 1395.92071号梅赛德斯·佩雷斯·米兰；艾丽西娅·迪肯斯坦 2018 全部的 前5名42位作者引用 6 伊利森达·费利乌 5 艾丽西亚·迪肯斯坦。 4 托马斯·斯特姆 三 梅赛德斯·佩雷斯·米兰 三 哈米德·拉科伊 三 Shiu，Anne（安妮·休） 2 卡斯滕·康拉迪 2 蒂莫·德·沃尔夫 2 德米特里·格里戈列夫 2 亚历山德鲁·约西夫 2 尼迪·凯恩萨 2 阿米尔·霍森·萨德吉马内什 2 唐晓仙 2 安德烈亚斯·古恩特·韦伯 2 奥乌尚·尤鲁克 1 亚历山大·巴拉班奇科夫 1 弗莱德里克·比汉 1 罗素·J·布拉德福德。 1 格奥尔赫·克雷西恩 1 詹姆斯·哈罗德·达文波特 1 阿比舍克·德什潘德 1 英格兰，马修 1 哈桑·埃拉米 1 弗拉基米尔·彼得罗维奇·格特 1 马加里·贾罗利 1 格罗斯，伊丽莎白 1 Jeremy Gunawardena 1 海瑟·A·哈灵顿。 1 查尔斯·塔普利·霍伊特 1 加布里埃拉·杰罗尼莫 1 马修·约翰斯顿。 1 托马斯·卡勒 1 马雷克·科什塔 1 Daniel A.Lichtblau。 1 尼科莱特·梅什卡特 1 玛雅·明切瓦 1 斯特凡·米勒 1 潘提亚，卡西安·亚历山德鲁 1 奥维迪乌·拉杜列斯库 1 巴勃罗·索勒诺 1 安吉丽卡·托雷斯 1 王杰 全部的 前5名9篇连载文章中引用 7 数学生物学通报 三 数学生物学杂志 三 SIAM应用动力系统杂志 2 符号计算杂志 1 应用数学进展 1 动力学和微分方程杂志 1 离散和连续动力系统。B系列 1 数学生物科学与工程 1 计算机科学中的数学 全部的 前5名10个领域引用 22 生物学和其他自然科学（92-XX） 7 交换代数（13-XX） 5 代数几何（14-XX） 4 常微分方程（34-XX） 三 动力系统和遍历理论（37至XX） 三 计算机科学（68至XX） 1 组合数学（05-XX） 1 场论和多项式（12-XX） 1 凸和离散几何（52至XX） 1 经典热力学，传热（80-XX） 按年份列出的引文