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基于数值离散化的常微分方程模型的惩罚样条平滑估计方法及其在生物医学研究中的应用。 (英语) Zbl 1274.62906号

概述:微分方程广泛用于工程、物理和生物医学等许多科学领域的物理过程动力学建模。微分方程模型的参数估计是一个具有挑战性的问题,因为其计算成本高,参数空间高。在这篇文章中,我们提出了一类新的估计常微分方程(ODE)模型参数的方法,这是由HIV动力学模型驱动的。新方法利用ODE解算器的数值离散化算法形式来形成估计方程。首先,采用惩罚样条方法估计状态变量,然后将估计的状态变量插入ODE求解器的离散化公式中,通过回归方法获得ODE参数估计值。我们考虑了三种不同阶数的离散化方法:欧拉方法、梯形规则和龙格库塔方法。高阶数值算法减少了导数近似中的数值误差,从而产生更准确的估计,但其计算成本较高。为了平衡计算成本和估计精度,我们通过仿真研究证明,基于梯形离散化的估计是最好的,建议实际使用。建立了所提出的基于数值离散化的估计量的渐近性质。通过对所提方法和现有方法的比较,可以看出所提方法在权衡计算成本和估计精度方面的明显优势。我们将建议的方法应用于一项HIV研究,以进一步说明建议的方法的有用性。

MSC公司:

62页第10页 统计学在生物学和医学中的应用;元分析
65C60个 统计中的计算问题(MSC2010)
65D05型 数值插值
65升06 常微分方程的多步、Runge-Kutta和外推方法
92 C50 医疗应用(通用)

软件:

半标准杆
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参考文献:

[1] Bickel,《估计积分平方密度导数:夏普最佳收敛阶估计》,Sankhy 50 pp 381–(1988)·Zbl 0676.62037号
[2] Brunel,通过非参数估计器对常微分方程进行参数估计,《电子统计杂志》第2卷第1242页–(2008年)·Zbl 1320.62063号 ·doi:10.1214/07-EJS132
[3] Chen,确定性动力学模型中时变系数的有效局部估计及其在HIV-1动力学中的应用,美国统计协会杂志103 pp 369–(2008a)·Zbl 1469.62365号 ·doi:10.1198/0162145000001382
[4] Chen,确定性动态模型中时变参数的估计及其在HIV感染中的应用,《中国统计研究院》第1(8)页987–(2008b)
[5] 陈,用微分方程模拟基因表达,太平洋生物计算研讨会4,第29页–(1999)
[6] Claeskens,惩罚样条估计量的渐近性质,生物统计学96 pp 529–(2009)·Zbl 1170.62031号 ·doi:10.1093/biomet/asp035
[7] Craven,《用样条函数平滑噪声数据:通过广义交叉验证估计正确的平滑度》,《数值数学》31第337页–(1979)·Zbl 0377.65007号
[8] de Boor,《样条实用指南》(2001年)
[9] Eliers,使用B样条和惩罚的灵活平滑(带讨论),《统计科学》11第89页–(1996)·Zbl 0955.62562号 ·doi:10.1214/ss/1038425655
[10] Gasser,用核方法估计回归函数及其导数,《斯堪的纳维亚统计杂志》11第171页–(1984)·Zbl 0548.62028号
[11] Hairer,解常微分方程I:非刚性问题(1993)·Zbl 0789.65048号
[12] 霍尔,惩罚样条回归理论,Biometrika 92 pp 105–(2005)·Zbl 1068.62045号 ·doi:10.1093/biomet/92.1.105
[13] Hemker,系统模拟和参数估计中微分方程的数值方法,生物化学系统的分析和模拟,第59页–(1972)
[14] Hemker,系统模拟和参数估计中微分方程的数值方法,生化系统的分析和模拟,第59页–(1972)
[15] 黄,二次回归泛函的非参数估计,Bernoulli 5 pp 927–(1999)·Zbl 0938.62041号 ·doi:10.2307/3318450
[16] 黄,纵向HIV动态系统参数估计的层次贝叶斯方法,《生物统计学》62页413–(2006)·兹比尔1097.62128 ·doi:10.1111/j.1541-0420.2005.00447.x
[17] 黄,估计HIV动态模型抗病毒疗效的贝叶斯方法,《应用统计杂志》33页155–(2006)·Zbl 1106.62121号 ·doi:10.1080/0266476500250552
[18] Kauermann,广义惩罚样条拟合的一些渐近结果,皇家统计学会杂志:B辑(统计方法)71页487–(2009)·Zbl 1248.62055号 ·doi:10.1111/j.1467-9868.2008.00691.x
[19] Li,关于缺陷样条曲线的渐近性,Biometrika 95 pp 415–(2008)·Zbl 1437.62540号 ·doi:10.1093/biomet/asn010
[20] Li,常微分方程的参数估计,IMA数值分析杂志25 pp 264–(2005)·Zbl 1070.65061号 ·doi:10.1093/imanum/drh016
[21] Liang,在非线性微分方程模型中估计HIV感染的常量和时变动态参数,搜索结果应用统计年鉴4第460页–(2009)
[22] Liang,使用回归测量误差框架对微分方程模型进行参数估计,《美国统计协会杂志》103 pp 1570–(2008)·Zbl 1286.62039号 ·doi:10.19198/0162114508000000797
[23] Matteij,《理论与实践中的常微分方程》(2002)·Zbl 1016.34001号 ·数字对象标识代码:10.1137/1.9780898719178
[24] O'Sullivan,《关于不适定逆问题的统计观点(讨论)》,《统计科学》第1卷第505页–(1986年)
[25] Poyton,使用主微分分析的连续时间动态模型中的参数估计,《计算机与化学工程》30 pp 698–(2006)·doi:10.1016/j.compchemeng.2005.11.008
[26] 推杆,HIV动态模型中参数估计的贝叶斯方法,《医学统计学》21页2199–(2002)·doi:10.1002/sim.1211
[27] Qi,常微分方程参数广义剖面估计的渐近效率和有限样本性质,《统计学年鉴》38,第435页–(2010)·Zbl 1181.62156号 ·doi:10.1214/09-AOS724
[28] 拉姆齐,《主微分分析:微分算子的数据简化》,《皇家统计学会杂志:B辑(统计方法)》,58页,495页–(1996)·Zbl 0853.62043号
[29] Ramsay,微分方程的参数估计:广义平滑方法(讨论),《皇家统计学会杂志:B辑(统计方法)》,第5页,741–(2007)·doi:10.1111/j.1467-9868.2007.00610.x
[30] Ruppert,半参数回归(2003)·Zbl 1038.62042号 ·doi:10.1017/CBO9780511755453
[31] 舒梅克,《样条函数:基础理论》(1981年)
[32] Varah,微分方程数值参数估计的样条最小二乘法,SIAM科学与统计计算杂志3第28页–(1982)·Zbl 0481.65050号 ·数字对象标识代码:10.1137/0903003
[33] Varziri,选择iPDA中的最优加权因子用于连续时间动态模型中的参数估计,计算机和化学工程32第3011页–(2008)·doi:10.1016/j.compchemeng.2008.04.005
[34] Wand,《关于用O'Sullivan惩罚样条函数进行半参数回归的研究》,《澳大利亚和新西兰统计杂志》50页179页–(2008)·Zbl 1146.62030号 ·doi:10.1111/j.1467-842X.2008.00507.x
[35] Wu,《体内HIV-1人群动态:艾滋病临床试验病毒学数据的适用模型和推断工具》,《生物统计学》55,第410页–(1999)·Zbl 1059.62735号 ·doi:10.1111/j.0006-341X.1999.00410.x
[36] Xue,Sieve通过考虑数值误差和测量误差对非线性常微分方程模型中常数和时变系数的估计,《统计学年鉴》38第2351页–(2010)·Zbl 1203.62049号 ·doi:10.1214/09-AOS784
[37] Yu,部分线性单指数模型的惩罚样条估计,美国统计协会杂志97 pp 1042–(2002)·Zbl 1045.62035号 ·doi:10.1198/016214502388618861
[38] 周,回归样条和置信区的局部渐近性,《统计年鉴》26页1760–(1998)·兹比尔0929.62052 ·doi:10.1214/aos/1024691356
[39] 周,关于样条估计中的导数回归,《统计》,第10页,93–(2000)·Zbl 0970.62024号
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