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安德烈亚斯·海内克;叶丽峰;玛丽亚·德·伊奥里奥;蒂莫西·埃贝尔斯

基于J分辨核磁共振波谱的代谢物贝叶斯反褶积和量化。 （英语） Zbl 1480.62254号

贝叶斯分析。 16，编号2，425-458（2021）.
摘要：二维（2D）核磁共振（NMR）方法在代谢组学中越来越流行，因为它们在准确识别和量化复杂生物样品中的代谢物方面具有巨大潜力。2D（^1）文本{H}，J分辨（JRES）核磁共振波谱是一种广泛使用的方法，它将重叠共振扩展到第二维。然而，现有的分析处理方法没有充分利用JRES光谱中的信息，更重要的是，没有提供与感兴趣量估算相关的不确定性度量，例如代谢物浓度。结合数据生成机制和在线数据库中广泛的先验知识，我们开发了一种贝叶斯方法来分析2D JRES数据，该方法允许自动反褶积、识别和量化代谢物。该模型扩展和改进了以往对一维核磁共振谱数据的研究。我们的方法基于B样条紧小波框架和理论模板的组合，从而能够在推理框架内自动合并专家知识。后验推理是通过专门设计的马尔可夫链蒙特卡罗方法进行的。我们通过对血清和尿液数据集的分析来证明我们的方法的性能，显示了我们提出的方法在鉴定和量化代谢物方面的优势。

MSC公司：

第62页，第35页 统计学在物理学中的应用
2015年1月62日 贝叶斯推断
62华氏35 多元分析中的图像分析
65二氧化碳 蒙特卡罗方法
65T60型 小波的数值方法

关键词：

MCMC公司;代谢组学;核磁共振波谱;收缩先期;小波框架

软件：

海豚;自旋耦合器;t形走道;Nmrglue胶水;Rtwalk公司;BioMagResBank公司;蝙蝠侠
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\textit｛A.Heinecke｝等人，贝叶斯分析。16，编号2，425--458（2021；Zbl 1480.62254）
全文： 内政部

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