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赵俊松;金伯利·D·齐格蒙德。;达里尔·柴田;保罗·马约拉姆

肿瘤的祖先推断：我们能知道多少？ （英语） Zbl 1412.92165号

J.西奥。生物。 359, 136-145 (2014)。
摘要：肿瘤被认为是从单个细胞和基因组开始的。然而，最终肿瘤中的基因组通常是异质的。这种瘤内异质性（ITH）的奥秘尚未揭开，但大部分ITH可能是复制错误的继发因素。胞嘧啶碱基的甲基化通常表现为ITH，因此可能编码肿瘤的祖先。在本研究中，我们通过亚硫酸氢盐测序测量了9例大肠肿瘤中特定CpG区域的乘客甲基化模式，并应用肿瘤发展模型。基于我们的模型，我们能够使用近似贝叶斯计算检索关于每个肿瘤祖先的信息。通过大型模拟研究，我们探索了可以估计模型参数的条件，以及第一个变换单元的初始状态。最后，我们将我们的分析应用于临床数据，以深入了解肿瘤形成的动力学。

MSC公司：

92 C50 医疗应用（通用）
62页第10页 统计学在生物学和医学中的应用；元分析

关键词：

祖先;近似贝叶斯计算;甲基化;甲基化错误率;癌症干细胞数量
PDF格式BibTeX公司 XML格式引用
\textit{J.Zhao}等人，J.Theor。生物359，136--145（2014；Zbl 1412.92165）
全文： 内政部 链接

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