ModelCIF工作组
该工作组(WG)专注于开发用于表示和存档计算结构模型的通用数据标准和软件工具。工作组参与开发型号CIF扩展PDBx/mmCIF数据字典,为存档计算结构模型提供数据表示。工作组促进采用型号CIF计算结构生物学社区中的数据标准,并参与支持型号CIF,例如python-modelcif软件库。
ModelCIF数据标准由模型存档和MODBASE(国防数据库)强烈建议研究团队使用ModelCIF数据标准从自己的门户网站上获取计算结构模型,并在适当的情况下将其计算结构模型存入ModelArchive,以确保长期保存和公众访问。
成员
- Ivan Anischanka,RoseTTAFold/华盛顿大学
- Stefan Bienert,模型档案馆/巴塞尔大学
- 罗格斯大学RCSB蛋白质数据库Stephen K.Burley
- Dennis Piehl,罗格斯大学RCSB蛋白质数据库
- Ian Silitoe,Genome3D/伦敦大学学院
- Gerardo Tauriello,巴塞尔大学模型档案馆
- James Tolchard,欧洲蛋白质数据库/欧洲生物信息研究所
- Brinda Vallat,RCSB蛋白质数据库/罗格斯大学
- Mihaly Varadi,欧洲蛋白质数据库/欧洲生物信息学研究所
- Sameer Velankar,欧洲蛋白质数据库/欧洲生物信息研究所
- Benjamin Webb,MODBASE/旧金山加利福尼亚大学
- Wei Zheng,I-TASSER/密歇根大学
- Augustin Zidek,AlphaFold/Depmind公司
会议
该小组几乎每月举行一次会议,讨论型号CIF和相关工具。