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结构生物学
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欧洲生物信息研究所
表观遗传学和神经生物学
示例:1001,载脂蛋白,断层扫描术,罗斯曼MG,第5A1A章
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电子显微镜数据库(EMDB)是低温样品电子显微镜的公共存储库大分子复合物和亚细胞结构的体积(低温EM)和代表性层析图。它涵盖了多种技术,包括单粒子分析、螺旋重建、,电子层析成像、亚谱平均和电子晶体学。 更多。。。
截至2024年4月24日,EMDB包含34953条目(最新条目,趋势)。
2024年1月6日:我们高兴地分享,ELIXIR已将EMDB正式提升为核心数据资源,并将其视为对更广泛的生命科学界和生物数据长期保存具有根本重要性的欧洲数据资源。
2023年11月22日:我们很高兴分享EMDB核酸研究论文的最新版本。本文描述了EMDB在全球蛋白质数据库背景下的最新发展和未来计划。现在就去看看吧! https://doi.org/10.1093/nar/gkad1019
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结合CF101的腺苷受体A3AR的冷冻电镜结构
秀丽线虫gamma-tubulin环复合体在有丝分裂中心体中的原位亚序列平均值
Gabija AB复合体的结构
SARS-CoV-2 Omicron BQ.1.1变异尖峰蛋白与MO11 Fab复合
严重急性呼吸系统综合征冠状病毒2型EG.5.1刺突糖蛋白(闭路1状态)
CRISPR-Cas III-D型效应物复合物
糠秕热球菌apo型RNA聚合酶开放钳构象的冷冻电镜结构
无底物酵母不对称Pho90二聚体的CryoEM结构。
chEnv TTT蛋白与CM01A Fab复合物
C3 MG-ring的聚焦冷冻电镜图*
SFTSV L蛋白的结构停滞在转录特异的早期延伸状态,带有结合帽RNA[转录-早期延伸]
芽孢杆菌PS3,state3,核苷酸缺失条件下的非催化位点缺失和εC末端结构域缺失FoF1-ATP酶
与大肠杆菌转录复合物结合的完全招募的RfaH在ops位点暂停(非完全互补支架;RfaH的替代状态)
小鼠肝脏的C呼吸体
人类复制蛋白A(RPA;三聚体核心)-ssDNA复合物
与LpxC复合物中的LapB细胞质结构域
大肠杆菌RNA聚合酶在ops位点暂停
BTV空病毒粒子的冷冻电镜结构
ATP饱和条件下,芽孢杆菌PS3状态1的非催化位点缺失和εC末端结构域缺失FoF1-ATPase
H7N9 HA-C4H4工厂
CRISPR-CasⅢ-D型效应器复合物局部细化图
设计的基于AAV8的矢量的Cryo-EM结构
氯霉素处理的肺炎支原体细胞中含有a、P和E位点tRNA的70S核糖体,K3数据
原位测定核周NEC包被囊泡中单纯疱疹病毒1型衣壳(WT)顶点
SFTSV L蛋白在无冠状病毒RNA转录激发状态下的结构[转录激发(体外)]
与LOV2融合的Mi3的Cryo-EM结构
在预切割状态下与自靶RNA结合的CRISPR-Cas III-D型效应物复合物
1033支架基DNA折纸纳米结构V4和TBA的冷冻电镜结构
酵母与底物的对称Pho90二聚体的CryoEM结构。
H7N9 HA-1H9工厂
小鼠肝脏开放复合物I
大肠杆菌转录复合物在ops位点暂停并与RfaH和NusA结合
糠秕热球菌apo型RNA聚合酶收缩钳构象的冷冻电镜结构
氯霉素处理的肺炎支原体细胞中含有a和P位点tRNA的70S核糖体,K3数据
Mi3与FKBP融合的低温电磁结构
肺炎克雷伯菌封装素相关DyP过氧化物酶
用TBA对1033支架DNA折纸纳米结构V4的第二体进行精细化
酵母纺锤极体成核的天然微管晶格结构
与Spt4/5结合的糠秕热球菌转录延伸复合物的冷冻电镜结构
人副流感病毒hPIV3单体L-P聚合酶的冷冻电镜结构
ATP饱和条件下,芽孢杆菌PS3状态2的非催化位点缺失和εC末端结构域缺失FoF1-ATPase
汉防己甲素(TET)与人高压激活L型钙通道CaV1.2复合物的冷冻电镜结构
与大肠杆菌转录复合物结合的自抑制RfaH在ops位点暂停(遇到复合物)
SARS-CoV-2 EG.5.1棘突糖蛋白(闭合-2状态)
氯霉素处理的肺炎支原体细胞中含有EF-Tu-tRNA和P位点tRNA的70S核糖体,K3数据
SARS-CoV-2 Nsp15,载脂蛋白
循环排列50S核糖体亚单位组装中间体CP45 C1级的结构
载脂蛋白状态人Cav3.2的冷冻电镜结构
氯霉素处理的肺炎支原体细胞中含有EF-Tu-tRNA、P和E位点tRNA的70S核糖体,K3数据
与靶RNA结合的CRISPR-Cas III-D型效应物复合物
与大肠杆菌转录复合物结合的完全招募的RfaH在ops位点暂停(非互补支架)
状态3中与DbpA相关的pre50S的全局结构
芽孢杆菌PS3,state2,核苷酸缺失条件下的非催化位点缺失和εC末端结构域缺失FoF1-ATP酶
来自无底物酵母的对称Pho90二聚体的CryoEM结构。
结合CF102的腺苷受体A3AR的冷冻电镜结构
用TBA对1033支架型DNA折纸纳米结构V4的第三体进行精细化
小鼠脑开放复合物I
SARS-CoV-2 EG.5.1棘突糖蛋白(1-向上状态)
人体RAD52开环构造
BTV预芯的低温电磁结构
在ATP饱和条件下,芽孢杆菌PS3状态3的非催化位点缺失和εC-末端结构域缺失的FoF1-ATP酶
MsbA与神经节苷酸C结合
转录复合体在ops位点暂停并结合到自抑制的RfaH,而不是完全互补的支架
肺炎克雷伯菌DyP过氧化物酶包衣蛋白外壳
pH 8.0下五聚体形式的光驱动钠泵ErNaR的Cryo-EM结构
天然y-Tubulin环复合物(yTuRC)在纺锤体极体处覆盖微管负端的结构
氯霉素处理的肺炎支原体细胞中含有A、P和E位点tRNA的70S核糖体,K3数据
VP3-VP6异质六聚体的低温电磁结构
人RAD52开环-ssDNA复合物
从核周小泡原位测定单纯疱疹病毒1型核出口复合物(WT)
人Cav3.2与TTA-A2的冷冻电镜结构
Gabija AB综合体1的结构
人副流感病毒3型血凝素-神经氨酸酶:与rPIV3-23和rPIV2-28 Fabs的复合物
人体RAD52闭合环
BTV铁芯的低温电磁结构
大肠杆菌转录复合体在ops位点暂停,RfaH被完全招募
2873支架DNA折纸V2的结构
组装在肽盘中的大肠杆菌细胞色素bo3喹啉氧化酶的冷冻电镜结构
大肠杆菌RNA聚合酶在ops位点暂停(非互补支架)
来自小鼠肝脏的封闭复合物I
火烧球菌apo型RNA聚合酶与Spt4/5收缩钳构象的冷冻电镜结构
人体NOX5激活的结构基础
2873支架DNA折纸V3的结构
y-Tubulin小复合体(yTuSC)的结构是天然y-Tubullin环状复合体(y TuRC)的一部分,覆盖纺锤极体处的微管负端
人Cav3.2与TTA-P2的冷冻电镜结构
小鼠肝脏CS呼吸体
芽孢杆菌PS3,state1,核苷酸缺失条件下的非催化位点缺失和εC末端结构域缺失FoF1-ATP酶
1033支架基DNA折纸纳米结构V4的脱盐纯化钉结构
肺炎克雷伯菌SUMO载囊蛋白壳
硒代半胱氨酸合酶-SelA
SARS-CoV-2 Nsp15与poly(A/U)RNA结合,状态2
重组成脂质纳米盘的人γ-分泌酶PSEN1 APH-1B亚型载脂蛋白的结构
H7N9 HA-2D7工厂
氯霉素处理的肺炎支原体细胞中含有A*和P/E位点tRNA的70S核糖体,K3数据
BTV病毒在宿主细胞中的亚谱平均
BTV空芯的低温电磁结构
与Gs和人降钙素基因相关肽复合的人胰淀素1受体
H7N9-HA蛋白的冷冻电镜结构
BTV空预堆芯的低温EM结构
秀丽线虫有丝分裂中心体微管的原位亚序列平均值
与大肠杆菌转录复合物结合的完全招募的RfaH在ops位点暂停(RfaH的替代状态)
CRISPR-Cas III-D型效应器复合物共识图
2873支架DNA折纸V1的结构
XBB.1.5与BD55-1205复合物中的尖峰蛋白
与靶RNA共识图结合的CRISPR-Cas III-D型效应物复合物
BTV亚核的低温电磁结构
以1033支架为基础的DNA折纸纳米结构V4第一体为焦点的TBA精细化
人副流感病毒hPIV3二聚体L-P聚合酶的冷冻电镜结构
pH 4.3下五聚体形式的光驱动钠泵ErNaR的Cryo-EM结构
鼠脑闭合复合物I
C3的TE-CUB聚焦冷冻电子显微镜图*
BCCP-CTS状态的人3-甲基巴豆酰辅酶A羧化酶
共识图:CW Flagellar Switch Complex-从沙门氏菌形成C环的FliF、FliG、FliM和FliN
人NCX1与SEA0400复合物的低温电磁结构
人高压激活L型钙通道CaV1.2(apo)的低温电磁结构
在切割后状态下与自靶RNA结合的CRISPR-Cas III-D型效应物复合物
流感病毒神经氨酸酶N1 NC13外结构域和四臂结构域柄
用6.1 mrad的CSA记录TMV的低剂量冷冻电子ptychography重建
合成的claudin-4复合物与产气荚膜梭菌肠毒素C末端结构域、sFab COP-2和纳米体的冷冻电镜结构
人3型副流感病毒F三聚体与rPIV3-18 Fab复合物
BTV病毒粒子的冷冻电镜结构
人高压激活L型钙通道CaV1.2与贝尼地平(BEN)复合物的冷冻电镜结构
1033支架基DNA折纸纳米结构V4的高效液相色谱纯化钉的结构
SFTSV L蛋白在转录-配基状态下的结构与结合帽RNA【转录-配位】
线虫中心体中心粒的原位亚序列平均值
人Cav3.2与ML218的冷冻电镜结构
循环排列50S核糖体亚单位组装中间体CP45 B级的结构
氯霉素处理的肺炎支原体细胞中的多聚体/双核糖体Ⅰ类
人γ分泌酶PSEN1 APH-1B亚型与Ab46复合物重组成脂质纳米盘的结构
C3*组合图(复合结构)
体外组装粒子前亚核的冷冻电镜结构
以C3的MG7为中心的均匀精炼Cryo-EM图*
氯霉素处理的肺炎支原体细胞中含有A和P位点tRNA的70S核糖体,K3数据
循环排列50S核糖体亚单位组装中间体CP63 C级的结构
人Cav3.2与ACT-709478的冷冻电镜结构
秀丽线虫胚胎细胞有丝分裂中心体的冷冻-ET
严重急性呼吸系统综合征冠状病毒2型Nsp15与聚(A/U)RNA结合,共有形式
由伪对称三聚体分层构建的从头设计T=4二十面体纳米笼的CryoEM图;设计Ico(T=4)-4
CRISPR-Cas III-D型效应物复合物与靶RNA局部精细化图结合
循环过沉默50S核糖体亚单位组装中间体CP63 E1类的结构
BTV预分芯的低温电磁结构
SARS-CoV-2 Nsp15与poly(A/U)RNA结合,状态1
BTV星子核的低温电磁结构
小鼠肝脏的呼吸体
chEnv TTT蛋白与43A2 Fab复合物
回溯大肠杆菌转录复合体暂停在ops位点并与RfaH结合
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