PDBx/mmCIF工作组

该工作组为词典内容提供指导，并在结构生物学方法开发人员中推广该标准。工作组定期与wwPDB举行会议。

成员

Paul Adams，LBL（Phenix），主席
牛津大学保罗·埃姆斯利（Coot）
Nigel Moriarty，LBL（凤凰）
Garib Murshudov，LMB-MRC（REFMAC）
Gerard Bricogne，全球阶段化（BUSTER）
杰夫·贝尔，薛定谔
尤金·克里斯内尔，STFC（CCP4）
尼古拉斯·索特，LBL（凤凰）
迈克·Word，OpenEye
剑桥大学Rasmus Fogh（CCP4）
约翰·爱奥尼德斯，WeNMR

会议

该工作组最初成立于2011年，旨在使PDBx/mmCIF格式文件能够在主要的大分子晶体学软件工具中直接使用，并就向PDB沉积大型结构所需的格式扩展提供建议(2013年5月宣布).

在2011年9月于PDBe举行的一次会议上，wwPDB会见了关键软件开发人员，讨论了PDB文件格式在支持大型结构、复杂化学以及新的和混合实验方法的数据方面的局限性。

开发商之间的共识是积极转换为PDBx/mmCIF格式，而不是设计一种全新的格式，特别是用于沉积。会议成果是成立了这个工作组，以采用PDBx/mmCIF格式进行沉积，并作为高分子晶体学程序之间的交换格式。

此外，还在PDBe和Rutgers举办了其他会议和研讨会。

2011年研讨会参与者

顶行：萨米尔·维兰卡、保罗·亚当斯、兰迪·里德、托马斯·沃马克、约翰·韦斯特布鲁克、杰拉德·克莱维特、尤金·克里斯内尔
中排：约翰·爱奥尼德斯（John Ionides）、加里布·穆舒多夫（Garib Murshudov）、海伦·伯曼（Helen Berman）、杰拉德·布里科尼（Gerard Bricogne）、汤姆·奥尔德菲尔德（Tom Oldfield）
最下面一行：奥利弗·斯马特（Oliver Smart）、保罗·埃姆斯利（Paul Emsley）、拉尔夫·格罗西（Ralf Grosse-Kunstleve）

出版物

PDBx/mmCIF生态系统：结构生物学的基本语义工具
约翰·韦斯特布鲁克（John D.Westbrook）、贾斯敏·杨雅斯敏（Jasmine Y.Young）、邵成华（Chenghua Shao）、冯祖康（Zukang Feng）、弗拉基米尔·古拉诺维奇（Vladimir Guranovic）、凯瑟琳·劳森（Catherine L.Lawson）、布林达·瓦拉特（Brinda Vallat）、保罗·亚当斯（Paul D.Adams）、约翰·贝里斯福德（John M.Berrisford）、杰拉德·布里科内（Gerard Bricogne）、凯·迪德里奇（Kay，斯蒂芬·K·伯雷，埃兹拉·佩萨奇(2022)分子生物学杂志434:167599个doi：2016年10月10日/j.jmb.2022.167599

宣布必须向蛋白质数据库（PDB）提交PDBx/mmCIF格式的晶体沉积文件
保罗·亚当斯（Paul D.Adams）、帕维尔·V·阿芙宁（Pavel V.Afonine）、库马兰·巴斯卡兰（Kumaran Baskaran）、海伦·M·伯曼（Helen M.Berman）、约翰·贝里斯福德（John Berrisford）、杰拉德·布里科内（Gerard Bricogne）、大卫·G·布朗（David G.Brown）、斯蒂芬·伯里（Stephen K.Burley）、陈敏宇（Minyu Chen）、冯祖康（Zukang Feng）、克劳斯·弗伦斯堡（Claus Flensburg）、阿列克桑德拉斯·古。莫里亚蒂、加里布·N·穆尔舒多夫、马丁·诺布尔、埃兹拉·佩萨奇、伊琳娜·佩西科娃、比利·K·彭、奥列格·索波列夫、埃尔登·乌尔里奇、萨米尔·维兰卡、克莱门斯·冯海因、约翰·韦斯特布鲁克、马金·沃迪尔、马沙西·约科奇吉、贾斯敏·杨(2019)《水晶学报》。D75，451-454。数字对象标识：10.1107/S2059798319004522