混合/集成方法工作队

wwPDB成立了一个wwPDB混合方法工作组,由为这些混合研究做出贡献的各个实验领域的专家、混合建模专家和归档专家组成。第一次会议于2014年10月6日至7日在EMBL-EBI(Hinxton,UK)举行,讨论混合方法确定的归档模型中涉及的许多问题。

本次会议的白皮书已经出版:第一届世界野生动植物保护局混合/综合方法工作组成果车间结构23:1156-1167数字对象标识代码:2016年10月10日/j.str.2015.05.013.

工作队建议目前搁置的一体化结构等待政策决定(状态代码POLC)。

I/HM沉积

向PDB-Dev存放I/HM结构

PDB-Dev:用于存放一体化/混合结构模型的原型系统。结构25:1317-1318数字对象标识代码:2016年10月10日/j.str.2017.08.001

2019年研讨会

2019年,作为生物物理学会(BPS)卫星会议,举办了一次研讨会,以评估工作队建议的实施进度,并讨论整合结构存档的进一步要求。研讨会的主要目标是建立共识,以应对创建通用数据标准、构建联邦数据交换方法以及开发验证一体化结构的机制等方面的挑战。参加研讨会的有各种实验方法的专家、综合建模师和wwPDB成员。

研讨会总结和提出的建议已发表在白皮书中:结构27:1745-1759 doi:2016年10月10日/j.str.2019.11.002

2014年研讨会参与者:

保罗·亚当斯(劳伦斯·伯克利国家实验室)、亚历山大·博文(乌得勒支大学)、瓦赫·邱(贝勒)、马蒂奥·达尔·佩拉罗(洛桑理工学院)、弗兰克·迪·马约(华盛顿大学)、汤姆·费林(加利福尼亚大学旧金山分校)、凯·格里纽瓦尔德(牛津大学),理查德·亨德森(MRC分子生物学实验室)、格哈德·悍马(马克斯·普朗克生物物理研究所)、岩崎健(大阪大学)、格雷厄姆·约翰逊(加州大学旧金山分校)、马克·马蒂·雷诺姆(基因组调控中心)、延斯·梅勒(范德比尔特大学)、盖·蒙蒂利奥内(罗格斯大学)、,Michael Nilges(巴斯德研究所)、Ruth Nussinov(特拉维夫大学)、Juri Rappsilber(爱丁堡大学)、Randy Read(剑桥大学)、Helen Saibil(伦敦大学)、Andrej Sali(加州大学旧金山分校)、Gunnar Schröder(Forschungszentrum Jülich)、Torsten Schwede(巴塞尔大学)、,Charles Schwieters(国家卫生研究所)、Claus Seidel(海因里希-海因大学)、Dimtri Svergun(汉堡EMBL)、Maya Topf(伦敦伯克贝克大学)、Jill Trewella(悉尼大学)
wwPDB和EMDataBank代表:Helen Berman(RCSB PDB)、Stephen Burley(RCSB-PDB)、Aleksandras Gutmanas(PDBe)、Gerard Kleywegt(PDBe)、Cathy Lawson(RCSB-PDB)、John Markley(BMRB)、Haruki Nakamura(PDBj)、Ardan Patwardhan

混合方法工作组

2019年研讨会参与者

保罗·亚当斯(Paul D.Adams)、海伦·M·伯曼(Helen M.Berman)、亚历山大·邦文(Alexandre A.Bonvin)、斯蒂芬·伯雷(Stephen K.Burley)、布里吉特·卡拉格(Bridget Carragher)、华秋(Wah Chiu)、弗兰克·迪迈奥(Frank DiMaio)、托马斯·E·费林(Thomas E.Ferrin)、玛格丽特·加巴尼(Margaret J.Gabanyi)、托马斯·戈达德(Thomas-D.Goddard)、帕特里克,盖塔诺·蒙特利奥内(Gaetano T.Montelione)、小乔治·菲利普斯(George N.Phillips,Jr.)、托马斯·普里斯纳(Thomas Prisner)、尤里·拉普西尔伯(Juri Rappsilber)、安德烈·萨利(Andrej Sali)、大卫·施里默(David C.Schriemer)、特尔斯滕·施维德(Torsten Schwede)、克劳斯·塞德尔(Claus A.M.Seidel)、蒂莫西·斯特伦伯格(Timothy S.Strutzenberg)、德米特里·斯