阀杆 swMATH ID: 30034 软件作者： 恩斯特，J。；Bar-Joseph，Z。 描述： 短时间序列Expression Miner（STEM）。Short Time-series Expression Miner（STEM）是一个Java程序，用于聚类、比较和可视化来自微阵列实验（8个或更少的时间点）的短时间序列基因表达数据。STEM允许研究人员确定重要的时间表达谱和与这些谱相关的基因，并比较这些基因在多种条件下的行为。STEM与基因本体（GO）数据库完全集成，支持对具有相同时间表达模式的基因集进行GO类别基因富集分析。STEM还支持轻松确定和可视化属于给定GO类别或用户定义基因集的基因的行为，确定这些基因的丰富时间表达谱。（注：虽然STEM主要用于分析短时间过程实验的数据，但它可以用于分析任何小组实验的数据。这些实验可以自然地按顺序排序，包括剂量反应实验。） 主页： http://www.cs.cmu.edu/~杰恩斯特/斯特姆/ 源代码： https://github.com/jernst98/STEM_DREM网址 依赖项： Java语言 相关软件： EDGE（边缘）;maSigPro软件;起源;剪影;GOALIE公司;美食家;GOstat公司 引用于： 3文件 全部的 前5名13位作者引用 1 马可·安东尼奥蒂 1 Martijn P.F.伯杰。 1 马可·卡雷拉斯 1 奥古斯托·谢弗 1 阿琳·苏扎·德·保拉 1 安东尼拉·法里纳西奥 1 吉安卡洛·莫里 1 丹尼尔·梅里科 1 利马瓦莱里亚帕索斯 1 佩雷拉，蒂亚戈·雷特 1 马塞洛·阿莫林·萨维 1 Tan，Frans E.S。 1 意大利佐皮斯 3篇连载文章中引用 1 计算机与运筹学 1 应用数学建模 1 计算统计与数据分析 在4个字段中引用 三 生物学和其他自然科学（92-XX） 2 统计学（62-XX） 1 常微分方程（34-XX） 1 计算机科学（68至XX） 按年份列出的引文