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TEXshade公司

swMATH ID: 21125
软件作者: E.贝茨
描述: TEXshade:使用LATEX2ε对多序列比对进行着色和标记。动机:使用标准文字处理或图形软件对核苷酸和肽序列进行排版、着色和标记非常耗时。可用的自动序列着色程序通常不允许手动应用其他着色或标签。因此,使用科学排版软件LATEX2 epsilon的宏语言,为计算阴影和手动阴影设计了一个灵活的对齐阴影包。结果:TEXshade是第一个基于TEX的对齐阴影软件,除了标准身份和相似阴影外,还具有显示电荷、亲水性或溶剂可及性等功能方面的特殊模式。实现了大量用于手动着色、图形标签、重新排列序列顺序、编号、图例等的命令。此外,TEXshade允许以DSSP、STRIDE和PHD格式包含和显示二级结构预测。可用性:自http://homepages.uni-tuebingen.de/beitz/tse.html(宏包和在线文档)联系人:eric.beitz@uni-tuebingen.de
主页: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/10842735
相关软件: r串联;政府.db;反应.db;反应途径;角色;hpar(高气压);卢比;组织MassSpecR;IPPD公司;突触器;MALDIquant公司;XML格式;M数据库;目标搜索;兆赫;针织物;生物导体;蛋白质组学研究;R(右)
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