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WIGGLE公司

swMATH ID: 2594
软件作者： Lee，Sang-Ho；金·帕尔莫（Kim Palmo）；塞缪尔·克里姆
描述： WIGGLE：一种新的笛卡尔坐标系下的约束分子动力学算法。基于投影算子方法重新检验了传统约束分子动力学（MD）模拟理论。提出了一种新的算法WIGGLE，用于具有内部约束的MD仿真。在每个时间步长，该算法利用从速度调整中导出的约束加速度来满足隐藏的约束，并提供初始和最终约束值，这些值几乎比RATTLE更接近期望值一个数量级。它的性能与RATTLE和SHAKE的辛烷分子性能进行了比较。还提出了附加约束质心角动量的形式，以及每个积分时间步长内局部能量漂移的表达式。
主页： http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0021999105002056
关键词： 计算机模拟;分子动力学;约束动力学;数值积分;算法：WIGGLE;格格作响;SHAKE（震动）
相关软件： 车灯;CUDA公司;博尔西格语;FEAPpv公司;设置;LINCS系统
引用于： 10文件

标准条款

1出版物描述软件，包括1出版物以zbMATH为单位 年份
WIGGLE：一种新的笛卡尔坐标系下的约束分子动力学算法。 Zbl 1114.92080号
李桑浩;金·帕尔莫;塞缪尔·克里姆
2005
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25位作者引用

1 马库斯·贝克尔（Markus M.Becker）。
1 刘易斯·菲利普·鲍文
1 杰森·达纳
1 Jennifer M.Davoren。
1 佩德罗·贡内特
1 Petros D.库穆塔科斯。
1 塞缪尔·克里姆
1 Kuang、Jason Xi
1 李桑浩
1 费利克斯·林德纳
1 Loffhagen，D.罗夫哈根。
1 罗素·里昂
1 尼科尔·马海内克
1 尼玛·努里
1 金·帕尔莫
1 查尔斯·拉丁
1 霍尔格·斯特罗特
1 唐华中
1 亚历山大·维贝
1 Jens HonoréWalther
1 罗伯托·韦伯（Roberto A.Weber）。
1 雷蒙·韦格纳
1 彼得·温克勒（Peter M.Winkler）。
1 Stephen M.Zemyan。
1 赛义德·齐亚伊·拉德
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7篇连载文章中引用

2 计算机物理通信
2 计算物理杂志
1 计算力学
1 SIAM数学分析杂志
1 经济理论
1 随机与动力学
1 复变量与椭圆方程
全部的 前5名

13个领域引用

2 可变形固体力学（74-XX）
2 流体力学（76-XX）
2 统计力学，物质结构（82-XX）
1 复变量的函数（30年XX月）
1 凸和离散几何（52至XX）
1 一般拓扑结构（54至XX）
1 整体分析，流形分析（58至XX）
1 概率论与随机过程（60-XX）
1 数值分析（65-XX）
1 量子理论（81-XX）
1 博弈论、经济学、金融和其他社会和行为科学（91-XX）
1 生物学和其他自然科学（92-XX）
1 系统论；控制（93至XX）

按年份列出的引文