LINCS系统 swMATH ID: 8880 软件作者: 赫斯,B。;Bekker,H。;Berendsen,H.J.C。;Fraaije,J.G.E.M 描述: LINCS:用于分子模拟的线性约束求解器。在本章中,我们提出了一种新的LINear约束求解器(LINCS),用于具有键约束的分子模拟。该算法本质上是稳定的,因为约束本身被重置,而不是约束的导数,从而消除了漂移。尽管该算法的推导是以矩阵的形式给出的,但不需要矩阵矩阵乘法,只需存储非零矩阵元素,因此该方法适用于非常大的分子。在相同的精度下,LINCS算法比SHAKE算法快3到4倍。算法的并行化很简单。 主页: 网址:http://www.cs.rug.nl/~bekker/publications/lincs.pdf 相关软件: 格鲁马克斯;设置;供应商管理部;PROCHECK检查;P-LINCS公司;查姆;Q-SiteFinder;PyMOL公司;AutoDock葡萄酒;瑞士模式;I-TASSER公司;GROMOS公司;NAMD公司;MMM2D(毫米2日);名称2;ESPResSo公司;FFTW公司;Matlab公司;DL_政策;倍频程 引用于: 22文件 全部的 前5名71位作者引用 2 内森·贝克(Nathan A.Baker)。 2 雷,欢 1 埃琳娜·阿赫马茨卡亚 1 拉夫·巴尼什 1 约格·巴兹 1 Herman J.C.Berendsen。 1 卜、兵 1 亚历山大·布约泽克 1 A.J.Palace卡瓦略 1 陈开贤 1 爱德华多·克鲁。 1 马修·德斯布伦 1 刁嘉杰 1 布鲁诺·埃斯克里巴诺 1 康斯坦丁·法克尔迪 1 范晓军 1 陈刚 1 高华坚 1 高培元 1 佩德罗·贡内特 1 弗朗西丝卡·格罗根 1 卡斯滕·哈特曼 1 尤瑟夫·海德 1 卡洛斯·阿尔贝托·埃尔南德斯·帕迪拉 1 曼纽尔·霍普·赫施勒 1 维拉什里·贾姆达尔 1 纪宝华 1 蒋华良 1 孔勇 1 塞缪尔·克里姆 1 斯威塔·库马里 1 李桑浩 1 本尼迪克特·雷姆库勒。 1 李德昌 1 李静 1 李仙桃 1 刘斌 1 路易斯·M·s·卢拉。 1 陆兰源 1 露露,萨吉莎 1 玛哈帕特拉,Rajani Kanta 1 伯恩德·马克特 1 马丁斯做粤语,A.M.T。 1 查尔斯·马修斯。 1 多米尼克·卢德维格·米歇尔斯 1 阿鲁穆加姆Mohana Priya 1 Mok,Puah Chum村 1 米尔西摩尔 1 乔恩·穆吉卡。 1 乌尔里希·尼肯 1 金·帕尔莫 1 Sandeep P.帕蒂尔。 1 J.P.Prates Ramalho 1 Route、Subhashree 1 沈左伟 1 索纳利·辛德 1 谢尔扎·辛格 1 斯汀斯、帕纳吉奥蒂斯 1 穆罕默德·托奎尔 1 都都童 1 王继增 1 马库斯·韦伯 1 薛、徐 1 杨建斌 1 Makoto Yoneya 1 王永军 1 李志宏 1 朱冠华 1 朱伟良 1 邹汉军 1 左志立 全部的 前5名10篇连载文章中引用 7 计算物理杂志 4 理论生物学杂志 2 应用力学与工程中的计算机方法 1 计算机和流体 1 中欧数学杂志 1 计算生物学和化学 1 跨学科应用数学 1 力学学报 1 医学中的计算与数学方法 1 数学控制及相关领域 全部的 前5名16个领域引用 9 生物学和其他自然科学(92-XX) 7 统计力学,物质结构(82-XX) 6 数值分析(65-XX) 三 概率论与随机过程(60-XX) 三 流体力学(76-XX) 三 量子理论(81-XX) 2 计算机科学(68至XX) 1 总体主题;集合(00-XX) 1 动力系统和遍历理论(37至XX) 1 变分法与最优控制;最优化(49至XX) 1 统计学(62-XX) 1 可变形固体力学(74-XX) 1 光学、电磁理论(78-XX) 1 经典热力学,传热(80-XX) 1 运筹学、数学规划(90-XX) 1 系统论;控制(93至XX) 按年份列出的引文