林肯

LINCS:用于分子模拟的线性约束求解器。在这一章中,我们提出了一个新的线性约束求解器(LINCS),用于带键约束的分子模拟。该算法本质上是稳定的,因为约束本身是重置的,而不是约束的导数,从而消除了漂移。虽然该算法的推导是以矩阵的形式提出的,但不需要矩阵矩阵乘法,只需存储非零矩阵元素,因此该方法适用于非常大的分子。在相同的精度下,LINCS算法比SHAKE算法快3到4倍。算法的并行化很简单。


zbMATH参考文献(参考 25篇文章 引用)

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