下载PubMed数据
上次更新时间:2023年12月20日
PubMed包含多个NLM文献资源中生物医学文献的引用和摘要,其中包括PubMed数据库最大的组成部分MEDLINE。
PubMed数据可通过我们的FTP服务器和E-utilities API获得。关于这个第页,学习如何访问、使用PubMed数据并随时了解这些数据。
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通过FTP获取PubMed数据
注意:从FTP服务器下载数据时必须使用二进制模式。
NLM每年以XML格式生成一组PubMed引用记录基线下载;基线文件是PubMed数据的完整快照。使用时此数据位于本地数据库中,最佳实践是覆盖本地数据每年使用基线数据。
NLM每天都会生成更新文件,其中包括新的、修订的和删除的引文。如果要将这些更新XML文件合并到本地数据库中,首先加载基线文件,然后按数字顺序加载每日更新文件。修订或删除的引文应替换您当地现有的引文数据库。同一天可能会有多个更新文件可用。
通过API获取PubMed数据
这些教育资源帮助用户探索强大而灵活的访问NLM数据,重点是通过电子工具访问PubMed数据应用程序编程接口。
Entrez Programming Utilities(E-Utilities)由八个服务器端程序组成为NCBI的Entrez查询和数据库系统提供了稳定的接口。电子实用程序帮助包括:
使用PubMed数据
请参阅基线和README.txt中的条款和条件更新文件。从我们的FTP服务器下载数据表明您接受这些条款和条件。
PubMed数据符合当前公共医学DTD.DTD文档为所有元素和PubMed DTD中定义的属性。
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MEDLINE/PubMed数据元素(字段)描述
关于MEDLINE和PubMed:资源指南
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