此表显示了NCBI中跨变体资源使用的类似-非相同标记。
数据库SNP |
数据库变量 |
说明 |
CLNORIGIN公司 |
原产地 |
描述变异等位基因起源的字符串。
dbSNP中可以指定以下一个或多个值:0未知;生殖系1株;2体细胞;4继承;8父系;16名产妇;32从头开始;64个双亲;128单亲;256个未测试;512次测试未得出结论;1073741824其他。dbVar还有其他ORIGIN值,这些值不在CLNORIGIN中。
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无线电 |
呼叫ID |
变量标识符。dbVar访问RefSNP和dbVar接入区域和调用。 |
SAO公司 |
原产地 |
指示变异等位基因起源的整数。此标记的可接受值为:0-未指定,1-生殖系,2-体细胞,3-两者。 注释 :“SAO”是“SNP Allele Origin”。我们将“SNP”改为更具包容性的术语“变体”;标签“SAO”保留在vcf文件中。 |
SOMATIC公司 |
原产地 |
在dbVar中,SOMATIC以及SAO中的一些值可以在ORIGIN中找到。 |
风险资本 |
服务器类型 |
描述变体的变体类别,包括SNP、DIP、INDEL、STR、MNP等。
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