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树状图搜索教程

本教程将教您如何编辑树标签。

搜索界面

搜索元素位于工具栏上。

它有查找按钮，搜索词组合框，以及缩放到所有搜索结果复选框。

电视搜索工具栏高亮显示

搜索元素

“查找”按钮

如果选中相应元素（“全部缩放”复选框），则使用“搜索词组合”框中显示的搜索词启动搜索，并可以选择缩放到搜索结果。

搜索词组合框

允许用户键入新的搜索词或从“最新使用情况”列表（MRU）中进行选择。MRU列表包含最近对树/会话组合的查询。按下enter键时，搜索将使用显示的搜索词和“缩放到全部”选项开始。

缩放到所有搜索结果复选框

如果选中，则在执行搜索时，可以调整缩放级别以确保显示所有结果。在执行搜索之前，检查/取消检查无效。

子字符串搜索

  1. 去https://www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/treeview/tv.html？appname=ncbi_tviewer&url=ftp://ftp.ncbi.nlm.nih-gov/toolbox/gbench/samples/treeviewer/tree.txt.asn&renderer=circular&featnames=*&setmidpointroot=true&treename=tree_txt.asn.
     
  2. 类型蒙得维的亚在搜索框中，然后单击输入
     
  3. 观察搜索结果作为树上的选择：

    电视子串搜索选择
     

  4. 请注意，子字符串搜索在所有树节点属性字符串中查找术语（显示在tootips中）。

    电视工具提示字符串
     

  5. 请注意，子字符串搜索不区分大小写/引号/空格。“蒙得维的亚”、蒙得维迪亚、蒙得维迪奥和“蒙得维迪奥”将得出相同的结果，以及血清型蒙得维迪亚或“血清型蒙得维迪奥”。

标签搜索

子字符串搜索将搜索标签，包括自定义标签。

  1. 去https://test.ncbi.nlm.nih.gov/projects/treeview/tv.html？appname=ncbi_tviewer&url=ftp://ftp.ncbi.nih.gov/toolbool/gbench/samples/treeviewer/carbohydro_kinase_FGGY_midpoint.asn&renderer=rect&sort=distance&featnames=*&树名=碳水化合物激酶_FGGY_midpoint.asn

  2. 类型2.7.1.3在搜索框中，然后点击查找按钮
     
  3. 将搜索结果作为树的选择：

    电视标签搜索

缩放到所选内容

搜索完成后，Tree Viewer会在状态栏（底部）中显示搜索统计信息。选定节点的数量反映搜索结果。树状图查看器可以使用快速缩放到选定的集合缩放到所选内容工具栏按钮或上下文菜单项。

注：缩放到所选内容始终显示所有选定的节点/叶，因此对于具有多个选择的大树，缩放到选择可能没有效果，因为所有选定节点/叶只能以0%的缩放比例显示。

电视缩放到选择

查询搜索

Tree Viewer还支持将逻辑表达式作为搜索字符串的查询。

距离>0.1

选择“dist”属性大于0.1的所有节点

电视查询1

dist>0.1 AND asm_level_txt=续

选择dist属性大于0.1且功能为asm_level_txt且值等于Contig的所有节点。

电视查询2

dist>0.0005和scientific_name类似于“*Montevideo*”

搜索dist大于0.0005且scientific_name包含字符串“Montevideo”的节点（通配符表达式搜索）。

电视查询3

基于查询的搜索规则和语法

  • 字符串、数字和布尔值（例如5、0.2、true、“contig”）
  • 节点属性（如scientific_name、dist、asm_accession、assembly_method等）
  • 简单比较：<，<=，>，>=，==
  • 允许通配符的“Like”比较：scientific_name Like*Montevideo*
  • “Between”比较：0.0004和0.01之间的距离
  • “In”比较：asm_accession In（GCF_000231645.1，GCA_000495295.1）
  • 逻辑运算符：AND、OR、XOR、NOT

有关更多信息，请参阅：

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上次更新时间：2017-03-10T15:53:01-05:00