.2024年4月4日；84（7）：1271-1289.e12。
doi:10.1016/j.molcel.2024.01.026。
Epub 2024年2月21日。
变性纯化表明，PRC2和其他广泛报道的染色质蛋白在体内似乎不与RNA直接结合
吉米·郭 1, 马里奥·R·布兰科 2, 第四区G Walkup 三, 格兰特·博内斯特尔 三, 卡尔·R·乌尔维纳蒂 4, 阿比克·巴纳吉 1, 周婉仪 三, 奥利维娅·埃特林 三, 麦肯齐·斯特雷尔 三, 帕勒姆·佩达 三, 恩里克·阿马亚 三, 维克·特林 三, 米切尔·古特曼 5
附属公司
附属公司
- 1美国加州帕萨迪纳加州理工学院生物与生物工程部，邮编：91125；美国加利福尼亚州洛杉矶市南加州大学凯克医学院，邮编：90089。
- 2美国加州帕萨迪纳加州理工学院生物与生物工程部，邮编：91125。电子地址：mblanco@lncrna.caltech.edu。
- 三美国加州帕萨迪纳加州理工学院生物与生物工程部，邮编：91125。
- 4美国加州帕萨迪纳加州理工学院生物与生物工程部，邮编：91125；Loyola Marymount大学生物系，洛杉矶，加利福尼亚州90045，美国。
- 5美国加州帕萨迪纳加州理工学院生物与生物工程部，邮编：91125。电子地址：mguttman@caltech.edu。
剪贴板中的项目
变性纯化表明，PRC2和其他广泛报道的染色质蛋白在体内似乎不与RNA直接结合
吉米·郭等。
摩尔细胞.
.
.2024年4月4日；84（7）：1271-1289.e12。
doi:10.1016/j.molcel.2024.01.026。
Epub 2024年2月21日。
作者
吉米·郭 1, 马里奥·R·布兰科 2, 第四区G Walkup 三, 格兰特·博内斯特尔 三, 卡尔·R·乌尔维纳蒂 4, 阿比克·巴纳吉 1, 周婉仪 三, 奥利维娅·埃特林 三, 麦肯齐·斯特雷尔 三, 帕勒姆·佩达 三, 恩里克·阿马亚 三, 维克·特林 三, 米切尔·古特曼 5
附属公司
- 1美国加利福尼亚州帕萨迪纳市加利福尼亚理工学院生物与生物工程系91125；美国加利福尼亚州洛杉矶市南加州大学凯克医学院，邮编：90089。
- 2美国加州帕萨迪纳加州理工学院生物与生物工程部，邮编：91125。电子地址：mblanco@lncrna.caltech.edu。
- 三美国加州帕萨迪纳加州理工学院生物与生物工程部，邮编：91125。
- 4美国加州帕萨迪纳加州理工学院生物与生物工程部，邮编：91125；Loyola Marymount大学生物系，洛杉矶，加利福尼亚州90045，美国。
- 5美国加州帕萨迪纳加州理工学院生物与生物工程部，邮编：91125。电子地址：mguttman@caltech.edu。
剪贴板中的项目
摘要
据报道，多梳抑制复合物2（PRC2）与许多RNA结合，并已成为非编码RNA（lncRNAs）调节基因表达时间长短的报告中的中心参与者。然而，支持特定lncRNA-PRC2相互作用的生物化学证据与证明PRC2对于lncRNA功能通常是可有可无的功能证据之间的差异越来越大。在这里，我们回顾了支持PRC2与RNA结合的证据，并表明许多报道的相互作用可能不会在体内发生。通过对人和小鼠细胞系中体内交联RNA-蛋白复合物的变性纯化，我们观察到，尽管准确绘制了其他细胞（SPEN、TET2和其他）之间真实的RNA-结合位点，但与PRC2和之前报道的结合RNA的染色质相关蛋白（CTCF、YY1等）的可检测RNA结合缺失。综上所述，这些结果为重新评估RNA结合在协调各种染色质调节机制中的广泛作用提供了重要依据。
关键词：削减；PRC2；RNA；RNA结合蛋白；染色质。
版权所有©2024 Elsevier Inc.保留所有权利。
PubMed免责声明
利益冲突声明
利益声明M.R.B.、W.G.W.和M.G.是CLAP方法专利的发明人。
类似文章
-
JARID2和非编码RNA之间的相互作用调节PRC2向染色质的募集。
Kaneko S、Bonasio R、Saldaña-Meyer R、Yoshida T、Son J、Nishino K、Umezawa a、Reinberg D。
Kaneko S等人。
分子细胞。2014年1月23日；53(2):290-300. doi:10.1016/j.molcel.2013.11.012。Epub 2013年12月26日。
分子细胞。2014
PMID：24374312
免费PMC文章。
-
长非编码RNA类固醇受体RNA激活剂（SRA）与TrxG和PRC2复合物的关联。
Wongtrakoongate P、Riddick G、Fucharoen S、Felsenfeld G。
Wongtrakoongate P等人。
公共科学图书馆-遗传学。2015年10月23日；11（10）：e1005615。doi:10.1371/journal.pgen.1005615。eCollection 2015年10月。
公共科学图书馆-遗传学。2015
PMID：26496121
免费PMC文章。
-
PRC2组分EZH2和SUZ12的隐秘RNA-结合。
Betancur JG，Tomari Y。
Betancur JG等人。
RNA生物学。2015;12(9):959-65. doi:10.1080/15476286.2015.1069463。
RNA生物学。2015
PMID：26177152
免费PMC文章。
-
长非编码RNA对多梳抑制复合物的控制。
Trotman JB、Braceros KCA、Cherney RE、Murvin MM、Calabrese JM。
Trotman JB等人。
Wiley Interdiscip Rev RNA.2021年11月；12（6）：e1657。doi:10.1002/wrna.1657。Epub 2021年4月16日。
Wiley Interdiscip-RNA.2021。
PMID：33861025
免费PMC文章。
审查。
-
长非编码RNA对染色质修饰物的补充：来自PRC2的教训。
Davidovich C，切赫TR。
Davidovich C等人。
RNA。2015年12月；21(12):2007-22. doi:10.1261/rna.053918.115。
RNA。2015
PMID：26574518
免费PMC文章。
审查。
引用人
-
神经RNA处理：转录调控和RNA结合蛋白之间的相互作用。
Ozbulut HC，Hilgers V。
Ozbulut HC等人。
前摩尔神经科学。2024年8月1日；17:1426410. doi:10.3389/fnmol.2024.1426410。eCollection 2024年。
前摩尔神经科学。2024
PMID：39149613
免费PMC文章。
审查。
-
H3K27me3介导的表观遗传调控在多能性维持和谱系分化中的作用。
江L，黄L，江W。
Jiang L等人。
细胞洞察力。2024年6月27日；3(4):100180. doi:10.1016/j.cellin.2024.100180。eCollection 2024年8月。
细胞洞察力。2024
PMID：39072246
免费PMC文章。
审查。
-
R-环和G-四链体在DNA修复、转录和基因组组织中的相互缠绕作用。
Wulfridge P，Sarma K。
Wulfridge P等人。
自然细胞生物学。2024年7月；26(7):1025-1036. doi:10.1038/s41556-024-01437-4。Epub 2024年6月24日。
自然细胞生物学。2024
PMID：38914786
审查。
-
转录因子ERα和Sox2具有不同的多相DNA和RNA结合机制。
Hemphill WO、Steiner HR、Kominsky JR、Wuttke DS、Cech TR。
Hemphill WO等人。
RNA。2024年7月16日；30(8):1089-1105. doi:10.1261/rna.080027.124。
RNA。2024
PMID：38760076
免费PMC文章。
-
LncRNAs、核结构和免疫反应。
Montano C、Flores-Arenas C、Carpenter S。
Montano C等人。
核心。2024年12月；15(1):2350182. doi:10.1080/19491034.2024.2350182。Epub 2024年5月13日。
核心。2024
PMID：38738760
免费PMC文章。
审查。
工具书类
-
- Kwon SC、Yi H、Eichelbaum K、Fohr S、Fischer B、You KT、Castello A、Krijgsveld J、Hentze MW和Kim VN（2013年）。胚胎干细胞的RNA结合蛋白库。Nat Struct Mol Biol国家结构分子生物学20，1122-1130。10.1038/nsmb.2638。-DOI程序-公共医学
-
- Castello A、Fischer B、Eichelbaum K、Horos R、Beckmann BM、Strein C、Davey NE、Humphreys DT、Preiss T、Steinmetz LM等人（2012年）。从哺乳动物mRNA-结合蛋白质图集了解RNA生物学。手机1491393-1406。2016年10月10日/j.cell.2012.04.031。-DOI程序-公共医学
-
- Castello A、Hentze MW和Preiss T（2015）。代谢酶作为RNA-结合蛋白质享受新的伙伴关系。内分泌与代谢趋势26，746–757。2016年10月10日/j.tem.2015.09.012。-DOI程序-项目管理咨询公司-公共医学
-
- He C、Sidoli S、Warneford-Thomson R、Tatomer DC、Wilusz JE、Garcia BA和Bonasio R（2016年）。胚胎干细胞核蛋白组中RNA结合区的高分辨率定位。分子细胞64，416–430。2016年10月10日/j.molcel.2016.09.034。-DOI程序-项目管理咨询公司-公共医学
-
- Davidovich C、Zheng L、Goodrich KJ和Cech TR（2013）。Polycomb抑制复合物2的混杂RNA结合。Nat Struct Mol Biol国家结构分子生物学20，1250-1257。10.1038/nsmb.2679。-DOI程序-项目管理咨询公司-公共医学
引用
