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.2020年7月16日;79(2):251-267.e6。
doi:10.1016/j.molcel.2020.05.013。 Epub 2020年6月5日。

长RNA核输出对NXF1和TREX复合物选择性依赖的基因结构和序列组成

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长RNA核输出对NXF1和TREX复合物选择性依赖的基因结构和序列组成

宾亚明·扎克曼等。 分子电池. .
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摘要

核RNA输出途径的核心成分被认为是几乎所有聚腺苷酸RNA输出所必需的。在这里,我们耗尽了在人类细胞核输出中起作用的不同蛋白质,并量化了转录组对RNA定位的影响。不同的基因表现出不同的敏感性,NXF1和TREX组分的缺失导致一些转录物强烈保留在细胞核中,而其他转录物则不受影响。具体而言,NXF1优先用于出口具有长外显子或高A/U含量的单或少外显子转录本,而TREX复合成分的缺失优先影响剪接和富含G/C的转录本。通过大规模平行报告分析,我们确定了使转录物依赖NXF1进行输出的短序列元素,并确定了剪接和NXF1的协同效应。这些结果修正了目前关于核输出如何影响人类细胞内RNA分布的模型。

关键词:NXF1;RNA定位;蝶呤;长非编码RNA;核出口;转录后调控;拼接。

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