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.2018年1月4日;46(D1):D8-D13。
doi:10.1093/nar/gkx1095。

国家生物技术信息中心的数据库资源

合作者

国家生物技术信息中心的数据库资源

NCBI资源协调员. 核酸研究. .

摘要

国家生物技术信息中心(NCBI)为生物信息和数据提供了一整套在线资源,包括GenBank®核酸序列数据库和PubMed生命科学期刊引文和摘要数据库。Entrez系统为39个不同数据库中的大多数数据提供搜索和检索操作。电子实用程序用作Entrez系统的编程接口。扩展许多Web应用程序是BLAST程序的自定义实现,该程序经过优化以搜索专门的数据集。去年发布的新资源包括PubMed Data Management、RefSeq Functional Elements、基因组数据下载、变异服务API、Magic-BLAST、QuickBLASTp和Identical Protein Groups。去年更新的资源包括基因组数据查看器、人类基因组资源页面、基因、病毒变异、OSIRIS和PubChem。所有这些资源都可以通过NCBI主页www.NCBI.nlm.nih.gov访问。

PubMed免责声明

数字

图1。
图1。
选定入口链接的图形描述。矩阵中的每个单元格都会根据源数据库(行)中与目标数据库(列)有Entrez链接的记录数的日志(以10为基数)进行着色。对角单元格表示计算链接(例如公开相关文章),非对角单元格表示生物关系(例如核与分类学)。矩阵不是对角的,因为源数据库中的单个记录可能与目的数据库有许多链接(例如基因组到蛋白质)。
图2。
图2。
基因完整报告中显示的人类TRIM15(基因ID 89870)的表达谱数据(网址:www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/88970).

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引用人

工具书类

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