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.2017年1月4日;45(D1):D945-D954。
doi:10.1093/nar/gkw1074。 Epub 2016年11月28日。

2017年ChEMBL数据库

附属公司

2017年ChEMBL数据库

安娜·高尔顿等。 核酸研究. .

摘要

ChEMBL是一个开放的大规模生物活性数据库(https://www.ebi.ac.uk/chembl)之前在2012年和2014年核酸研究数据库问题中进行了描述。自那时以来,除了继续从药物化学文献中提取数据外,还向数据库中添加了新的生物活性数据来源。这些包括:来自被忽视疾病筛查的存储数据集;作物保护数据;来自专利的药物代谢和处置数据以及生物活性数据。还集成了一些改进和新功能。这些包括使用本体对分析和靶点进行注释,包括临床候选靶点和适应症,添加药物代谢途径和计算结构警报。可以通过网络接口、RDF分发、数据下载和RESTful网络服务访问ChEMBL数据。

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数字

图1。
图1。
可以通过结合BioAssay本体、蛋白质家族和GO分类来执行更复杂查询的示例(例如,使用web服务)。
图2。
图2。
特罗格列酮复方报告卡,显示作用机制、适应症和停药信息(https://www.ebi.ac.uk/chembl/compound/inspect/CHEMBL408).
图3。
图3。
辛伐他汀代谢方案(https://www.ebi.ac.uk/chembl/compound/ininspect/CHEMBL1064(网址:https://www.ebi.ac.uk/chembl/compound/ininspect/CHEMBL1064)).

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引用人

工具书类

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    1. Gaulton A.、Bellis L.J.、Bento A.P.、Chambers J.、Davies M.、Hersey A.、Light Y.、McGlinchey S.、Michalovich D.、Al-Lazikani B.等。ChEMBL:用于药物发现的大规模生物活性数据库。《核酸研究》2012;40:D1100–D1107。-项目管理咨询公司-公共医学
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