.2016年1月4日;44(D1):D646-53。
doi:10.1093/nar/gkv1227。
Epub 2015年11月17日。
用于比较假单胞菌基因组数据库中数千个假单胞杆菌基因组的增强注释和特征
附属公司
附属公司
- 1加拿大BC V5A 1S6大温哥华西蒙弗雷泽大学分子生物学和生物化学系gwinsor@sfu.ca。
- 2加拿大BC V5A 1S6大温哥华西蒙·弗雷泽大学分子生物学和生物化学系。
- 三加拿大BC V5A 1S6大温哥华西蒙弗雷泽大学分子生物学和生物化学系brinkman@sfu.ca。
剪贴板中的项目
用于比较假单胞菌基因组数据库中数千个假单胞杆菌基因组的增强注释和特征
杰弗里·温莎等。
核酸研究.
.
.2016年1月4日;44(D1):D646-53。
doi:10.1093/nar/gkv1227。
Epub 2015年11月17日。
附属公司
- 1加拿大BC V5A 1S6大温哥华西蒙弗雷泽大学分子生物学和生物化学系gwinsor@sfu.ca。
- 2加拿大BC V5A 1S6大温哥华西蒙·弗雷泽大学分子生物学和生物化学系。
- 三加拿大BC V5A 1S6大温哥华西蒙弗雷泽大学分子生物学和生物化学系brinkman@sfu.ca。
剪贴板中的项目
摘要
假单胞菌基因组数据库(http://www.pseudomonas.com网站)众所周知,它应用基于社区的注释方法生成高质量的铜绿假单胞菌PAO1基因组注释,并促进与其他假单胞杆菌菌株的全基因组比较分析。为了帮助分析潜在的数千个完整和草图基因组集合,该数据库和分析平台进行了升级,以集成精心策划的基因组注释,并使用增强的工具分离元数据,以便进行更大规模的比较分析和可视化。人工管理的基因注释得到了改进的计算分析的补充,这些分析有助于识别假定的药物靶点和疫苗候选,或通过识别同源基因、病原体相关基因和基因组岛来帮助进化研究。数据库模式已经更新,以集成隔离元数据,这将有助于未来跨数据集进行更强大的基因组分析。我们继续强调通过定期审查科学文献和使用基于社区的方法,为基因注释提供高质量的更新,包括为基因分配高质量基因本体术语的主要新假单胞菌社区倡议。随着我们从数千个基因组中进一步扩展,我们计划提供增强功能,以帮助全基因组比较研究产生的数据可视化和分析,包括更多的泛基因组和基于人群的方法。
©作者2015。由牛津大学出版社代表核酸研究出版。
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