Genome-wide association study of triglyceride response to a high-fat meal among participants of the NHLBI Genetics of Lipid Lowering Drugs and Diet Network (GOLDN)

doi:10.1016/j.metabol.2015.07.001

.2015年10月；64(10):1359-71.

doi:10.1016/j.metabol.2015.07.001。 Epub 2015年7月3日。

NHLBI降脂药物遗传学和饮食网络（GOLDN）参与者对高脂膳食甘油三酯反应的全基因组关联研究

附属公司

¹密苏里州圣路易斯华盛顿大学医学院遗传学系。电子地址：mwojczynski@wustl.edu。
²营养和基因组实验室，Jean Mayer美国农业部人类营养研究中心老龄化部，塔夫茨大学，马萨诸塞州波士顿。
^三马里兰州巴尔的摩马里兰大学医学院医学系、流行病学系和公共卫生系的个性化和基因组医学项目。
⁴密苏里州圣路易斯华盛顿大学医学院遗传学系。
⁵儿童营养研究中心，贝勒医学院，德克萨斯州休斯顿。
⁶阿拉巴马大学伯明翰分校公共卫生学院流行病学系。
⁷阿拉巴马大学伯明翰分校公共卫生学院生物统计系统计遗传学科。
⁸马里兰州巴尔的摩马里兰大学医学院医学系、流行病学系和公共卫生系个性化和基因组医学项目；马里兰州巴尔的摩退伍军人管理医疗中心老年研究与教育临床中心。

PMID： 26256467
预防性维修识别码：项目经理4573277
内政部： 2016年10月10日/j.metabol.2015.07.001

NHLBI降脂药物和饮食遗传网络（GOLDN）参与者对高脂肪膳食的甘油三酯反应的全基因组关联研究

玛丽·K·沃伊钦斯基等。新陈代谢. 2015年10月.

.2015年10月；64(10):1359-71.

doi:10.1016/j.metabol.2015.07.001。 Epub 2015年7月3日。

附属公司

¹密苏里州圣路易斯华盛顿大学医学院遗传学系。电子地址：mwojczynski@wustl.edu。
²营养和基因组实验室，Jean Mayer美国农业部人类营养研究中心老龄化部，塔夫茨大学，马萨诸塞州波士顿。
^三马里兰州巴尔的摩马里兰大学医学院个性化和基因组医学以及医学、流行病学和公共卫生系项目。
⁴密苏里州圣路易斯华盛顿大学医学院遗传学系。
⁵德克萨斯州休斯顿贝勒医学院儿童营养研究中心。
⁶阿拉巴马大学伯明翰分校公共卫生学院流行病学系。
⁷阿拉巴马大学伯明翰分校公共卫生学院生物统计系统计遗传学科。
⁸马里兰州大学巴尔的摩医学院个性化和基因组医学以及医学、流行病学和公共卫生系项目；马里兰州巴尔的摩退伍军人管理医疗中心老年研究与教育临床中心。

PMID： 26256467
预防性维修识别码：项目经理4573277
内政部： 2016年10月10日/j.metabol.2015.07.001

摘要

目标：高脂肪膳食（餐后血脂，PPL）引起的甘油三酯（TG）反应影响心血管疾病风险，并受基因和环境的影响。参与脂质代谢的基因主导了PPL TG反应的遗传学研究。我们试图通过降脂药物和饮食网络遗传学（GOLDN）中的全基因组关联（GWA）研究来阐明常见的遗传变异。

方法：GOLDN GWAS发现样本由872名欧洲血统家族的参与者组成。根据HapMap测量或输入2543887个变体的基因型。我们在遗传和表型干预（HAPI）心脏研究（n=843）中复制了我们的顶级结果。使用随机系数回归模型，根据基线（禁食，0小时）、高脂餐后3.5和6小时测得的血浆TG构建PPL TG反应表型。必要时，在线性混合模型中使用亲属矩阵调整协变量和主成分的关联分析；此外，还进行了进一步调整空腹甘油三酯的其他模型。对GOLDN的顶级SNP进行了发现和复制研究的Meta分析（n=1715）。

结果：GOLDN发现111个提示性关联（p<1E-05），其中两个SNP符合GWA显著性水平（p<5E-08）。在两个显著的SNP中，rs964184在HAPI心脏研究中证明了复制的证据（p=1.20E-03），在联合分析中证明GWA显著（p=1.26E-09）。Rs964184与空腹脂质（TG和HDL）有关，并且接近ZPR1（以前的ZNF259），接近APOA1/C3/A4/A5簇。额外调整空腹甘油三酯后，这种相关性减弱。

结论：这是首次报道全基因组与一种新表型（即PPL-TG反应）的复制显著相关。利用通路分析或代谢组学等较新的遗传技术，有必要对反应表型进行进一步研究。

关键词：遗传学；瓜斯；餐后血脂；甘油三酯。

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利益冲突：所有作者都声明，他们没有相关的利益冲突。本出版物中提及商品名称或商业产品仅用于提供具体信息，并不意味着美国农业部的推荐或认可。美国农业部是一个机会均等的提供者和雇主。

数字

图1
分位数图TG AUC GWAS在GOLDN研究中的结果（1%等位基因频率滤波器）。

图2
GOLDN研究中与AUC PPL TG表型相关的基因型加插补SNP全基因组分析的p值分布（曼哈顿图）。两个位点达到全基因组意义。反映1×10 p值的直线上方的位置⁻⁵具有暗示意义。图表中的SNP通过了1%的等位基因频率过滤器。

图3
区域图*ZPR1号机组*（原名*ZNF259型*)复制SNP的第11号染色体上，rs964184[35]。符号键：向下三角形，*ZNF259型*; 向上三角形，*SIK3公司*; 钻石，*业务单元13*; 正方形，*APOA5公司*; 圆形，*APOA4号机组*; 十、 SNP未分配给任何基因。

图4
Rs964184基因型对平均AUC TG的特异性影响，ANOVA p值=1.98052E-05。

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[9] Teslovich TM、Musunuru K、Smith AV、Edmondson AC、Stylianou IM、Koseki M、Pirruccello JP、Ripatti S、Chasman DI、Willer CJ等。95个血脂基因座的生物学、临床和人群相关性。自然。2010年；466(7307):707–713.-项目管理咨询公司-公共医学

[10] Teslovich TM、Musunuru K、Smith AV、Edmondson AC、Stylianou IM、Koseki M、Pirruccello JP、Ripatti S、Chasman DI、Willer CJ等。95个血脂基因座的生物学、临床和人群相关性。自然。2010年；466(7307):707–713.-项目管理咨询公司-公共医学

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