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.2015年6月10日;334(2):283-93.
doi:10.1016/j.yexcr.2015.04.014。 Epub 2015年4月29日。

人类DNA解旋酶B与复制起始蛋白Cdc45相互作用,促进Cdc45与染色质的结合

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人类DNA解旋酶B与复制起始蛋白Cdc45相互作用并促进Cdc45与染色质的结合

珍妮·格哈特等。 Exp单元Res. .

摘要

真核细胞中的染色体DNA复制始于复制起始位点,以G1早期复制前复合物的组装为标志。在G1/S转变时,补充额外的复制起始蛋白可以使DNA聚合酶的起源DNA解链和加载。我们发现,人类DNA解旋酶B(HDHB)的缺失会抑制DNA复制的启动,这表明HDHB在DNA合成的开始中发挥了作用。为了深入了解HDHB在复制起始期间的功能,我们检测了纯化的重组HDHB与关键起始蛋白的物理相互作用。HDHB直接与两个起始因子TopBP1和Cdc45相互作用。此外,我们发现HDHB的N末端和解旋酶结构域都与Cdc45的N末端结合。此外,人类细胞中HDHB的缺失减少了Cdc45与染色质的关联,表明HDHB可能促进人类细胞G1/S处Cdc45的募集。

关键词:Cdc45;DNA复制起始;人类DNA螺旋酶B。

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数字

图1
图1。HDHB-depleted细胞无法启动DNA复制
(A) 顶部;HDHB的功能区。N末端结构域(NTD)未经特征化。中心域(灰色)(残基467-926)包含七个超家族I解旋酶基序。C末端结构域包含一致的CDK磷酸化位点(垂直黑条)和亚细胞定位域(SLD),它们共同构成磷酸化依赖的亚细胞定位结构域(PSLD)[46]。显示了短发夹(sh)RNA shHDHB3和shHDHB4序列的位置。下方:;western blot分析表达shHDHB3、shHDHB4或shNON的U2OS细胞中HDHB的蛋白水平。图表;Western blot通过ImageJ64程序定量,并计算每个细胞系的条带强度百分比。将共表达GFP和shHDHB3或shNON的(B,C)U2OS细胞与BrdU孵育45分钟,用抗BrdU抗体染色,并用间接免疫荧光显微镜和差示干涉对比(DIC)检测。比例尺,15μm。(C) 显示了在两个独立实验中表达shNON(n=82)和shHDHB3(n=78)的BrdU染色细胞的比例。括号表示标准偏差。(D) 同步于G1、S和G2/M的U2OS细胞在固定前与BrdU孵育45分钟,用Mcm3和BrdU特异性抗体染色,并用间接免疫荧光观察。比例尺,15μm。表达shHDHB3或shNON的(E,F)U2OS细胞与BrdU孵育45分钟,用间接免疫荧光法观察BrdU和Mcm3。比例尺,15μm。(F) 在两个独立的实验中测定了(E)中BrdU-、Mcm3/和双阳性细胞的比例。
图2
图2。HDHB与TopBP1和Cdc45相互作用在体外
(A) 使用非免疫大鼠IgG(2、5、8道)或抗HDHB 5c9单克隆抗体(3、6、9道),从杆状病毒感染的昆虫细胞共同表达HDHB和Mcm4、Orc2或TopBP1的提取物中免疫沉淀HDHB。用western blot检测共沉淀蛋白,抗体显示在每个面板的右侧。平行电泳感染仅表达Mcm4(1区)、仅表达Orc2(4区)或同时表达HDHB和TopBP1(7区)的杆状病毒细胞的提取物样品。星号:部分降级的Mcm4(车道1)。(B) 通过SDS-PAGE和考马斯染色观察纯化的细菌表达的Cdc45(1区)、纯化的杆状病毒表达的HDHB(2区)和TopBP1(3区)。在不存在(泳道5、8)或存在纯化的HDHB(泳道6、9)的情况下,将预结合到多克隆HDHB抗体的蛋白A-琼脂糖珠与纯化的TopBP1或Cdc45孵育。TopBP1和Cdc45输入的样本(20%)显示在通道4和7中。用SDS-PAGE和western blot分析沉淀蛋白和指示抗体。
图3
图3。Cdc45的N末端与HDHB的N-和解旋酶结构域发生物理相互作用
(A) 通过SDS-PAGE和考马斯染色测定Ccd45的GST N-(aa 1-303)和C末端(aa 304–566)的表达水平。(B) GST下拉实验;HDHB被添加到Ccd45的GST N-(aa 1–303)和C末端(aa 304–566)。通过SDS-PAGE和western blot分析沉淀蛋白和指示抗体,GST或HDHB抗体。(C) GST下拉实验;HDHB——含有His-tag的N末端(aa 1–393)、解旋酶结构域(aa 394–958)或C端(aa 957–1088)被添加到Cdc45的GST N末端。用SDS-PAGE和western blot分析沉淀蛋白和指示的抗体,无论是His-taq还是GST抗体。
图4
图4。HDHB-depleted细胞中Cdc45染色质负载减少
(A) 如图所示,使用(+)或不使用(−)50μM罗斯柯夫汀(Ros)培养的U2OS细胞与BrdU孵育30分钟,使用标准方案(−SDS)固定和渗透,并用抗BrdU和抗细胞周期素E染色以进行免疫荧光显微镜检查。比例尺,70μm。(B) 培养的U2OS细胞(+或-如图所示)用1%甲醛固定10分钟,用0.1%Triton X-100和0.02%SDS[49,59]萃取,并用抗细胞周期素E和抗Cdc45染色,用于免疫荧光显微镜。(C) 通过计数每种培养物中100个DAPI染色的细胞,测定经+或-罗斯科汀处理并按(B)染色的培养物中Cdc45阳性细胞核的比例。共同表达GFP和shNON或shHDHB3的(D,E)U2OS细胞如(B)所示固定和渗透,并用Mcm3、TopBP1和Cdc45抗体染色。细胞核用DAPI染色。比例尺,15μm。(E) 在两个独立的实验中测定了表达shNON(n=190)或shHDHB3(n=183)的Cdc45阳性细胞的分数。括号表示标准偏差。表达对照(shNON)或HDHB shRNA(shHDHB3和shHDHB4)的(F,G)细胞被分为可溶性(F)和染色质(G)提取物,并用所示抗体进行western blot分析。

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