Genome-Wide Association Study Identifies Novel Loci Associated With Diisocyanate-Induced Occupational Asthma

doi:10.1093/toxsci/kfv084

.2015年7月；146(1):192-201.

doi:10.1093/toxsci/kfv084。 Epub 2015年4月26日。

全基因组关联研究确定与二异氰酸酯诱导的职业性哮喘相关的新位点

附属公司

¹*俄亥俄州辛辛那提辛辛那提大学医学院免疫学、过敏和风湿病系。
²辛辛那提儿童医院医疗中心、自身免疫基因组学和病因学中心以及辛辛那蒂VA医疗中心。
^三*辛辛那提大学医学院免疫、过敏和风湿病科，俄亥俄州辛辛那蒂，辛辛那迪儿童医院医学中心，自身免疫基因组学和病因学中心，辛辛纳提弗吉尼亚州医学中心，辛欣那提儿童医院医疗中心，生物医学信息学和发育生物学科，辛辛那提儿童医院医学中心，人类遗传学部，蒙特利尔蒙特勒大学，圣心医院，加拿大蒙特利尔，拉瓦尔大学，拉瓦尔医院，圣福医院，魁北克省，加拿大，过敏科，吉梅内斯·迪亚斯基金会和CIBER de Enfermedades Respiratias CIBERES，西班牙马德里，过敏科，西班牙马德里La Paz-IdiPAZ医院和CIBER de Enfermedades Respiratias CIBERES，加拿大安大略省多伦多大学，巴塞罗那Vall D’Hebron医院和西班牙马德里CIBER der Enfermeddes Respiratios CIBERES。
⁴辛辛那提儿童医院医学中心、自身免疫基因组学和病原学中心、辛辛那提VA医学中心、辛辛那提儿童医院医学中心、生物医学信息学和发育生物学部门。
⁵辛辛那提儿童医院医学中心人类遗传学部。
⁶加拿大魁北克省蒙特利尔市圣心蒙特勒大学。
⁷加拿大魁北克省圣菲市拉瓦尔大学。
⁸过敏科，Jiménez Díaz基金会和CIBER de Enfermedades呼吸道CIBERES，西班牙马德里。
⁹西班牙马德里La Paz-IdiPAZ医院过敏科和CIBER de Enfermedades呼吸系统CIBERES。
¹⁰加拿大安大略省多伦多市多伦多大学。
¹¹**巴塞罗那Vall D'Hebron医院和西班牙马德里CIBER de Enfermedades呼吸系统医院。
¹²*俄亥俄州辛辛那提市辛辛那蒂大学医学院免疫学、过敏和风湿病科，bernstdd@ucmail.uc.edu。

PMID： 25918132
预防性维修识别码：项目经理4560052
内政部： 10.1093/toxsci/kfv084

全基因组关联研究确定与二异氰酸酯诱导的职业性哮喘相关的新位点

伯兰·尤塞索伊等。毒物科学. 2015年7月.

.2015年7月；146(1):192-201.

doi:10.1093/toxsci/kfv084。 Epub 2015年4月26日。

附属公司

¹*俄亥俄州辛辛那提市辛辛那蒂大学医学院免疫学、过敏症和风湿病学系。
²辛辛那提儿童医院医疗中心、自身免疫基因组学和病因学中心以及辛辛那蒂VA医疗中心。
^三*俄亥俄州辛辛那提辛辛那提大学医学院免疫学、过敏和风湿病系、辛辛那提儿童医院医学中心、自身免疫基因组学和病原学中心和辛辛那提VA医学中心、辛辛那提儿童医院医学中心、生物医学信息学和发育生物学系，辛辛那提儿童医院医学中心，人类遗传学部，蒙特利尔蒙特勒大学，圣心医院，加拿大蒙特利尔，拉瓦尔大学，拉瓦尔医院，圣福医院，魁北克省，加拿大，过敏科，吉梅内斯·迪亚斯基金会和CIBER de Enfermedades Respiratias CIBERES，西班牙马德里，过敏科，西班牙马德里La Paz-IdiPAZ医院和CIBER de Enfermedades Respiratias CIBERES，加拿大安大略省多伦多大学，巴塞罗那Vall D’Hebron医院和西班牙马德里CIBER der Enfermeddes Respiratios CIBERES。
⁴辛辛那提儿童医院医学中心、自身免疫基因组学和病因学中心、辛辛那蒂弗吉尼亚州医学中心、辛欣那提儿童院医学中心、生物医学信息学和发育生物学部。
⁵辛辛那提儿童医院医学中心人类遗传学部。
⁶加拿大魁北克省蒙特利尔市圣心蒙特勒大学。
⁷加拿大魁北克省圣菲市拉瓦尔大学。
⁸过敏科，Jiménez Díaz基金会和CIBER de Enfermedades呼吸道CIBERES，西班牙马德里。
⁹西班牙马德里La Paz-IdiPAZ医院过敏科和CIBER de Enfermedades呼吸系统CIBERES。
¹⁰加拿大安大略省多伦多市多伦多大学。
¹¹**巴塞罗那Vall D'Hebron医院和西班牙马德里CIBER de Enfermedades呼吸系统医院。
¹²*俄亥俄州辛辛那提市辛辛那蒂大学医学院免疫学、过敏和风湿病科，bernstdd@ucmail.uc.edu。

PMID： 25918132
预防性维修识别码：项目经理4560052
内政部： 10.1093/toxsci/kfv084

摘要

二异氰酸酯是用于生产聚氨酯产品的反应性化学品，是职业性哮喘最常见的原因。本研究的目的是使用全基因组关联研究（GWAS）方法鉴定可能导致二异氰酸酯哮喘（DA）发病机制的易感性基因变体。使用Omni-2.5和Omni-5 SNP微阵列对74名接触二异氰酸酯的DA工人和824名健康对照进行了全基因组单核苷酸多态性（SNP）基因分型。我们确定了11个超过全基因组显著性的SNP；相关性最强的是位于15号染色体上的rs12913832 SNP，该SNP已定位到HERC2基因（p=6.94×10（-14））。染色体4和8上ODZ3和CDH17基因附近的SNPs也有很强的相关性（分别为rs908084，p=8.59×10（-9）和rs2514805，p=1.22×10（-8））。我们还对38个具有提示性全基因组显著性的SNPs进行了优先排序（p＜1×10（-6））。其中17个SNP定位于PITPNC1、ACMSD、ZBTB16、ODZ3和CDH17基因座。功能基因组学数据表明，2个暗示性SNP（rs2446823和rs244682）分别位于CCAAT/增强子结合蛋白（CEBP）和肝细胞核因子4α转录因子（TFs）的假定结合位点。本研究将HERC2、CDH17和ODZ3基因的SNP定位为DA的潜在易感位点。通路分析表明，这些基因与抗原处理和呈递以及其他免疫途径有关。2个提示性SNP与可能的TF结合位点的重叠表明可能在基因调控的破坏中起作用。这些结果为DA的遗传结构提供了新的见解，并为未来的功能和机制研究奠定了基础。

关键词：哮喘；二异氰酸酯；遗传多态性；全基因组关联研究。

PubMed免责声明

数字

**图2。**
顶级基因（HERC2、CDH17和ODZ3）之间的交互功能关联网络。网络中基因之间的关系包括共表达、物理和遗传相互作用、途径、共定位、蛋白质域相似性和预测的相互作用。通过删除权重<0.1的所有交互作用来过滤网络.

**图3。**
曼哈顿地块第页从韩国（开放钻石）和高加索（填充圆圈）GWAS研究中获得的值。共有146个SNPs被定位到韩国研究中最热门基因（CTNNA3）所在的10号染色体（以正方形标记）。

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