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.2015年4月10日;6(4):647-652.
doi:10.1039/c4md00512k。 Epub 2015年1月7日。

天然产物brartemicin是巨噬细胞受体分泌物碳水化合物再认识域的高亲和力配体

附属公司

天然产物brartemicin是巨噬细胞受体分泌物碳水化合物再认识域的高亲和力配体

克里斯蒂安·雅各布森等。 Medchemcomm公司. .

摘要

我们证明天然产物brartemicin是一种新发现的癌细胞侵袭抑制剂,是C型凝集素小分子的碳水化合物再认识域(CRD)的高亲和力配体。最近的研究表明,mincle是分枝杆菌毒力因子海藻糖二倍体(TDM)的关键巨噬细胞受体,TDM是分枝杆菌细胞壁的糖脂成分。然而,TDM结合机制、随后的信号转导以及潜在共受体的相互作用仍然存在重大不确定性。由于TDM的脂质性质,功能研究很困难,因此可溶性糜配体具有重要的意义。Brartemicin与本文中提出的设计类似物可作为未来研究水貂的有用分子探针。通过计算研究,我们进一步深入了解了brartemicin的可能结合模式。

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数字

图1
图1。brartemicin和海藻糖-6,6′-二ycolate=TDM的化学结构。显示的TDM侧链为α-霉酸亚类侧链。
图2
图2。与α,α-海藻糖(PDB条目4KZV)共结晶的牛糜的结构。加利福尼亚州2+-初级结合位点中的离子呈洋红色。前面显示了由Leu172、Val173、Val194、Phe197和Phe198组成的疏水槽。
方案1
方案1。brartemicin的合成(1),类似物2–4、和计划免疫-勃拉替米星(5). 有关试剂和条件的详细信息,请参阅ESI。DMF公司=N个,N个-二甲基甲酰胺,Trt-Cl=三氯化三苯,Pyr=吡啶,BnCl=氯化苄,BnBr=溴化苄,DCC=二环己基碳二亚胺,DMAP=4-二甲氨基吡啶,DIAD=偶氮二甲酸二异丙酯,PPh=三苯基膦。
图3
图3。a) brartemicin和类似物抑制甘露糖缀合的血清白蛋白与来自牛糜的CRD结合的数据。K(K) -值(三个独立实验的平均值±标准差)和与α,α-海藻糖的亲和力。b) brartemicin与牛小腿肉对接姿势得分最高的俯视图和侧视图。加利福尼亚州2+是洋红色的。

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