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.2013年11月5日;8(11):e80572。
doi:10.1371/journal.pone.0080572。 2013年电子收集。

转录因子Atf1和Pcr1对裂变酵母细胞外麦芽糖酶Agl1的转录诱导至关重要

附属公司

转录因子Atf1和Pcr1对裂变酵母细胞外麦芽糖酶Agl1的转录诱导至关重要

加藤弘(Hiroaki Kato)等。 公共科学图书馆一号. .

摘要

分裂酵母裂殖酵母(Schizosaccharomyces pombe)分泌胞外麦芽糖酶Agl1,将麦芽糖水解为葡萄糖,从而利用麦芽糖作为碳源。其他麦芽糖酶是否有助于麦芽糖的有效利用,以及Agl1的表达如何响应碳源的转换而被调节,目前尚不清楚。在本研究中,我们表明,有效利用麦芽糖不需要其他三种可能的麦芽糖酶和麦芽糖转运蛋白Sut1。当碳源从葡萄糖转变为麦芽糖时,agl1的转录被诱导。这取决于Atf1和Pcr1,它们是高度保守的转录因子,在各种应激条件下调节应激反应基因。Atf1和Pcr1通常将TGACGT基序作为异二聚体结合。agl1基因缺乏确切的基序,但在其启动子和编码区有许多退化的TGACGT基序。当碳源从葡萄糖转换为麦芽糖时,Atf1和Pcr1与agl1、fbp1和gpx1的启动子和编码区相关,表明Atf1-Pcr1杂合体结合其靶基因中的多种区域以诱导其转录。此外,介体与这些基因的关联依赖于Atf1和Pcr1。这些数据表明,Atf1和Pcr1可诱导agl1的转录,从而有效利用细胞外麦芽糖。

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竞争利益:提交人声明,不存在相互竞争的利益。

数字

图1
图1。高效利用麦芽糖需要Atf1和Pcr1。
(A) 裂变酵母孢子在含有麦芽糖的培养基上生长时无法形成菌落。通配符类型(匹配类型:小时 90)将四分体在YE(含葡萄糖)和YEM(含麦芽糖)平板上解剖,并在30°C下孵育3天。(B)atf1∆pcr1∆突变体在含有麦芽糖的平板上生长缓慢。野生型,atf1∆、和pcr1∆将菌株在含有指示糖的平板上划线,并在30°C下培养3天。(C) 的增长atf1∆百分比1∆突变株在从葡萄糖培养基转换到麦芽糖培养基后不会恢复。将在YE中呈指数增长的指示菌株的细胞清洗两次,再悬浮在YE或YEM中,并在30°C下培养指定的小时数。
图2
图2。Agl1负责高效利用麦芽糖。
(A) 抑制atf1∆pcr1∆相邻菌落在含麦芽糖培养基上的突变体需要agl1基因。在YEM板的中心发现了菌株(如左图所示)温度f1∆pcr1∆细胞已经扩散,并在30°C下孵育3天。(B) 描述相邻野生型菌落如何抑制突变细胞缓慢生长的模型。野生型细胞以依赖Atf1和Pcr1的方式分泌细胞外麦芽糖酶Agl1。Agl1将麦芽糖水解成葡萄糖,然后被相邻的突变细胞吸收和利用。(C) 裂变酵母中四种可能的麦芽糖酶的示意图。指示了糖苷水解酶结构域的位置和每个蛋白质的长度(氨基酸数量)。(D) agl1∆突变体在含有麦芽糖的平板上生长缓慢。将指示菌株划线到含有指示糖的平板上,并在30°C下培养3天。(E) 增长agl1∆突变株在从葡萄糖培养基转换为麦芽糖培养基后不能恢复。将在YE中指数生长的指示菌株的细胞洗涤两次,重悬于YE或YEM中,并在30°C下孵育指示的小时数。(F) 额外删除可能的麦芽糖酶编码基因并不会增强agl1∆YEM板上的电池。将指示的菌株连续稀释,在含有指示糖的平板上斑点,并在30°C下培养5天。注意:在本实验中,野生型细胞不能被发现在同一个平板上,因为它们分泌Agl1,从而影响相邻突变菌落的生长。
图3
图3。Atf1和Pcr1在转录水平上积极调节Agl1的表达。
(A) 的示意图agl1基因轨迹。相对于转录起始点的位置agl1显示。(B) Atf1和Pcr1需要增加agl1将在YE中呈指数增长的指示菌株的细胞清洗两次,再悬浮在YE或YEM中,并在30°C下培养2小时。总RNA用于RT-PCR分析。相对于组成水平的指示基因表达水平行为1在含有麦芽糖的培养基中生长的指示菌株中的基因。显示了与在含葡萄糖培养基中生长的细胞水平相比的折叠变化。(C) RNA聚合酶II和组蛋白H3占位agl1在碳源改变之前和之后。按照(B)所述培养的野生型细胞用于ChIP分析。靶区RNA聚合酶II和组蛋白H3水平agl1(A)中所示的是根据其在行为1Glc:葡萄糖;麦芽糖:麦芽糖;Pol II:RNA聚合酶II*P(P)<0.05, **P(P)<0.01(学生t检验)。(D) RNA聚合酶II在agl1取决于Atf1和Pcr1。按照(B)所述培养所示菌株的细胞,然后用于RNA聚合酶II的ChIP分析。与指示基因相关的RNA聚合酶II水平与动作1在含有麦芽糖的培养基中培养的细胞中。显示了与在含葡萄糖培养基中生长的细胞水平相比的折叠变化。(E) 组蛋白H3占用率下降agl1取决于Atf1。按(B)所述培养所示菌株的细胞,然后按(D)所述用于组蛋白H3的ChIP分析。误差线,s.d.(n=3)。
图4
图4。当碳源从葡萄糖转换为麦芽糖时,Atf1和Pcr1以相互依赖的方式与它们的靶基因结合。
(A) Atf1和Pcr1与agl1在麦芽糖利用细胞中。按照图3B所示培养表达所示蛋白质的细胞,并用于ChIP分析。目标区域的指示蛋白质水平agl1(如图3A所示)根据其在行为1Glc:葡萄糖;麦芽糖:麦芽糖*P(P)<0.05, **P(P)<0.01(学生t检验)。(B) Atf1在agl1基因取决于Pcr1,反之亦然。按照图3B所示培养所示菌株的细胞,并用于ChIP分析。与指示基因相关的指示蛋白质水平相对于与行为1在含有麦芽糖的培养基中培养的细胞中。显示了与在含葡萄糖培养基中生长的细胞水平相比的折叠变化。误差线,s.d.(n=3)。
图5
图5。Med7在碳源从葡萄糖转换为麦芽糖时以依赖Atf1和Pcr1的方式与其靶基因关联。
(A) Med7与agl1在麦芽糖利用细胞中。按照图3B所示培养表达所示蛋白质的细胞,并用于ChIP分析。agl1(如图3A所示)根据行为1Glc:葡萄糖;麦芽糖:麦芽糖*P(P)<0.05, **P(P)<0.01(学生t检验)。(B) Med7入住率增加agl1取决于Atf1和Pcr1。如图3B所示培养指示菌株的细胞,并用于ChIP分析。与指示基因相关的Med7水平相对于与行为1在含有麦芽糖的培养基中培养的细胞中。显示了与在含葡萄糖培养基中生长的细胞水平相比的折叠变化。误差线,s.d.(n=3)。

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这项工作得到了日本教育、文化、体育、科学和技术部向川木康本提供的赠款(#24380056)、JSPS KAKENHI编号24710229以及JST PRESTO项目向加藤弘文提供的赠款的支持。资助者在研究设计、数据收集和分析、决定出版或编写手稿方面没有任何作用。