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元分析
.2013年2月;45(2):145-54。
doi:10.1038/ng.2500。 Epub 2012年12月23日。

全基因组关联分析确定了18个与血清尿酸盐浓度相关的新位点

安娜·科特根 1伊娃·阿尔布雷希特亚历山大·特默尔维罗妮克·维塔特扬·克鲁姆西克克劳迪娅·亨德特马克乔治·皮斯蒂斯丹妮拉·鲁杰罗Conall M O’Seaghdha公司图马斯·哈勒琼阳田中俊彦安德鲁·约翰逊佐尔坦·库塔利克阿尔伯特·V·史密斯朱莉娅·施马克西姆·斯特鲁查林丽塔·P·S·米德尔伯格莫里斯·J·布朗安吉洛·加福尼古拉·皮拉斯图郭丽卡罗琳·海沃德塔季亚纳·泽穆尼克詹妮弗·哈夫曼洛克·延戈赵京华艾斯·德米尔坎玛丽·费托萨刘璇乔瓦尼·马勒巴洛娜·M·洛佩兹皮姆·范德哈斯特李新忠马库斯·克莱伯安德鲁·希克斯伊尔贾·M·诺尔特阿萨·约翰逊费德里科·穆尔吉亚莎拉·H·怀尔德史蒂芬·J·L·巴克约翰·F·佩登阿巴斯·德汉玛丽斯特拉·斯特里阿尔伯特·特内萨瓦西里基·拉古佩尔图沙罗马西莫·曼吉诺琳达·M·罗斯Terho Lehtimäki先生欧文·伍德沃德冈田由纪阿德里安锡克里斯蒂安·米勒克里斯托弗·奥德梅多玛古斯·普库达里娜·扎马拉彼得·卡夫劳拉·弗罗格里吉安·安德里·图恩安妮·格罗特文特高迪·贾坦·吉斯拉森塔马拉B哈里斯Lenore J Launer公司帕特里克·麦卡德尔阿兰·舒尔迪纳埃里克·博温克尔约瑟夫·科雷什海伦娜·施密特迈克尔·沙勒特尼古拉斯·G·马丁格兰特·蒙哥马利久保美昭中村由介田中俊弘帕特里夏·B·门罗尼勒什·萨马尼大卫·R·雅各布斯(David R Jacobs Jr)刘建安(Kiang Liu)皮奥·达达莫希拉·乌利维杰罗姆·罗特布鲁斯·M·普萨蒂彼得·沃伦魏德杰勒德·韦伯苏珊坎贝儿奥利维尔·德维斯特保罗·纳瓦罗伊万娜·科西奇尼古拉斯·哈斯蒂贝弗利·巴尔考菲利普·弗罗格尔塔努·埃斯科安德烈斯·萨卢梅茨Kay Tee Khaw公司克劳迪娅·兰根伯格尼古拉斯·J·沃勒姆亚伦·艾萨克斯阿尔迪·克拉哈张群元Philipp S Wild公司罗德尼·J·斯科特伊丽莎白·霍利迪Elin组织玛格斯·维吉马斯特凡妮娅·班迪内利杰弗里·梅特安东尼奥·卢波伊丽莎白·特拉贝蒂罗塞拉·索利斯安吉拉·迪林伊娃·拉特卡康斯坦丁·斯特劳赫费边·泰斯梅兰妮·沃尔登伯格H-Erich Wichmann公司盖尔·戴维斯艾伦·J·高马塞尔·布伦伯格; 生命线队列研究; 罗纳德·P·斯托克贾斯帕尔·科纳张伟华伯恩哈德·温克尔曼伯恩哈德·奥博姆苏珊·卢卡布伦达·W·佩宁克斯约翰内斯·史密特加里·柯汉普瓦·穆加尔罗伯特·M·普伦奇劳拉·波塔斯伊万娜·佩西科米尔娜·基林詹姆斯·威尔逊艾琳·马特奥·利奇威克·范·吉尔斯特阿努杰·戈尔Halit Ongen公司阿尔伯特·霍夫曼费尔南多·里瓦德内拉安德烈·尤特林登美狄亚-伊姆博登阿诺德·冯·埃卡德斯坦弗朗西斯科·库卡拉米亚·纳加拉贾玛丽亚·格拉齐亚·皮拉斯马蒂亚斯·诺克克劳迪娅·舒曼凯瑟琳·布德弗洛里安·恩斯特苏珊·M·法林顿埃弗罗皮·西奥多拉图英加·普罗科彭科迈克尔·斯图莫尔安蒂·朱拉马库斯·佩罗拉Veikko Salomaa公司So-Youn Shin先生蒂姆·D·斯佩克特辛齐亚萨拉保罗·M·里德克米卡·科宁乔玛·维卡里克里斯蒂安·亨斯滕伯格克里斯托弗·P·纳尔逊; CARDIoGRAM联盟; 图表联合体; ICBP财团; MAGIC财团; 詹姆斯·梅斯基亚迈克尔·A·纳尔斯潘卡杰·夏尔马安德鲁·辛格尔顿Naoyuki Kamatani先生坦尼娅·泽勒米歇尔·伯尼尔约翰·阿提亚玛丽斯·拉恩诺曼·克洛普汉斯·希尔勒斯特凡·克洛伊伯Hyon Choi先生马里奥·皮拉斯图西尔维娅·托尔妮可·M·普罗斯特-亨施亨利·Völzke维尔蒙杜尔·古德纳森阿夫申·帕萨雷霍德·施密特(Reinhold Schmidt)约翰·惠特菲尔德Myriam Fornage公司保罗·加斯帕里尼大卫·S·西斯科维克奥兹伦·波拉舍克哈利·坎贝尔伊戈尔·鲁丹纳比拉·布瓦提亚·纳吉安德烈斯·梅斯帕卢露丝·J·F·卢斯科妮莉亚·范·杜伊恩英格丽德·博雷基路易吉·费鲁奇乔瓦尼·甘巴罗伊恩·杰·迪里布鲁斯·H·R·沃尔芬巴特尔约翰·钱伯斯温弗里德·梅兹彼得·普拉姆斯塔勒哈罗德·斯奈德乌尔夫·吉伦斯坦艾伦·F·赖特Gerjan Navis公司休·沃特金斯杰奎琳·C·M·维特曼塞雷娜·桑纳Sabine Schipf公司马尔科姆·邓洛普安克·特恩杰斯萨穆利·里帕蒂尼科尔·索兰佐丹妮拉·托尼奥洛丹尼尔一世查斯曼奥利·莱塔卡里W H高琳达玛丽娜·丘洛卡罗琳·S·福克斯马克·考菲尔德穆里尔·波楚德(Murielle Bochud)克里斯蒂安·吉格
附属公司
元分析

全基因组关联分析确定了18个与血清尿酸盐浓度相关的新位点

安娜·科特根等。 自然基因. 2013年2月.

摘要

血清尿酸浓度升高会导致痛风,这是一种常见且疼痛的炎症性关节炎。通过结合全球尿酸盐遗传学联合会(GUGC)内140000多名欧洲血统个体的数据,我们鉴定并复制了28个与血清尿酸盐浓度相关的全基因组显著位点(TRIM46、INHBB、SFMBT1、TMEM171、VEGFA、BAZ1B、PRKAG2、STC1、HNF4G、A1CF、ATXN2、UBE2Q2、IGF1R、NFAT5、MAF、HLF、ACVR1B-ACVRL1和B3GNT4中或附近的18个新区域)。在非欧洲血统的个体中,许多基因座的关联程度相似。我们进一步确定了这些位点与痛风、转录表达和尿酸排泄分数的相关性。网络分析表明抑制素-活性素信号通路和糖代谢在系统尿酸盐控制中起作用。血清尿酸盐浓度的新候选基因强调了尿酸盐生成和排泄的代谢控制的重要性,这可能对痛风的治疗和预防有意义。

PubMed免责声明

利益冲突声明

竞争性金融利益

作者声明没有竞争性的经济利益。

数字

图1
图1
多个基因组位点包含与血清尿酸浓度相关的SNP。截短曼哈顿图显示−log10(P(P)根据染色体位置排序的尿酸盐发现GWAS的所有SNP的值)。与SNP最接近且最低的基因P(P)列出了每个位点的值(指数SNP)。灰色的基因座符合一个但不是两个复制标准。蓝色三角形表示含有SNPs的基因座P(P)值低于1×10−25.
图2
图2
所有复制的GWAS基因座的次要等位基因显示出与血清尿酸盐浓度和痛风发生率的方向一致性关联。具有显著性别特异性影响的位点以红色显示。线条对应95%的置信区间。使用痛风的对数比值比(ln(OR))计算皮尔逊相关系数。
图3
图3
SNP对尿酸盐浓度(mg/dl)的影响在欧洲血统、非洲裔美国人、印度人和日本人中相似,而等位基因频率不同。比较复制基因座和满足其中一个复制标准的另外四个基因座的SNP效应。左边,按效应大小排序对每个次要等位基因(定义为欧洲血统的个体)的血清尿酸浓度的影响。对,四个不同样本的等位基因频率比较。如果由于等位基因频率(非多态性,次要等位基因的频率低)或插补质量差的原因而无法提供数据,则没有符号。

中的注释

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引用人

参考文献

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