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元分析
.2012年2月15日;21(4):947-57.
doi:10.1093/hmg/ddr524。 Epub 2011年11月11日。

COPD的全基因组关联研究确定了染色体19q13上的一个易感位点

合作者,附属公司
元分析

COPD的全基因组关联研究确定了染色体19q13上的一个易感位点

迈克尔·H·乔等。 人类分子遗传学. .

摘要

慢性阻塞性肺病(COPD)的遗传危险因素在很大程度上仍不清楚。迄今为止,有限规模的全基因组关联研究(GWAS)已在CHRNA3/CHRNA5/IREB2、HHIP和FAM13A中确定了几个新的COPD风险位点;可以通过更大规模的研究来鉴定额外的基因座。我们对来自四个队列的3499例患者和1922名对照受试者进行了GWAS:COPD纵向评估以确定预测替代终点(ECLIPSE);正常衰老研究(NAS)和国家肺气肿治疗试验(NETT);挪威卑尔根(GenKOLS);和COPDGene研究。在Illumina平台上进行基因分型,使用1000个基因组数据输入其他标记;结果通过固定效应meta分析进行总结。我们在染色体19q13上鉴定了一个新的全基因组显著位点(rs7937,OR=0.74,P=2.9×10(-9))。国际慢性阻塞性肺病遗传网络家庭研究(ICGN)的2859名受试者中,这种单核苷酸多态性(SNP)和另一个连锁不平衡的附近SNP(rs2604894)的基因分型显示出支持性证据,与COPD(rs7937和rs2604894P=0.28和0.11)、支气管扩张剂前FEV(1)相关(P=0.08和0.04)和重度(GOLD 3和4)COPD(P=0.09和0.017)。该区域包括RAB4B、EGLN2、MIA和CYP2A6,此前已确定与吸烟行为相关。

试用注册:临床试验.govNCT00292552号.

PubMed免责声明

数字

图1。
图1。
使用主成分调整遗传祖先后,四队列荟萃分析的分位数-分位数图包括1000个基因组项目插补数据。
图2。
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全基因组显著位点的关联图。R(右)2给出了与最显著、标记和突出显示的SNP相关的值。使用LocusZoom创建的绘图(83)。
图2。
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全基因组显著位点的关联图。R(右)2给出了与最显著、标记和突出显示的SNP相关的值。使用LocusZoom创建的绘图(83)。

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引用人

参考文献

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