Linking long-term dietary patterns with gut microbial enterotypes

doi:10.1126/science.1208344

随机对照试验

.2011年10月7日；334(6052):105-8.

doi:10.1126/science.1208344。 Epub 2011年9月1日。

将长期饮食模式与肠道微生物肠型联系起来

Gary D Wu先生¹, 陈军（Jun Chen）, 克里斯蒂安·霍夫曼, 凯尔·比廷格, 陈英余, 苏·凯尔鲍, Meenakshi Bewtra公司, 丹·奈特, 威廉·A·沃尔特斯, 罗布·奈特, 罗希尼·辛哈, 艾琳·吉尔罗伊, 科尼卡·古普塔, 罗伯特·巴尔达萨诺, 丽莎·内塞尔, 李洪哲, 弗雷德里克·德布什曼, 詹姆斯·D·刘易斯

附属公司

PMID： 21885731
PMCID公司：项目经理3368382
内政部： 10.1126/科学1208344

随机对照试验

将长期饮食模式与肠道微生物肠型联系起来

加里·德·吴等。科学类. 2011.

.2011年10月7日；334(6052):105-8.

doi:10.1126/science.1208344。 Epub 2011年9月1日。

作者

加里·德·吴¹, 陈军（Jun Chen）, 克里斯蒂安·霍夫曼, 凯尔·比廷格, 陈英余, 苏·凯尔鲍, Meenakshi Bewtra公司, 丹·奈特, 威廉·A·沃尔特斯, 罗布·奈特, 罗希尼·辛哈, 艾琳·吉尔罗伊, 科尼卡·古普塔, 罗伯特·巴尔达萨诺, 丽莎·内塞尔, 李洪哲, 弗雷德里克·德布什曼, 詹姆斯·D·刘易斯

附属

¹美国宾夕法尼亚大学佩雷尔曼医学院消化科，宾夕法尼亚州费城，邮编：19104。gdwu@mail.med.upenn.edu

PMID： 21885731
PMCID公司：项目经理3368382
内政部： 10.1126/科学1208344

摘要

饮食严重影响人类健康，部分原因是通过调节肠道微生物组分。我们使用饮食清单和16S rDNA测序对98名患者的粪便样本进行了特征分析。粪便群落聚集成肠型，主要以拟杆菌和普氏菌的水平区分。肠型与长期饮食密切相关，尤其是蛋白质和动物脂肪（拟杆菌）与碳水化合物（普氏菌）。一项对10名受试者进行的控制性喂食研究表明，在开始高脂肪/低纤维或低脂肪/高纤维饮食后24小时内，微生物组分发生了可检测到的变化，但在10天的研究期间，肠道类型保持稳定。因此，替代性肠型状态与长期饮食有关。

PubMed免责声明

数字

图1
横断面COMBO分析中确定的饮食和肠道微生物类群的相关性。列对应于使用16量化的细菌分类群秒rDNA标签；行对应于膳食问卷测量的营养素。红色和蓝色分别表示正关联和负关联。颜色的强度表示分类群丰度和营养成分之间的关联程度，由Spearman相关性测量。细菌门由底部的颜色代码概括；图S1中给出了指定的低级别分类赋值。点表示在25%的FDR下显著的关联。FFQ数据用于此比较（图S1中同时显示了FFQ和Recall膳食数据）。柱和行按欧氏距离聚类，行由主要营养类别分隔。

图2
肠道微生物分类群聚集成肠型与长期饮食有关。(A类)在COMBO横断面研究中使用Jensen-Shannon距离进行聚类。左侧面板显示，数据通过PAM方法最自然地分为两个簇。x轴显示集群编号；y轴表示轮廓宽度，这是衡量簇间距的指标（12）。右侧面板显示了前两个主要组件的集群。(B类)每个肠型特征的细菌分类群比例。方框表示四分位范围（IQR），其中的线表示中间值。晶须表示1.5×IQR内的最低和最高值。(C类)饮食成分与每个肠型的关系。通过标准化营养测量方法测量的每个关联的强度和方向，由右下角的颜色键显示。输入类型显示在右侧。红色表示每个肠型中每种营养素的含量较高，蓝色表示每种营养物质的含量较低（营养素的完整列表见表S2）。柱按欧氏距离进行聚类。

图3
控制喂养期间细菌群落的变化。将10名受试者随机分为高脂肪/低纤维或低脂肪/高纤维饮食，通过测序16对微生物组分进行10天的纵向监测秒rDNA基因标签（CAFE研究）。(A类)使用未加权UniFrac进行基于聚类图的主坐标分析。颜色表示每个个体的样本。(B类)与其他所有日子相比，第1天的样本是异常值，表明在开始控制喂养的24小时内肠道微生物组发生了变化。在该分析中，对两组受试者之间的样本加权UniFrac距离进行了比较。第一次距离收集将第1天的样本与第2天到第10天的样本进行比较；第二组将所有日期的样本与除第1天外的所有其他日期的样本进行比较，表明变化很快(*P（P）*＝0.0003、10000个排列）。误差条表示距离的1 SD。

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中的注释

微生物学。饮食习惯的内脏。
戈夫纳大学。戈夫纳大学。科学。2011年10月7日；334(6052):45-6. doi:10.1126/science.1213799。科学。2011 PMID：21980098 没有可用的摘要。

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