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QIIME允许分析高通量社区测序数据

J格雷戈里·卡波拉索等。 Nat方法. 2010年5月.
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竞争性金融利益作者宣布了竞争性的财务利益：全文HTML版论文的详细信息见http://www.nature.com/naturemethods网站/.

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图1
图1
QIIME分析了常规饲养和常规化小鼠、定植人类粪便肠道微生物群的生菌小鼠（H-小鼠）以及人类成年单卵双胞胎和双卵双胞胎的远端肠道微生物群。(一)小鼠、H-小鼠和双胞胎的主坐标分析图。颜色对应于不同种类和时间点的单独样品，并且在整个面板中保持一致。(b条)人类双胞胎粪便微生物群数据之间的未加权UniFrac距离直方图；H小鼠研究的人类供体；移植后第56天，H小鼠食用低脂（LF）和富含植物多糖（PP）的食物；第1天H小鼠（LF和PP饮食）；和第0天的H-小鼠。分类分类是在类级别上进行的。(c（c）)H-小鼠样本系统发育多样性的α多样性稀疏图。(d日)H-mice时间序列数据的OTU网络连通性。CONV-D，常规小鼠；CONV-R，常规饲养小鼠；和GF，无菌小鼠。
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