A gene wiki for community annotation of gene function

doi:10.1371/journal.pbio.0060175

.2008年7月8日；6（7）：e175。

doi:10.1371/journal.pbio.0060175。

用于基因功能社区注释的基因维基

Jon W Huss第三¹, 卡米洛·奥罗斯科, 古德尔, 吴春雷, 谢尔盖·巴塔洛夫, 蒂姆·J·维克斯, 法拉马兹·瓦拉法, 安德鲁·苏一世

附属公司

PMID： 18613750
预防性维修识别码：项目经理2443188
内政部： 10.1371/期刊.pbio.0060175

用于基因功能社区注释的基因维基

Jon W Huss第三等。公共科学图书馆生物. 2008.

.2008年7月8日；6（7）：e175。

doi:10.1371/journal.pbio.0060175。

作者

Jon W Huss第三¹, 卡米洛·奥罗斯科, 古德尔, 吴春雷, 谢尔盖·巴塔洛夫, 蒂姆·J·维克斯, 法拉马兹·瓦拉法, 安德鲁·苏一世

附属

¹圣地亚哥州立大学生物信息学和医学信息学研究生项目，美国加利福尼亚州圣地亚哥。

PMID： 18613750
预防性维修识别码：项目经理2443188
内政部： 10.1371/期刊.pbio.0060175

摘要

这篇手稿描述了综合基因维基的创建，其中植入了来自公共领域来源的数据，这将支持并鼓励对基因功能进行社区注释。

PubMed免责声明

数字

**图1。维基百科上为ITK基因创建的基因存根示例**
所有基因存根都包含从公共数据库中获取的注释，包括基因组位置、蛋白质结构、解剖基因表达模式和基因功能。

**图2。基因维基影响分析**
（A）对于维基百科中约650个已用结构化注释修订的现有基因页面，添加前后的累积编辑率大致相同。对约7500个新基因页面的编辑速度约为现有页面的10倍，尽管总的来说，这些编辑约占维基百科所有基因页面编辑的一半。（B）当按基因符号搜索时，维基百科的基因页面被谷歌搜索引擎排名很高。大约66%的基因页面位于搜索结果的第一页。（C）基因维基可以在网络表示中进行分析，其中指向其他维基百科页面的超链接构成网络边缘。网络拓扑分析表明，连通性遵循幂律，表示无标度网络。

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