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.2005年10月至12月;2(4):339-54.
doi:10.1109/TCBB.2005.55。

利用零抑制二元决策图从基因表达数据中发现相干双聚类

附属公司

利用零抑制二元决策图从基因表达数据中发现相干双聚类

Sungroh Yoon公司等。 IEEE/ACM Trans-Comput生物信息. 2005年10月至12月.

摘要

当一些基因具有多种功能且实验条件不同时,双聚类方法可以成为一种非常有用的分析工具。这是因为与传统的聚类技术相比,双聚类方法侧重于寻找基因子集和实验条件子集,这些条件共同表现出一致的行为。然而,双聚类问题本质上很难解决,并且寻找具有高相干度的双聚类通常需要花费大量的计算成本。在这项工作中,我们提出了一种新的双聚类算法,该算法利用零抑制二进制决策图(ZBDD)数据结构来应对计算挑战。我们的方法可以找到满足特定输入条件的所有双聚类,并且可以扩展到实际的基因表达数据。我们还提供了实验结果,验证了该方法的有效性。

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