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.2005年1月;6(1):45-58.
doi:10.1093/biostatistics/kxh017。

一种调用阵列CGH数据增益和损耗的方法

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一种调用阵列CGH数据增益和损耗的方法

王培(音译)等。 生物统计学. 2005年1月.

摘要

阵列CGH是一种用于癌症基因组研究的强大技术。它使人们能够对遗传改变的区域进行全基因组筛查,例如染色体增益和丢失,或局部扩增和缺失。本文提出了一种新的算法“沿染色体聚类”(CLAC)来分析阵列CGH数据。CLAC沿着每个染色体臂(或染色体)构建分层聚类风格的树,然后通过将错误发现率(FDR)控制在一定水平来选择“感兴趣”的聚类。此外,它还提供了一组阵列的一致总结,以及相应FDR的估计值。我们使用CLAC在肺癌微阵列CGH数据集以及非整倍体细胞株的BAC阵列CGH数据集上的应用来说明该方法。

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